SZGR2 - Beplay体育中心

概括？

GeneID	3329
象征	HSPD1
Synonyms	cpn60 \| groel \| hld4 \| hsp-60 \| hsp60 \| hsp65 \| hucha60 \| spg13
Description	heat shock protein family D (Hsp60) member 1
Reference	MIM：118190\|HGNC:HGNC:5261\|Ensembl:ENSG00000144381\|HPRD:00318\|Vega：Otthumg00000154463
基因类型	蛋白质编码
Map location	2q33.1
Pascal p-value	7.58E-11
Sherlock p-value	0.591
胎儿β	1.031
主持人	Myers' cis & trans
Support	G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSENSUS G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSUS G2CDB.HUMAN_CLATHRIN G2Cdb.human_mitochondria g2cdb.human_synaptosom G2Cdb.humanPSD G2Cdb.humanPSP COMPOSITESET

数据源中的基因

基因集名称	Method of gene set	Description	信息
CV:PGCnp	Genome-wide Association Study	GWAS
PMID：cooccur	High-throughput literature-search	PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
Literature	High-throughput literature-search	与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症	点击显示详细信息
Network	人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离	PPI网络中最短路径的贡献：0.3026

第一节遗传学和表观遗传学注释

eQTL annotation

SNP ID	染色体	位置	主持人	Gene Entrez ID	QVALUE	EQTL类型
RS12660028	CHR5	74605501	HSPD1	3329	0.18	反式
rs1423526	CHR5	74606172	HSPD1	3329	0.18	反式
RS16920160	CHR8	55308290	HSPD1	3329	0.08	反式
RS10868543	Chr9	89852686	HSPD1	3329	0.01	反式
RS10492782	chr16	13210707	HSPD1	3329	0.04	反式
rs9956108	chr18	3042415	HSPD1	3329	0.2	反式
RS8120542	chr20	24395092	HSPD1	3329	0.01	反式
rs8114637	chr20	24395207	HSPD1	3329	0.01	反式
RS4536719	chr20	24397114	HSPD1	3329	0.07	反式
RS9974024	chr20	24397274	HSPD1	3329	0.01	反式
rs6515493	chr20	24401635	HSPD1	3329	0.01	反式
rs6049703	chr20	24432425	HSPD1	3329	0.01	反式

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

Gene expression during devlopment (BrainCloud)

脚注：
A total of 269 time points ploted, with n=38 fetal samples (x=1:38). Each triangle represents one time point.

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

No co-expressed genes in brain regions

第三节。基因本体论注释

分子功能	去学期	证据	神经关键字	PubMed ID
去：0000166	nucleotide binding	IEA		-
GO:0001530	脂多糖结合	IDA		17164250
去：0002039	p53结合	IPI		18086682
去：0005524	ATP binding	IEA		-
GO:0051082	unfolded protein binding	我知道了		11050098
GO:0051087	伴侣结合	IPI		10205158
GO:0043498	细胞表面结合	IDA		11807771
生物过程	去学期	证据	神经关键字	PubMed ID
GO:0002755	MyD88-dependent toll-like receptor signaling pathway	IDA		16148103
GO:0002842	T细胞介导的对肿瘤细胞的免疫反应的阳性调节	IDA		10663613
去：0002368	B cell cytokine production	IDA		16148103
去：0006986	对展开蛋白的反应	IDA		11050098
GO:0006919	caspase activation	IDA		17823127
去：0043065	凋亡的阳性调节	IMP		17823127
GO:0042100	B细胞增殖	IDA		16148103
去：0043066	negative regulation of apoptosis	IMP		18086682
GO：0050821	protein stabilization	IMP		18086682
GO：0050870	T细胞激活的阳性调节	IDA		16148103\|17164250
GO：0050870	T细胞激活的阳性调节	ISS		-
GO:0042026	蛋白质重折叠	IDA		11050098
GO:0032735	positive regulation of interleukin-12 production	IDA		17164250
GO:0032733	positive regulation of interleukin-10 production	IDA		16148103
GO：0032729	干扰素生产的积极调节	IDA		17164250
GO：0032727	positive regulation of interferon-alpha production	IDA		17164250
GO：0048291	isotype switching to IgG isotypes	IDA		16148103
GO：0032755	白介素6产生的正调节	IDA		16148103
GO:0043032	positive regulation of macrophage activation	IDA		17164250
GO:0044419	interspecies interaction between organisms	IEA		-
Cellular component	去学期	证据	神经关键字	PubMed ID
GO:0005829	细胞质	IDA		18086682
去：0005615	extracellular space	IDA		18229457
去：0005739	mitochondrion	IDA		18086682
去：0005743	mitochondrial inner membrane	IEA		-
去：0005759	线粒体基质	IEA		-
去：0005769	early endosome	IDA		11807771
GO:0009986	cell surface	IDA		9243807
GO:0005905	涂层坑	IDA		11807771
GO：0019907	细胞周期蛋白依赖性蛋白激酶激活激酶全酶复合物	IDA		11445587
GO:0030135	涂层囊泡	IDA		11807771
去：0046696	lipopolysaccharide receptor complex	IDA		17164250

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

互动者	别名b	官方全名b	实验	资源	PubMed ID
ALDH2	aldh-e2 \|Aldhi \|aldm \|MGC1806	aldehyde dehydrogenase 2 family (mitochondrial)	-	HPRD,BioGRID	12387818
bak1	贝克\|类似bak \|bcl2l7 \|CDN1 \|MGC117255 \|MGC3887	Bcl2-Antagonist/杀手1	-	HPRD,BioGRID	12070120
BAX	BCl2L4	BCL2-associated X protein	亲和力捕获 - 韦斯特恩	Biogrid	12070120
CA2	ca-ii \|Caii \|CAR2	碳赤霉素II	-	HPRD,BioGRID	9890926\|10811634
CASP3	CPP32 \|CPP32B \|SCA-1	caspase 3, apoptosis-related cysteine peptidase	-	HPRD,BioGRID	10205158\|10205159
CASP6	MCH2	caspase 6，与凋亡相关的半胱氨酸肽酶	-	HPRD,BioGRID	10205159
CASP9	APAF-3 \| APAF3 \| CASPASE-9c \| ICE-LAP6 \| MCH6	caspase 9, apoptosis-related cysteine peptidase	-	HPRD	11230124
DHFR	-	dihydrofolate reductase	-	HPRD,BioGRID	8559246\|8976559
HDAC1	DKFZp686H12203 \| GON-10 \| HD1 \| RPD3 \| RPD3L1	histone deacetylase 1	亲和力捕获 - 韦斯特恩	Biogrid	11777905
Hist2H2BE	GL105 \| H2B \| H2B.1 \| H2B/q \| H2BFQ \| MGC119802 \| MGC119804 \| MGC129733 \| MGC129734	组蛋白集群2，H2BE	-	HPRD,BioGRID	9724719
HSPE1	CPN10 \|gro \|HSP10	heat shock 10kDa protein 1 (chaperonin 10)	-	HPRD,BioGRID	10205158\|11050098 \|12387818
克拉斯	C-K-RAS \| K-RAS2A \| K-RAS2B \| K-RAS4A \| K-RAS4B \| KI-RAS \| KRAS1 \| KRAS2 \| NS3 \| RASK2	V-KI-RAS2 Kirsten大鼠肉瘤病毒性癌基因同源物	in vivo	Biogrid	11888933
NR3C1	GCCR \|GCR \|gr \|grl	核受体亚科3，C组，成员1（糖皮质激素受体）	两个杂交	Biogrid	10508170
PRNP	ASCR \| CD230 \| CJD \| GSS \| MGC26679 \| PRIP \| PrP \| PrP27-30 \| PrP33-35C \| PrPc \| prion	prion protein	PrPc interacts with HSPD1 (Hsp60). This interaction was modeled on a demonstrated interaction between hamster PrPc and human HSPD1 (Hsp60).	绑定	8676499
RASA1	CM-AVM \| CMAVM \| DKFZp434N071 \| GAP \| PKWS \| RASA \| RASGAP \| p120GAP \| p120RASGAP	RAS p21 protein activator (GTPase activating protein) 1	-	HPRD	1347942
SF3A2	prp11 \|PRPF11 \|SAP62 \|SF3A66	剪接因子3a，亚基2，66KDA	Affinity Capture-MS	Biogrid	12234937

Section V. Pathway annotation

路径名	路径大小	# SZGR 2.0 genes in pathway	信息
KEGG RNA DEGRADATION	59	37	该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG TYPE I DIABETES MELLITUS	44	38	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID MYC ACTIV PATHWAY	79	62	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID TOLL ENDOGENOUS PATHWAY	25	19	该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组线粒体蛋白进口	58	24	该途径中的所有SZGR 2.0基因
蛋白质的反应组代谢	518	242	该途径中的所有SZGR 2.0基因
中村肿瘤区周围与中央DN	634	384	该途径中的所有SZGR 2.0基因
WATANABE RECTAL CANCER RADIOTHERAPY RESPONSIVE DN	92	51	该途径中的所有SZGR 2.0基因
ONKEN UVEAL MELANOMA DN	526	357	该途径中的所有SZGR 2.0基因
GAZDA钻石黑芬贫血红斑dn	493	298	该途径中的所有SZGR 2.0基因
SENGUPTA NASOPHARYNGEAL CARCINOMA WITH LMP1 UP	408	247	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chandran转移Top50上升	38	27	该途径中的所有SZGR 2.0基因
THUM收缩心力衰竭DN	244	147	该途径中的所有SZGR 2.0基因
CASORELLI ACUTE PROMYELOCYTIC LEUKEMIA DN	663	425	该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHOI ATL CHRONIC VS ACUTE DN	18	10	该途径中的所有SZGR 2.0基因
runx1 runx1t1融合单核细胞的TONKS目标	204	140	该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHOU INFLAMMATORY RESPONSE FIMA UP	544	308	该途径中的所有SZGR 2.0基因
KINSEY TARGETS OF EWSR1 FLII FUSION UP	1278	748	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Jaatinen造血干细胞向上	316	190	该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌DN	1375	806	该途径中的所有SZGR 2.0基因
RODRIGUES THYROID CARCINOMA POORLY DIFFERENTIATED UP	633	376	该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌的甲状腺癌间变性	722	443	该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV响应角质形成细胞DN	485	334	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lindgren膀胱癌簇1 DN	378	231	该途径中的所有SZGR 2.0基因
LINDGREN BLADDER CANCER CLUSTER 3 UP	329	196	该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARKEY RB1 ACUTE LOF DN	228	137	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BERENJENO TRANSFORMED BY RHOA UP	536	340	该途径中的所有SZGR 2.0基因
DARWICHE SKIN TUMOR PROMOTER DN	185	115	该途径中的所有SZGR 2.0基因
DARWICHE PAPILLOMA RISK LOW UP	162	104	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Darwiche Papilloma风险高	147	101	该途径中的所有SZGR 2.0基因
darwiche鳞状细胞癌	146	104	该途径中的所有SZGR 2.0基因
LI AMPLIFIED IN LUNG CANCER	178	108	该途径中的所有SZGR 2.0基因
SCHLOSSER MYC TARGETS REPRESSED BY SERUM	159	93	该途径中的所有SZGR 2.0基因
ETS1和SP100 DN的Yordy倒数调节	87	48	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wood EBV EBNA1靶向	110	71	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim Myc放大靶向	201	127	该途径中的所有SZGR 2.0基因
SEMBA FHIT目标	11	7	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC网络	1652	1023	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA CHEK2 PCC网络	779	480	该途径中的所有SZGR 2.0基因
肺癌吸烟者	80	52	该途径中的所有SZGR 2.0基因
GROSS HYPOXIA VIA HIF1A UP	77	49	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BUYTAERT PHOTODYNAMIC THERAPY STRESS UP	811	508	该途径中的所有SZGR 2.0基因
LIU NASOPHARYNGEAL CARCINOMA	70	38	该途径中的所有SZGR 2.0基因
RICKMAN HEAD AND NECK CANCER A	100	63	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath ES 1	379	235	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath MYC带Ebox的目标	230	156	该途径中的所有SZGR 2.0基因
UEDA CENTRAL CLOCK	88	62	该途径中的所有SZGR 2.0基因
MENSSEN MYC TARGETS	53	35	该途径中的所有SZGR 2.0基因
费尔南德斯（Fernandez）由迈克（Myc）约束	182	116	该途径中的所有SZGR 2.0基因
SANA对IFNG DN的回应	85	56	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BYSTRYKH HEMATOPOIESIS STEM CELL QTL TRANS	882	572	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Coller MYC的目标	25	19	该途径中的所有SZGR 2.0基因
弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok dn	546	351	该途径中的所有SZGR 2.0基因
SHIPP DLBCL VS FOLLICULAR LYMPHOMA UP	45	30	该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEI MYB TARGETS	318	215	该途径中的所有SZGR 2.0基因
棕色髓样细胞发育DN	129	86	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BLALOCK ALZHEIMERS DISEASE DN	1237	837	该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗德斯癌元签名	64	47	该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEEN RESPONSE TO ROSIGLITAZONE UP	38	23	该途径中的所有SZGR 2.0基因
伯顿成生成2	72	52	该途径中的所有SZGR 2.0基因
YIH对砷C1的反应	24	14	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bild MYC致癌签名	206	117	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat 6小时DN的响应	911	527	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat 24小时DN的反应	1011	592	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hillion HMGA1目标	90	71	该途径中的所有SZGR 2.0基因
HELLER HDAC TARGETS DN	292	189	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Heller HDAC靶向由甲基化DN沉默	281	179	该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARZEC IL2 SIGNALING UP	115	80	该途径中的所有SZGR 2.0基因
ACEVEDO和H3K27ME3肝癌	295	149	该途径中的所有SZGR 2.0基因
骨骼DN中的Smid乳腺癌复发	315	197	该途径中的所有SZGR 2.0基因
TOYOTA TARGETS OF MIR34B AND MIR34C	463	262	该途径中的所有SZGR 2.0基因
冬季缺氧metagene	242	168	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mueller Plurinet	299	189	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mootha Human Mitodb 6 2002	429	260	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mootha PGC	420	269	该途径中的所有SZGR 2.0基因
MOOTHA MITOCHONDRIA	447	277	该途径中的所有SZGR 2.0基因
HOFFMANN LARGE TO SMALL PRE BII LYMPHOCYTE DN	72	47	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hoffmann小型BII至未成熟B淋巴细胞DN	50	33	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hsiao家政基因	389	245	该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHIANG LIVER CANCER SUBCLASS UNANNOTATED UP	85	50	该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝母细胞瘤上课	605	377	该途径中的所有SZGR 2.0基因
winnepenninckx黑色素瘤转移	162	86	该途径中的所有SZGR 2.0基因
DANG MYC TARGETS UP	143	100	该途径中的所有SZGR 2.0基因
由MYC约束	1103	714	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Karlsson TGFB1靶向	127	78	该途径中的所有SZGR 2.0基因
马滕斯三维诺蛋白响应DN	841	431	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up	756	494	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dutertre雌二醇反应6小时	229	149	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee BMP2靶向DN	882	538	该途径中的所有SZGR 2.0基因
ikeda mir1靶标dn	7	7	该途径中的所有SZGR 2.0基因
ikeda mir30目标dn	27	24	该途径中的所有SZGR 2.0基因
wakabayashi脂肪形成PPARG绑定8D	658	397	该途径中的所有SZGR 2.0基因

Section VI. microRNA annotation

mirna家族	Target position			miRNA ID	mirna seq
mirna家族	UTR开始	UTR结束	匹配方法	miRNA ID	mirna seq
mir-1/206	235	241	M8	hsa-miR-1	UGGAAUGUAAAGAAGUAUGUA
				HSA-MIR-206^SZ	Uggaauguaaggaagugugugg
				hsa-miR-613	AGGAAUGUUCCUUCUUUGCC
miR-382	282	288	1A	HSA-MIR-382^brain	GAAGUUGUUCGUGGUGGAUUCG
mir-421	295	301	1A	hsa-miR-421	ggccucauaauguuguug

SZ：在精神分裂症患者的脑皮质中差异表达的miRNA与使用微阵列进行对照样品进行比较。点击这里to see the list of SZ related miRNAs.
大脑：基于miRNA微阵列表达研究在大脑中表达的miRNA。点击这里查看与大脑相关的miRNA列表。

Gene Page:HSPD1