基因页面:HTR1E
总结吗?
| GeneID | 3354年 |
| 象征 | HTR1E |
| 同义词 | 5-HT1E |
| 描述 | 5 -羟色胺受体1 e |
| 参考 | MIM: 182132|HGNC: HGNC: 5291|运用:ENSG00000168830|HPRD: 01635|织女:OTTHUMG00000015154 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 6 q14-q15 |
| 帕斯卡假定值 | 0.05 |
| 夏洛克假定值 | 0.095 |
| DMG | 1(#研究) |
| eGene | 迈尔斯的顺式和反式 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| ADT: Sun_2012 | 系统的抗精神病药物及其目标的调查 | 共有382个药物协会涉及43个抗精神病药物和49目标基因。 | |
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| DMG: Nishioka_2013 | 全基因组DNA甲基化分析 | 作者研究了DNA的甲基化概要首发精神分裂症患者外周血细胞从18岁(FESZ)和15名正常对照组。 | 1 |
| PMID: cooccur | 高通量文献检索 | 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。 | |
| 文学 | 高通量文献检索 | 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、神经 | 点击显示详细信息 |
| GO_Annotation | neuro-related关键字映射到基因本体论注释 | 支安打与neuro-related关键词:2 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
不同甲基化基因| 探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| cg04278702 | 6 | 87647399 | HTR1E | -0.021 | 0.74 | DMG: Nishioka_2013 |
eQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs733752 | chr12 | 94282971 | HTR1E | 3354年 | 0.2 | 反式 | ||
| rs10777556 | chr12 | 94312090 | HTR1E | 3354年 | 0.06 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
第三部分。基因本体论注释
| 分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0004993 | 5 -羟色胺受体活动 | 助教 | 5 -羟色胺神经递质(术语层面:8) | 1608964 |
| 去:0004872 | 受体的活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005515 | 蛋白结合 | 新闻学会 | 17353931 | |
| 生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0007268 | 突触传递 | 助教 | Synap神经元,神经递质(术语层面:6) | 1608964 |
| 去:0007187 | 蛋白信号耦合环核苷酸的第二信使 | 助教 | 1733778 | |
| 去:0007165 | 信号转导 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0005886 | 等离子体膜 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005887 | 不可或缺的质膜 | 助教 | 1733778 |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| KEGG刺激神经组织的配体受体的相互作用 | 272年 | 195年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME GPCR信号的 | 920年 | 449年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME类A1受体等视紫红质 | 305年 | 177年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME胺配体受体有约束力 | 38 | 33 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME 5 -羟色胺受体 | 12 | 11 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 下游REACTOME GPCR信号 | 805年 | 368年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 我REACTOME Gα信号事件 | 195年 | 114年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME GPCR配体结合 | 408年 | 246年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| PUJANA ATM PCC网络 | 1442年 | 892年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BENPORATH速度的目标 | 1062年 | 725年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 挞挞VS PLASMABLAST浆细胞 | 398年 | 262年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 阿尔茨海默病DN布莱洛克的 | 1237年 | 837年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |