基因页：htr2a
概括？
| 基因 | 3356 |
| 象征 | htr2a |
| 同义词 | 5-HT2A | HTR2 |
| 描述 | 5-羟色胺受体2a |
| 参考 | MIM：182135|HGNC：HGNC：5293|ENSEMBL：ENSG00000102468|HPRD：01638|Vega：Otthumg0000000016881 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 13Q14-Q21 |
| Pascal P值 | 0.54 |
| Sherlock P值 | 0.535 |
| TADA P值 | 0.01 |
| 胎儿β | -2.971 |
| 支持 | GPCR信号传导 COMPOSITESET |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| ADT：SUN_2012 | 系统研究抗精神病药及其靶标 | 共有382个药物目标关联涉及43种抗精神病药和49个靶基因。 | |
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DNM：Fromer_2014 | 整个外显子组测序分析 | 这项研究报道了WES对623个精神分裂症三重奏的研究，该研究使用基因组DNA报告了DNM。 | |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| 协会 | 组合的优势比方法（Sun等。2008），协会研究 | 3 | 链接到Szgene |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关关键字的命中：3 | |
| 网络 | 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 | PPI网络中最短路径的贡献：31 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
DNM表
DNM表| 基因 | 染色体 | 位置 | 参考 | alt | 成绩单 | AA更改 | 突变类型 | 筛 | CG46 | 特征 | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| htr2a | CHR13 | 47409765 | 一个 | C | NM_000621 NM_001165947 |
p.208m> r p.124m> r |
错过 错过 |
精神分裂症 | DNM：Fromer_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| LRPPRC | 0.94 | 0.95 |
| elp3 | 0.93 | 0.92 |
| npepps | 0.93 | 0.93 |
| EIF2AK1 | 0.93 | 0.95 |
| KIAA1012 | 0.93 | 0.93 |
| ppme1 | 0.93 | 0.92 |
| ARMC8 | 0.93 | 0.93 |
| KPNA4 | 0.93 | 0.94 |
| RBBP5 | 0.93 | 0.93 |
| CUL2 | 0.93 | 0.92 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.31 | -0.78 | -0.77 |
| MT-CO2 | -0.77 | -0.77 |
| AF347015.8 | -0.76 | -0.76 |
| AF347015.21 | -0.75 | -0.75 |
| AF347015.2 | -0.75 | -0.74 |
| AF347015.33 | -0.74 | -0.74 |
| higd1b | -0.74 | -0.75 |
| mt-cyb | -0.74 | -0.74 |
| FXYD1 | -0.74 | -0.76 |
| AF347015.27 | -0.73 | -0.74 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0004993 | 5-羟色胺受体活性 | 塔斯 | 5-羟色胺，神经递质（GO期限：8） | 9109547 |
| 去：0004872 | 受体活性 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0007268 | 突触传输 | 塔斯 | 神经元，突触，神经递质（GO期限：6） | 9109547 |
| 去：0007210 | 5-羟色胺受体信号通路 | 塔斯 | 5-羟色胺（GO期限：8） | 9109547 |
| 去：0007165 | 信号转导 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005886 | 质膜 | IEA | - | |
| 去：0005887 | 质膜的积分 | 塔斯 | 9109547 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| kegg钙信号通路 | 178 | 134 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KEGG神经活性配体受体相互作用 | 272 | 195 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| kegg间隙交界处 | 90 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome胃胃CREB信号传导途径通过PKC和MAPK | 205 | 136 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| GPCR的反应组信号传导 | 920 | 449 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome A1级Rhodopsin喜欢受体 | 305 | 177 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组胺配体结合受体 | 38 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组5-羟色胺受体 | 12 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome G alpha Q信号事件 | 184 | 116 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome GPCR下游信号传导 | 805 | 368 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome GPCR配体结合 | 408 | 246 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dierick 5-羟色胺功能基因 | 6 | 6 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pujana ATM PCC网络 | 1442 | 892 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| lu衰老的脑dn | 153 | 120 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿尔茨海默氏病dn | 1237 | 837 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen MCV6 ICP，带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 34 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kim所有疾病Calb1 Corr Up | 548 | 370 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| figueroa aml甲基化簇1 | 125 | 61 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Wang MLL目标 | 289 | 188 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Brideau印迹基因 | 63 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-103/107 | 616 | 622 | 1a | HSA-MIR-103脑 | agcagcauuguacggcuauga |
| HSA-MIR-107脑 | agcagcauuguacgggcuauca | ||||
| mir-26 | 544 | 550 | M8 | HSA-MIR-26A脑 | Uucaaguaauccaggauaggc |
| HSA-MIR-26BSZ | uucaaguaauucaggauagguu | ||||