概括
基因 3359
象征 htr3a
同义词 5-HT-3 | 5-HT3A | 5-HT3R | 5HT3R | HTR3
描述 5-羟色胺受体3A
参考 MIM:182139|HGNC:HGNC:5297|ENSEMBL:ENSG00000166736|HPRD:08917|Vega:Otthumg00000160494
基因类型 蛋白质编码
地图位置 11q23.1
Pascal P值 0.051
胎儿β 0.304
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别
支持 配体门控离子信号传导

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
ADT:SUN_2012 系统研究抗精神病药及其靶标 共有382个药物目标关联涉及43种抗精神病药和49个靶基因。
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
协会 组合的优势比方法(Sun等。2008),协会研究 2 链接到Szgene
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR:0.006
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关关键字的命中:5

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS17167479 CHR7 13779478 htr3a 3359 0.04 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0030594 神经递质受体活性 IEA 神经递质(GO期限:5) -
去:0005232 5-羟色胺激活的阳离子选择性通道活性 塔斯 5-羟色胺(GO期限:11) 7565620
去:0004993 5-羟色胺受体活性 nas 5-羟色胺,神经递质(GO期限:8) -
去:0005216 离子通道活动 IEA -
去:0005230 细胞外配体门控离子通道活性 IEA -
去:0005230 细胞外配体门控离子通道活性 nas -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0007268 突触传输 塔斯 神经元,突触,神经递质(GO期限:6) 7565620
去:0007586 消化 塔斯 7565620
去:0006811 离子运输 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0045211 突触后膜 IEA 突触,神经递质(GO期限:5) -
GO:0045202 突触 IEA 神经元,突触,神经递质,神经胶质(GO期限:2) -
GO:0016021 膜不可或缺 IEA -
去:0005886 质膜 IEA -
去:0005887 质膜的积分 塔斯 7565620
GO:0030054 细胞连接 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
小分子的反应组跨膜转运 413 270 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome离子通道传输 55 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome配体门控离子通道传输 21 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
AKL HTLV1感染DN 68 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV响应表皮增强 293 179 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dairkee Tert目标 380 213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC网络 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pujana ATM PCC网络 1442 892 该途径中的所有SZGR 2.0基因
带有E盒的WEI MYCN目标 795 478 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NUMATA CSF3通过STAT3发出信号传导 22 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Basso CD40信号向上 101 76 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染12小时 111 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染6小时 71 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen IPS LCP带有H3K4Me3 174 100 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen ES LCP带有H3K4Me3 142 80 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马顿人维甲酸的反应 857 456 该途径中的所有SZGR 2.0基因