基因页:htr3a
概括?
基因 | 3359 |
象征 | htr3a |
同义词 | 5-HT-3 | 5-HT3A | 5-HT3R | 5HT3R | HTR3 |
描述 | 5-羟色胺受体3A |
参考 | MIM:182139|HGNC:HGNC:5297|ENSEMBL:ENSG00000166736|HPRD:08917|Vega:Otthumg00000160494 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 11q23.1 |
Pascal P值 | 0.051 |
胎儿β | 0.304 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
支持 | 配体门控离子信号传导 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
ADT:SUN_2012 | 系统研究抗精神病药及其靶标 | 共有382个药物目标关联涉及43种抗精神病药和49个靶基因。 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
协会 | 组合的优势比方法(Sun等。2008),协会研究 | 2 | 链接到Szgene |
GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR:0.006 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关关键字的命中:5 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS17167479 | CHR7 | 13779478 | htr3a | 3359 | 0.04 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/HTR3A_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0030594 | 神经递质受体活性 | IEA | 神经递质(GO期限:5) | - |
去:0005232 | 5-羟色胺激活的阳离子选择性通道活性 | 塔斯 | 5-羟色胺(GO期限:11) | 7565620 |
去:0004993 | 5-羟色胺受体活性 | nas | 5-羟色胺,神经递质(GO期限:8) | - |
去:0005216 | 离子通道活动 | IEA | - | |
去:0005230 | 细胞外配体门控离子通道活性 | IEA | - | |
去:0005230 | 细胞外配体门控离子通道活性 | nas | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0007268 | 突触传输 | 塔斯 | 神经元,突触,神经递质(GO期限:6) | 7565620 |
去:0007586 | 消化 | 塔斯 | 7565620 | |
去:0006811 | 离子运输 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
GO:0045211 | 突触后膜 | IEA | 突触,神经递质(GO期限:5) | - |
GO:0045202 | 突触 | IEA | 神经元,突触,神经递质,神经胶质(GO期限:2) | - |
GO:0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - | |
去:0005886 | 质膜 | IEA | - | |
去:0005887 | 质膜的积分 | 塔斯 | 7565620 | |
GO:0030054 | 细胞连接 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
小分子的反应组跨膜转运 | 413 | 270 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome离子通道传输 | 55 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome配体门控离子通道传输 | 21 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
AKL HTLV1感染DN | 68 | 41 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ENK UV响应表皮增强 | 293 | 179 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dairkee Tert目标 | 380 | 213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pujana ATM PCC网络 | 1442 | 892 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
带有E盒的WEI MYCN目标 | 795 | 478 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NUMATA CSF3通过STAT3发出信号传导 | 22 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Basso CD40信号向上 | 101 | 76 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染12小时 | 111 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染6小时 | 71 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen IPS LCP带有H3K4Me3 | 174 | 100 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen ES LCP带有H3K4Me3 | 142 | 80 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马顿人维甲酸的反应 | 857 | 456 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |