基因页面:HTR6
总结吗?
| GeneID | 3362年 |
| 象征 | HTR6 |
| 同义词 | 5-HT6 | 5-HT6R |
| 描述 | 5 -羟色胺受体6 |
| 参考 | MIM: 601109|HGNC: HGNC: 5301|HPRD: 03066| |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 1 p36-p35 |
| 帕斯卡假定值 | 0.218 |
| 胎儿β | -0.229 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| ADT: Sun_2012 | 系统的抗精神病药物及其目标的调查 | 共有382个药物协会涉及43个抗精神病药物和49目标基因。 | |
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| PMID: cooccur | 高通量文献检索 | 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。 | |
| 协会 | 综合优势比方法(太阳et al . 2008),协会研究 | 1 | 链接到SZGene |
| 文学 | 高通量文献检索 | 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、精神分裂,神经 | 点击显示详细信息 |
| GO_Annotation | neuro-related关键字映射到基因本体论注释 | 支安打与neuro-related关键词:1 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
| 前10名中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| RIC3 | 0.81 | 0.85 |
| PANK2 | 0.79 | 0.77 |
| MAPRE3 | 0.79 | 0.80 |
| PPP2R5B | 0.78 | 0.76 |
| ST3GAL5 | 0.78 | 0.76 |
| PRKACA | 0.78 | 0.78 |
| GLT1D1 | 0.77 | 0.82 |
| OXCT1 | 0.77 | 0.83 |
| UBE2E2 | 0.77 | 0.79 |
| STMN3 | 0.77 | 0.78 |
| 十大负面中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.2 | -0.56 | -0.34 |
| AF347015.21 | -0.56 | -0.33 |
| AF347015.18 | -0.55 | -0.35 |
| AF347015.8 | -0.54 | -0.34 |
| MT-CO2 | -0.52 | -0.33 |
| AF347015.31 | -0.52 | -0.35 |
| AF347015.26 | -0.51 | -0.31 |
| AF347015.15 | -0.51 | -0.32 |
| MT-CYB | -0.51 | -0.32 |
| MT-ATP8 | -0.50 | -0.31 |
第三部分。基因本体论注释
| 分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0004872 | 受体的活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005515 | 蛋白结合 | 新闻学会 | 17189269 | |
| 去:0004969 | 组胺受体的活动 | 助教 | 8522988 | |
| 生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0007268 | 突触传递 | 助教 | Synap神经元,神经递质(术语层面:6) | 8522988 |
| 去:0007187 | 蛋白信号耦合环核苷酸的第二信使 | 助教 | 8522988 | |
| 去:0007165 | 信号转导 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0005886 | 等离子体膜 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005887 | 不可或缺的质膜 | 助教 | 8522988 |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| KEGG钙信号通路 | 178年 | 134年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KEGG刺激神经组织的配体受体的相互作用 | 272年 | 195年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME GPCR信号的 | 920年 | 449年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME类A1受体等视紫红质 | 305年 | 177年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME胺配体受体有约束力 | 38 | 33 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME 5 -羟色胺受体 | 12 | 11 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 下游REACTOME GPCR信号 | 805年 | 368年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME Gα信号事件 | 121年 | 82年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME GPCR配体结合 | 408年 | 246年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 洛佩兹MBD的目标 | 957年 | 597年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BENPORATH SUZ12目标 | 1038年 | 678年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BENPORATH ES与H3K27ME3 | 1118年 | 744年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 沈SMARCA2 DN的目标 | 357年 | 212年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 外邦人紫外线高剂量DN | 312年 | 203年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 外邦人紫外线高剂量 | 25 | 13 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| HILLION HMGA1的目标 | 90年 | 71年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 迈斯纳人大HCP H3K4ME2 | 491年 | 319年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 米凯尔森MCV6 HCP H3K27ME3 | 435年 | 318年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |