基因页：APOB
概括？
| 基因 | 338 |
| 象征 | APOB |
| 同义词 | FLDB | LDLCQ4 | APOB-100 | APOB-48 |
| 描述 | 载脂蛋白b |
| 参考 | MIM：107730|HGNC：HGNC：603|Ensembl：ENSG00000084674|HPRD：00133|Vega：Otthumg0000000090785 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 2P24-P23 |
| Pascal P值 | 0.689 |
| 胎儿β | -0.366 |
| 主持人 | 元 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| VAMP5 | 0.76 | 0.84 |
| C1orf54 | 0.74 | 0.82 |
| GNG11 | 0.69 | 0.70 |
| C1orf61 | 0.69 | 0.72 |
| Metrn | 0.69 | 0.86 |
| AL138743.2 | 0.68 | 0.69 |
| ifi27 | 0.68 | 0.86 |
| AF347015.21 | 0.67 | 0.81 |
| S100A13 | 0.67 | 0.80 |
| IFI27L2 | 0.67 | 0.73 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| add1 | -0.64 | -0.79 |
| VPS52 | -0.63 | -0.57 |
| DDX42 | -0.63 | -0.77 |
| AC119673.2 | -0.62 | -0.67 |
| rabgap1 | -0.62 | -0.75 |
| Rabgef1 | -0.61 | -0.78 |
| eif4enif1 | -0.61 | -0.81 |
| CSRP2BP | -0.61 | -0.71 |
| HNRNPH2 | -0.61 | -0.67 |
| arfgap2 | -0.61 | -0.66 |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
| 互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| BGN | DSPG1 |PG-S1 |PGI |slr1a | 大扫描 | - | HPRD，Biogrid | 12070165 |
| 卡克 | CRT |CTR |Ctr1 | 降钙素受体 | 亲和力捕获-RNA 亲和力捕获 - 韦斯特恩 共同分级 |
Biogrid | 9694898|12397072 |
| 卡尔 | CRT |FLJ26680 |ro |SSA |CC1QR | 钙网蛋白 | - | HPRD，Biogrid | 10513896|12397072 |
| canx | CNX |FLJ26570 |IP90 |P90 | 钙粘蛋白 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 14498830 |
| HSP90AA1 | FLJ31884 | HSP86 | HSP89A |HSP90A | HSP90N | HSPC1 | HSPCA | HSPCAL1 | HSPCAL4 | HSPN | Hsp89 | Hsp90 | LAP2 | 热休克蛋白90KDAα（胞质），A类成员1 | - | HPRD | 11333259 |
| HSP90B1 | ECGP |gp96 |Grp94 |Tra1 | 热休克蛋白90KDAβ（GRP94），成员1 | - | HPRD，Biogrid | 12397072 |
| HSPA1A | FLJ54303 |FLJ54370 |FLJ54392 |FLJ54408 |FLJ75127 |HSP70-1 |HSP70-1A |HSP70I |HSP72 |HSPA1 | HSPA1B | 热休克70KDA蛋白1A | - | HPRD | 9252351 |
| HSPA5 | bip |FLJ26106 |GRP78 |mif2 | 热休克70KDA蛋白5（葡萄糖调节蛋白，78KDA） | - | HPRD | 12397072 |
| HSPA8 | HSC54 |HSC70 |HSC71 |HSP71 |HSP73 |HSPA10 |lap1 |MGC131511 |MGC29929 |NIP71 | 热休克70KDA蛋白8 | - | HPRD | 9694898 |
| ldlr | FH |FHC | 低密度脂蛋白受体 | - | HPRD | 12031600 |
| LIPC | HDLCQ12 |HL |htgl |Liph | 脂肪酶，肝 | - | HPRD，Biogrid | 9685400 |
| LRP2 | DBS |GP330 | 低密度脂蛋白相关蛋白2 | - | HPRD | 10330424 |
| MTTP | ABL |MGC149819 |MGC149820 |MTP | 微粒体甘油三酸酯转移蛋白 | - | HPRD，Biogrid | 9915855|11358959 |
| PDIA4 | ERP70 |ERP72 | 蛋白质二硫化物异构酶家族A，成员4 | - | HPRD，Biogrid | 9694898|12397072 |
| PPIB | CYP-S1 |CYPB |MGC14109 |MGC2224 |scylp | 肽基丙基异构酶B（环磷脂B） | - | HPRD，Biogrid | 12397072 |
| sec61a1 | HSEC61 |sec61 |sec61a | SEC61 Alpha 1亚基（S. cerevisiae） | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 9565615 |
| SEC61A2 | FLJ10578 | Sec61 Alpha 2亚基（S. cerevisiae） | - | HPRD | 9565615 |
| sec61b | - | SEC61β亚基 | - | HPRD，Biogrid | 9565615 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| PID AMB2中性粒细胞途径 | 41 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID HNF3A途径 | 44 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组细胞表面相互作用在血管壁 | 91 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 脂质和脂蛋白的反应组代谢 | 478 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome血小板稳态 | 78 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| LDL的反应组血小板敏化 | 16 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome脂质消化和运输 | 46 | 37 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组止血 | 466 | 331 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组脂蛋白代谢 | 28 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome Chylomicron介导的脂质转运 | 16 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Smirnov在癌症中循环内皮细胞 | 158 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Martoriati MDM4靶向胎儿肝DN | 514 | 319 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath Nanog目标 | 988 | 594 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Iizuka肝癌进展L0 L1 UP | 17 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| HSIAO肝特异性基因 | 244 | 154 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| URS脂肪细胞分化 | 74 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 苏肝 | 55 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lee Calorie限制新皮层DN | 88 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zamora NOS2靶向DN | 96 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿塞维多肝癌DN | 540 | 340 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 肝癌DN中的阿塞维多甲基化 | 940 | 425 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Matzuk精子 | 114 | 77 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yagi AML带8 21易位 | 368 | 247 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yagi AML带有Inv 16易位 | 422 | 277 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 开罗肝脏发展DN | 222 | 141 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kyng Werner综合征和正常衰老 | 93 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pilon KLF1靶向 | 504 | 321 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |