基因页面:FAM19A2
总结吗?
GeneID | 338811年 |
象征 | FAM19A2 |
同义词 | TAFA-2 | TAFA2 |
描述 | 家庭使用序列相似性19(趋化因子(碳碳主题)式),成员A2 |
参考 | HGNC: HGNC: 21589|运用:ENSG00000198673|HPRD: 16876|织女:OTTHUMG00000170207 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 12 q14.1 |
帕斯卡假定值 | 0.132 |
胎儿β | -1.354 |
DMG | 1(#研究) |
eGene | 迈尔斯的顺式和反式 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
DMG: Jaffe_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括2104探针/论文认定与深圳病人(n = 108)比136年控制在Bonferroni-adjusted P < 0.05。 | 1 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
cg03001945 | 12 | 62585579 | FAM19A2 | 4.4 e-9 | -0.014 | 2.6 e-6 | DMG: Jaffe_2016 |
eQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
rs1341306 | chr1 | 18564668 | FAM19A2 | 338811年 | 0.12 | 反式 | ||
rs1503026 | chr18 | 70842605 | FAM19A2 | 338811年 | 0.08 | 反式 | ||
rs12326929 | chr18 | 70864592 | FAM19A2 | 338811年 | 0 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/FAM19A2_DE_GTEx.png)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
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MAYBURD L663536反应 | 29日 | 18 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
道格拉斯BMI1 DN的目标 | 314年 | 188年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
CREIGHTON内分泌治疗抵抗2 | 473年 | 224年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
哈里斯脑癌祖细胞 | 44 | 23 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
迈斯纳大脑HCP H3K4ME3和H3K27ME3 | 1069年 | 729年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
GOBERT少突细胞分化DN | 1080年 | 713年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
ZWANG类1引起的暂时性的EGF | 516年 | 308年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |