基因页：clec4g

概括？
基因 339390
象征 clec4g
同义词 DTTR431 | LP2698 | LSECTIN | UNQ431
描述 C型凝集素域家族4成员G
参考 MIM：616256|HGNC：HGNC：24591|ENSEMBL：ENSG00000182566|HPRD：16721|Vega：Otthumg00000182519
基因类型 蛋白质编码
地图位置 19p13.2
Pascal P值 0.941
胎儿β -1.328
DMG 2（＃研究）
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG：JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 2
DMG：Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 2

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p（dis） beta（dis） fdr（dis） 学习
CG09772661 19 7794952 clec4g 2.03e-5 -0.785 0.016 DMG：Wockner_2014
CG12768640 19 7795428 clec4g 3.91E-10 -0.018 7.56e-7 DMG：JAFFE_2016

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS4653163 CHR1 36627444 clec4g 339390 0.04 反式
RS1954436 CHR1 62248194 clec4g 339390 0.18 反式
RS2816169 CHR1 179210675 clec4g 339390 0.1 反式
RS17022378 CHR1 206654057 clec4g 339390 0.09 反式
RS6753473 CHR2 26526418 clec4g 339390 0.01 反式
RS17021846 CHR2 38243146 clec4g 339390 0.09 反式
RS17028363 CHR2 41913161 clec4g 339390 0.01 反式
RS16829545 CHR2 151977407 clec4g 339390 3.322e-9 反式
RS16841750 CHR2 158288461 clec4g 339390 0.11 反式
RS10183246 CHR2 237187882 clec4g 339390 0.01 反式
RS10195546 CHR2 237187933 clec4g 339390 0.05 反式
RS9810143 CHR3 5060209 clec4g 339390 0 反式
RS6797307 CHR3 8601563 clec4g 339390 5.444e-4 反式
RS662007 CHR4 125253160 clec4g 339390 0.03 反式
RS17008119 CHR4 125321425 clec4g 339390 0.01 反式
RS7692715 CHR4 125335209 clec4g 339390 0 反式
RS17762315 CHR5 76807576 clec4g 339390 0 反式
RS7729096 CHR5 76835927 clec4g 339390 0 反式
RS13360496 0 clec4g 339390 0.01 反式
RS16890367 CHR6 38078448 clec4g 339390 0 反式
RS1511745 CHR6 165954685 clec4g 339390 0.01 反式
RS11965579 CHR6 165969504 clec4g 339390 0.11 反式
RS12706918 CHR7 80266147 clec4g 339390 0.07 反式
RS6996695 CHR8 77540580 clec4g 339390 0.04 反式
RS17124813 Chr10 110347464 clec4g 339390 0.01 反式
RS4980232 Chr10 124577756 clec4g 339390 0.15 反式
RS11025709 Chr11 20745072 clec4g 339390 0.1 反式
RS506698 Chr11 79651244 clec4g 339390 0.03 反式
RS7972699 CHR12 105155290 clec4g 339390 0.02 反式
RS7488439 CHR12 105155814 clec4g 339390 0.01 反式
RS17036489 CHR12 105292283 clec4g 339390 0.02 反式
RS457696 CHR13 32581313 clec4g 339390 0.19 反式
RS9566986 CHR13 32595026 clec4g 339390 0.13 反式
RS7337967 CHR13 53519044 clec4g 339390 0.03 反式
RS7337531 CHR13 109611085 clec4g 339390 0.08 反式
RS16955618 CHR15 29937543 clec4g 339390 4.013e-11 反式
RS17711752 CHR16 34436184 clec4g 339390 0.15 反式
RS16968252 CHR17 31692447 clec4g 339390 0.02 反式
RS11873184 CHR18 1584081 clec4g 339390 0.08 反式
RS1041786 CHR21 22617710 clec4g 339390 0 反式
RS16993189 Chrx 144666166 clec4g 339390 0.1 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23岁）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
Fulcher炎症反应凝集素与LPS 579 346 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素的Graessmann凋亡 1142 669 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graessmann对MC和阿霉素的反应 612 367 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sheth肝癌与TXNIP损失PAM4 261 153 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Suz12目标 1038 678 该途径中的所有SZGR 2.0基因
与H3K27me3的Benporath ES 1118 744 该途径中的所有SZGR 2.0基因
巨噬细胞的库马尔病原体负荷 275 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 1725年 838 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA ECM有关联 171 89 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA女性相关 753 411 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA矩阵 1028 559 该途径中的所有SZGR 2.0基因