基因页:ID3
概括?
基因 | 3399 |
象征 | ID3 |
同义词 | 继承人-1 | BHLHB25 |
描述 | DNA结合3,HLH蛋白的抑制剂 |
参考 | MIM:600277|HGNC:HGNC:5362|ENSEMBL:ENSG00000117318|HPRD:02608|Vega:Otthumg00000003229 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 1p36.13-p36.12 |
Pascal P值 | 0.377 |
Sherlock P值 | 5.53e-5 |
胎儿β | -1.012 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键字的同时存在:精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS993336 | CHR2 | 123302337 | ID3 | 3399 | 0.13 | 反式 | ||
RS6773218 | CHR3 | 80461246 | ID3 | 3399 | 0.04 | 反式 | ||
RS2305164 | CHR12 | 365649 | ID3 | 3399 | 0.02 | 反式 | ||
RS11873703 | CHR18 | 61448702 | ID3 | 3399 | 0.16 | 反式 | ||
RS5768165 | CHR22 | 48318197 | ID3 | 3399 | 0.08 | 反式 | ||
RS5768168 | CHR22 | 48319334 | ID3 | 3399 | 0.08 | 反式 | ||
RS5768173 | CHR22 | 48321475 | ID3 | 3399 | 0.08 | 反式 | ||
RS1197137 | Chrx | 95591388 | ID3 | 3399 | 0.19 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/ID3_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
Glrb | 0.93 | 0.93 |
MAP2K1 | 0.93 | 0.94 |
NAPG | 0.93 | 0.92 |
GHITM | 0.93 | 0.94 |
NSF | 0.93 | 0.95 |
MOAP1 | 0.92 | 0.94 |
ATP1B1 | 0.92 | 0.91 |
B4GALT6 | 0.91 | 0.93 |
NAP1L2 | 0.91 | 0.93 |
EPS15 | 0.91 | 0.92 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
Bcl7c | -0.53 | -0.59 |
NME4 | -0.48 | -0.58 |
SH3BP2 | -0.45 | -0.46 |
透明2 | -0.44 | -0.42 |
SMTN | -0.44 | -0.44 |
SH2D2A | -0.44 | -0.44 |
SEMA4B | -0.44 | -0.38 |
SLC38A5 | -0.44 | -0.48 |
SH2B2 | -0.43 | -0.43 |
mutyh | -0.43 | -0.44 |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
add1 | adda |MGC3339 |MGC44427 | adducin 1(alpha) | 重构的复合物 | Biogrid | 10585876 |
ELSPBP1 | E12 |HE12 | 附子精子结合蛋白1 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 两个杂交 |
Biogrid | 9242638 |
GTF2A1L | alf |MGC26254 | 一般转录因子IIA,1类 | - | HPRD | 8759016 |
ID3 | 继承人1 |BHLHB25 | DNA结合3的抑制剂,显性负螺旋 - 环螺旋蛋白 | - | HPRD | 8645731 |
myf5 | BHLHC2 | 肌源性因子5 | - | HPRD,Biogrid | 9242638 |
myf6 | MRF4 |BHLHC4 | 肌原因子6(巨蛋白) | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 9242638 |
myod1 | myf3 |Myod |PUM |BHLHC1 | 肌源分化1 | - | HPRD,Biogrid | 8759016|9242638 |
PAX5 | BSAP | 配对框5 | - | HPRD,Biogrid | 12054881 |
SREBF1 | SREBP-1C |SREBP1 |BHLHD1 | 固醇调节元件结合转录因子1 | - | HPRD | 10585876 |
TCF12 | heb |HTF4 |HST17266 |BHLHB20 | 转录因子12 | 两个杂交 | Biogrid | 9242638 |
TCF3 | e2a |itf1 |MGC129647 |MGC129648 |BHLHB21 | 转录因子3(E2A免疫球蛋白增强子结合因子E12/E47) | - | HPRD | 8759016|9525934 |
TCF3 | e2a |itf1 |MGC129647 |MGC129648 |BHLHB21 | 转录因子3(E2A免疫球蛋白增强子结合因子E12/E47) | 重构的复合物 两个杂交 |
Biogrid | 9242638|9525934 |
TCF4 | E2-2 |itf2 |MGC149723 |MGC149724 |pths |sef2 |sef2-1 |SEF2-1A |sef2-1b |BHLHB19 | 转录因子4 | - | HPRD,Biogrid | 8999959 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
kegg tgf beta信号通路 | 86 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PAX FOXO1融合的Davicioni目标 | 255 | 177 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HOOI ST7靶向 | 94 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NUP98 HOXA9 Fusion 10D DN的Takeda目标 | 142 | 90 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hummel Burkitts淋巴瘤 | 43 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nagashima NRG1信号向上发出 | 176 | 123 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nagashima EGF信号向上 | 58 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Morosetti facioscapulohumeral肌肉分散 | 20 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
冷吉非替尼抵抗 | 85 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ENK UV响应表皮DN | 508 | 354 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甲状腺癌DN | 232 | 154 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
chiaradonna肿瘤转化Kras DN | 142 | 95 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿霉素DN的Graessmann凋亡 | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Berenjeno由Rhoa DN转变 | 394 | 258 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
汇款皮肤伤口 | 10 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
riz红细胞分化6小时 | 40 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dauer Stat3靶向DN | 50 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dacosta低剂量紫外线反应通过ERCC3 XPCS DN | 9 | 6 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN | 855 | 609 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dacosta UV响应通过ERCC3公共DN | 483 | 336 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dirmeier LMP1响应晚期DN | 32 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Amundson对砷的回应 | 217 | 143 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
温曼对缺氧的适应 | 29 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
温曼对缺氧DN的适应 | 41 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SASAI对肿瘤转移的耐药性 | 50 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
furukawa dusp6靶向pci35 | 74 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Buytaert光动力疗法应力DN | 637 | 377 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wotton Runx目标DN | 29 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schaeffer前列腺开发6小时DN | 514 | 330 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schaeffer前列腺开发48小时 | 487 | 286 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GC期DN的pasqualucci淋巴瘤 | 165 | 104 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath MYC带Ebox的目标 | 230 | 156 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿米特血清反应120 MCF10A | 65 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shin B细胞淋巴瘤簇6 | 11 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mori小型BII淋巴细胞DN | 76 | 52 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mori成熟B淋巴细胞向上 | 90 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
克莱因原发性积液淋巴瘤DN | 58 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
贝克莫昔芬的抵抗 | 50 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Peart HDAC增殖集群 | 57 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
brocke凋亡由IL6逆转 | 144 | 98 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
费尔南德斯(Fernandez)由迈克(Myc)约束 | 182 | 116 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Haddad T淋巴细胞和NK祖细胞 | 78 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FAELT B CLL与VH重新排列 | 48 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ferrando T与MLL融合一起 | 87 | 67 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
松本自然杀手差分 | 475 | 313 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HADDAD B淋巴细胞祖细胞 | 293 | 193 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GERY CEBP目标 | 126 | 90 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
巴索CD40信号传导DN | 68 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Xu Crebbp目标DN | 44 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sesto对UV C8的反应 | 72 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
牙肺纹状横纹肌肉瘤DN | 408 | 274 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由组蛋白乙酰化调节的玛丽亚达森 | 83 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
dazard对UV SCC DN的响应 | 123 | 86 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chiba对TSA的反应 | 50 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Aprelikova BRCA1目标 | 49 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gajate对Trabectedin DN的响应 | 19 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ehrlich ICF综合症DN | 15 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
外邦紫外线高剂量DN | 312 | 203 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hendricks Smarca4靶向DN | 53 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伯顿成年时期峰值2小时 | 51 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伯顿成生成1 | 33 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Liu Smarca4目标 | 64 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Xu GH1自分泌目标 | 268 | 157 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
外邦响应集群D3 | 61 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
DASU IL6信号疤痕DN | 16 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伯顿成生成9 | 92 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hillion HMGA1目标 | 90 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hillion HMGA1B目标 | 92 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lein星形胶质细胞标记 | 42 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sansom Wnt途径需要MYC | 58 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
促进耐受巨噬细胞 | 156 | 92 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gautschi SRC信号传导 | 8 | 6 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mitsiades对aplidin的反应 | 439 | 257 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smid乳腺癌正常 | 476 | 285 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bochkis foxa2目标 | 425 | 261 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
等级结肠与直肠癌DN | 56 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
VART KSHV感染血管生成标记DN | 138 | 92 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boylan多发性骨髓瘤C D | 139 | 95 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chang Core血清反应 | 212 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甜肺癌Kras DN | 435 | 289 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
4EBP1和4EBP2的COLINA目标 | 356 | 214 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen多能国家DN | 8 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 1069 | 729 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zhan早期分化基因dn | 42 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yagi AML带有Inv 16易位 | 422 | 277 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kobayashi EGFR信号24小时 | 101 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hoshida肝癌亚类S1 | 237 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
开罗肝脏开发 | 166 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gutierrez慢性淋巴细胞性白血病DN | 56 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由MYC DN监管 | 253 | 192 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
dang myc针对DN | 31 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由MYC约束 | 1103 | 714 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
YAO对孕酮簇1的时间反应1 | 68 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Karlsson TGFB1靶向DN | 207 | 139 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dutertre雌二醇反应24小时DN | 505 | 328 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Johnstone Parvb目标3 DN | 918 | 550 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee BMP2靶向DN | 882 | 538 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kuwano RNA稳定 | 7 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Alfano MYC目标 | 239 | 156 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
通过p38部分的phong TNF响应 | 160 | 106 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smirnov对IR 6小时的回应 | 166 | 97 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
WARTERS对IR皮肤的反应 | 83 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang击倒第二个EGF脉冲 | 293 | 119 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 | 1839年 | 928 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |