概括
基因 3399
象征 ID3
同义词 继承人-1 | BHLHB25
描述 DNA结合3,HLH蛋白的抑制剂
参考 MIM:600277|HGNC:HGNC:5362|ENSEMBL:ENSG00000117318|HPRD:02608|Vega:Otthumg00000003229
基因类型 蛋白质编码
地图位置 1p36.13-p36.12
Pascal P值 0.377
Sherlock P值 5.53e-5
胎儿β -1.012
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键字的同时存在:精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS993336 CHR2 123302337 ID3 3399 0.13 反式
RS6773218 CHR3 80461246 ID3 3399 0.04 反式
RS2305164 CHR12 365649 ID3 3399 0.02 反式
RS11873703 CHR18 61448702 ID3 3399 0.16 反式
RS5768165 CHR22 48318197 ID3 3399 0.08 反式
RS5768168 CHR22 48319334 ID3 3399 0.08 反式
RS5768173 CHR22 48321475 ID3 3399 0.08 反式
RS1197137 Chrx 95591388 ID3 3399 0.19 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
Glrb 0.93 0.93
MAP2K1 0.93 0.94
NAPG 0.93 0.92
GHITM 0.93 0.94
NSF 0.93 0.95
MOAP1 0.92 0.94
ATP1B1 0.92 0.91
B4GALT6 0.91 0.93
NAP1L2 0.91 0.93
EPS15 0.91 0.92
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
Bcl7c -0.53 -0.59
NME4 -0.48 -0.58
SH3BP2 -0.45 -0.46
透明2 -0.44 -0.42
SMTN -0.44 -0.44
SH2D2A -0.44 -0.44
SEMA4B -0.44 -0.38
SLC38A5 -0.44 -0.48
SH2B2 -0.43 -0.43
mutyh -0.43 -0.44

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

互动者 别名b 官方全名b 实验 资源 PubMed ID
add1 adda |MGC3339 |MGC44427 adducin 1(alpha) 重构的复合物 Biogrid 10585876
ELSPBP1 E12 |HE12 附子精子结合蛋白1 亲和力捕获 - 韦斯特恩
两个杂交
Biogrid 9242638
GTF2A1L alf |MGC26254 一般转录因子IIA,1类 - HPRD 8759016
ID3 继承人1 |BHLHB25 DNA结合3的抑制剂,显性负螺旋 - 环螺旋蛋白 - HPRD 8645731
myf5 BHLHC2 肌源性因子5 - HPRD,Biogrid 9242638
myf6 MRF4 |BHLHC4 肌原因子6(巨蛋白) 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 9242638
myod1 myf3 |Myod |PUM |BHLHC1 肌源分化1 - HPRD,Biogrid 8759016|9242638
PAX5 BSAP 配对框5 - HPRD,Biogrid 12054881
SREBF1 SREBP-1C |SREBP1 |BHLHD1 固醇调节元件结合转录因子1 - HPRD 10585876
TCF12 heb |HTF4 |HST17266 |BHLHB20 转录因子12 两个杂交 Biogrid 9242638
TCF3 e2a |itf1 |MGC129647 |MGC129648 |BHLHB21 转录因子3(E2A免疫球蛋白增强子结合因子E12/E47) - HPRD 8759016|9525934
TCF3 e2a |itf1 |MGC129647 |MGC129648 |BHLHB21 转录因子3(E2A免疫球蛋白增强子结合因子E12/E47) 重构的复合物
两个杂交
Biogrid 9242638|9525934
TCF4 E2-2 |itf2 |MGC149723 |MGC149724 |pths |sef2 |sef2-1 |SEF2-1A |sef2-1b |BHLHB19 转录因子4 - HPRD,Biogrid 8999959


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg tgf beta信号通路 86 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PAX FOXO1融合的Davicioni目标 255 177 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HOOI ST7靶向 94 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NUP98 HOXA9 Fusion 10D DN的Takeda目标 142 90 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hummel Burkitts淋巴瘤 43 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nagashima NRG1信号向上发出 176 123 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nagashima EGF信号向上 58 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Morosetti facioscapulohumeral肌肉分散 20 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
冷吉非替尼抵抗 85 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV响应表皮DN 508 354 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌DN 232 154 该途径中的所有SZGR 2.0基因
chiaradonna肿瘤转化Kras DN 142 95 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素DN的Graessmann凋亡 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Berenjeno由Rhoa DN转变 394 258 该途径中的所有SZGR 2.0基因
汇款皮肤伤口 10 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
riz红细胞分化6小时 40 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dauer Stat3靶向DN 50 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta低剂量紫外线反应通过ERCC3 XPCS DN 9 6 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN 855 609 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3公共DN 483 336 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dirmeier LMP1响应晚期DN 32 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Amundson对砷的回应 217 143 该途径中的所有SZGR 2.0基因
温曼对缺氧的适应 29 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
温曼对缺氧DN的适应 41 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SASAI对肿瘤转移的耐药性 50 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
furukawa dusp6靶向pci35 74 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Buytaert光动力疗法应力DN 637 377 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wotton Runx目标DN 29 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer前列腺开发6小时DN 514 330 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer前列腺开发48小时 487 286 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GC期DN的pasqualucci淋巴瘤 165 104 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath MYC带Ebox的目标 230 156 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿米特血清反应120 MCF10A 65 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shin B细胞淋巴瘤簇6 11 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mori小型BII淋巴细胞DN 76 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mori成熟B淋巴细胞向上 90 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
克莱因原发性积液淋巴瘤DN 58 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因
贝克莫昔芬的抵抗 50 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Peart HDAC增殖集群 57 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
brocke凋亡由IL6逆转 144 98 该途径中的所有SZGR 2.0基因
费尔南德斯(Fernandez)由迈克(Myc)约束 182 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Haddad T淋巴细胞和NK祖细胞 78 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FAELT B CLL与VH重新排列 48 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ferrando T与MLL融合一起 87 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
松本自然杀手差分 475 313 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HADDAD B淋巴细胞祖细胞 293 193 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GERY CEBP目标 126 90 该途径中的所有SZGR 2.0基因
巴索CD40信号传导DN 68 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Xu Crebbp目标DN 44 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sesto对UV C8的反应 72 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
牙肺纹状横纹肌肉瘤DN 408 274 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由组蛋白乙酰化调节的玛丽亚达森 83 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
dazard对UV SCC DN的响应 123 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chiba对TSA的反应 50 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Aprelikova BRCA1目标 49 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gajate对Trabectedin DN的响应 19 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ehrlich ICF综合症DN 15 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
外邦紫外线高剂量DN 312 203 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hendricks Smarca4靶向DN 53 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伯顿成年时期峰值2小时 51 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伯顿成生成1 33 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Liu Smarca4目标 64 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Xu GH1自分泌目标 268 157 该途径中的所有SZGR 2.0基因
外邦响应集群D3 61 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DASU IL6信号疤痕DN 16 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伯顿成生成9 92 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hillion HMGA1目标 90 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hillion HMGA1B目标 92 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lein星形胶质细胞标记 42 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sansom Wnt途径需要MYC 58 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
促进耐受巨噬细胞 156 92 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gautschi SRC信号传导 8 6 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mitsiades对aplidin的反应 439 257 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌正常 476 285 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bochkis foxa2目标 425 261 该途径中的所有SZGR 2.0基因
等级结肠与直肠癌DN 56 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
VART KSHV感染血管生成标记DN 138 92 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boylan多发性骨髓瘤C D 139 95 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chang Core血清反应 212 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甜肺癌Kras DN 435 289 该途径中的所有SZGR 2.0基因
4EBP1和4EBP2的COLINA目标 356 214 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen多能国家DN 8 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 1069 729 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhan早期分化基因dn 42 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yagi AML带有Inv 16易位 422 277 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kobayashi EGFR信号24小时 101 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hoshida肝癌亚类S1 237 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝脏开发 166 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gutierrez慢性淋巴细胞性白血病DN 56 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由MYC DN监管 253 192 该途径中的所有SZGR 2.0基因
dang myc针对DN 31 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由MYC约束 1103 714 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO对孕酮簇1的时间反应1 68 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Karlsson TGFB1靶向DN 207 139 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dutertre雌二醇反应24小时DN 505 328 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Johnstone Parvb目标3 DN 918 550 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee BMP2靶向DN 882 538 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kuwano RNA稳定 7 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Alfano MYC目标 239 156 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过p38部分的phong TNF响应 160 106 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smirnov对IR 6小时的回应 166 97 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WARTERS对IR皮肤的反应 83 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang击倒第二个EGF脉冲 293 119 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 1839年 928 该途径中的所有SZGR 2.0基因