基因页：mylk4
概括？
| 基因 | 340156 |
| 象征 | mylk4 |
| 同义词 | SGK085 |
| 描述 | 肌球蛋白轻链激酶家庭成员4 |
| 参考 | HGNC：HGNC：27972|Ensembl：ENSG00000145949|HPRD：17355|Vega：Otthumg0000000014121 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 6p25.2 |
| Pascal P值 | 0.535 |
| 胎儿β | 0.193 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 小脑半球 小脑 元 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| CV：GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG01748414 | 6 | 2698014 | mylk4 | 6.44e-5 | -0.63 | 0.024 | DMG：Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0000166 | 核苷酸结合 | IEA | - | |
| 去：0005524 | ATP结合 | IEA | - | |
| 去：0004674 | 蛋白质丝氨酸/苏氨酸激酶活性 | IEA | - | |
| GO：0016740 | 转移酶活性 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0006468 | 蛋白氨基酸磷酸化 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 周炎性反应lps up | 431 | 237 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kuninger IGF1与PDGFB的目标 | 82 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 陈代谢综合征网络 | 1210 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-15/16/195/424/497 | 44 | 50 | M8 | HSA-MIR-15A脑 | uagcagcacauaugguugug |
| HSA-MIR-16脑 | uagcagcacguaaauauuggcg | ||||
| HSA-MIR-15B脑 | uagcagcacaucaugguuaca | ||||
| HSA-MIR-195SZ | uagcagaaaaauauuggc | ||||
| HSA-MIR-424 | Cagcagcaauucauguuuugaa | ||||
| HSA-MIR-497 | cagcagcacacuguguuugu | ||||
| HSA-MIR-15A脑 | uagcagcacauaugguugug | ||||
| HSA-MIR-16脑 | uagcagcacguaaauauuggcg | ||||
| HSA-MIR-15B脑 | uagcagcacaucaugguuaca | ||||
| HSA-MIR-195SZ | uagcagaaaaauauuggc | ||||
| HSA-MIR-424 | Cagcagcaauucauguuuugaa | ||||
| HSA-MIR-497 | cagcagcacacuguguuugu | ||||
| mir-26 | 147 | 153 | 1a | HSA-MIR-26A脑 | Uucaaguaauccaggauaggc |
| HSA-MIR-26BSZ | uucaaguaauucaggauagguu | ||||
| mir-369-3p | 4230 | 4237 | 1A，M8 | HSA-MIR-369-3P | aauauacaugguugaucuuu |
| mir-494 | 253 | 259 | M8 | HSA-MIR-494脑 | ugaaacauacgggaaaccucuu |