基因页面:CYP26C1
总结吗?
GeneID | 340665年 |
象征 | CYP26C1 |
同义词 | FFDD4 |
描述 | 细胞色素P450家庭26亚C成员1 |
参考 | MIM: 608428|HGNC: HGNC: 20577|运用:ENSG00000187553|HPRD: 12230|织女:OTTHUMG00000018766 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 10 q23.33 |
帕斯卡假定值 | 0.131 |
eGene | 额叶皮质BA9 迈尔斯的顺式和反式 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
PMID: cooccur | 高通量文献检索 | 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。 | |
文学 | 高通量文献检索 | 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、精神分裂症患者,神经 | 点击显示详细信息 |
GO_Annotation | neuro-related关键字映射到基因本体论注释 | 支安打与neuro-related关键词:1 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
eQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
rs443832 | chr16 | 83779643 | CYP26C1 | 340665年 | 0.18 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/CYP26C1_DE_GTEx.png)
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
第三部分。基因本体论注释
分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0001972 | 视黄酸绑定 | 艾达 | 14532297 | |
去:0005506 | 铁离子结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0004497 | 单氧酶活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0020037 | 血红素结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0008401 | 视黄酸4-hydroxylase活动 | 艾达 | 14532297 | |
去:0009055 | 电子载体活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0046872 | 金属离子结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
去:0007417 | 中枢神经系统开发 | 国际空间站 | 大脑(术语层面:6) | - - - - - - |
去:0009952 | 前/后形成模式 | 国际空间站 | - - - - - - | |
去:0014032 | 神经嵴细胞的发展 | 国际空间站 | - - - - - - | |
去:0048387 | 负调节视黄酸受体信号通路 | NAS | 14532297 | |
去:0048284 | 细胞器融合 | 国际空间站 | - - - - - - | |
去:0034653 | 视黄酸分解过程 | 艾达 | 14532297 | |
去:0055114 | 氧化还原 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
去:0005792 | 微粒体 | 艾达 | 14532297 | |
去:0016020 | 膜 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0016021 | 不可或缺的膜 | 国际能源机构 | - - - - - - |
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG视黄醇新陈代谢 | 64年 | 37 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME生物氧化反应 | 139年 | 91年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME安排的细胞色素P450衬底类型 | 51 | 34 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME PHASE1功能化的化合物 | 70年 | 50 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BENPORATH SUZ12目标 | 1038年 | 678年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BENPORATH速度的目标 | 1062年 | 725年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BENPORATH ES与H3K27ME3 | 1118年 | 744年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BENPORATH PRC2目标 | 652年 | 441年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
马顿斯维甲酸反应了 | 857年 | 456年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
菲格罗亚AML甲基化集群1 | 125年 | 61年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
菲格罗亚AML甲基化集群2 | 54 | 31日 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
菲格罗亚AML甲基化集群3 | 170年 | 97年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
菲格罗亚AML甲基化集群4 | 112年 | 64年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
菲格罗亚AML甲基化集群6 | 140年 | 81年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
菲格罗亚AML甲基化集群7 | 118年 | 68年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |