总结吗?
GeneID 341359年
象征 SYT10
同义词 - - - - - -
描述 synaptotagmin 10
参考 HGNC: HGNC: 19266|HPRD: 15460|
基因型 蛋白质编码
地图上的位置 12 p11.1
帕斯卡假定值 0.733
胎儿β -0.543
DMG 1(#研究)
eGene 迈尔斯的顺式和反式

基因数据来源
基因集名称 基因的方法设置 描述 信息
简历:PGCnp 全基因组关联研究 GWAS
DMG: Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 1
GO_Annotation neuro-related关键字映射到基因本体论注释 支安打与neuro-related关键词:1

部分即遗传学和表观遗传学注释

@不同甲基化基因

探针 染色体 位置 最近的基因 P (dis) β(dis) 罗斯福(dis) 研究
cg10658542 12 33592642 SYT10 4.171的军医 -0.388 0.044 DMG: Wockner_2014

@eQTL注释

SNP ID 染色体 位置 eGene 基因Entrez ID pvalue qvalue TSS距离 eQTL类型
rs16920533 chr12 33180150 SYT10 341359年 0.12 独联体

第二部分。转录组注释

通用基因表达(GTEx)

不可用

基因表达在发展脉络(BrainCloud)

补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。

基因表达的时空变化(BrainSpan)

补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。

没有大脑中的基因区域


第三部分。基因本体论注释

分子功能 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0005509 钙离子结合 国际能源机构 - - - - - -
去:0005215 运输活动 国际能源机构 - - - - - -
生物过程 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0006810 运输 国际能源机构 - - - - - -
蜂窝组件 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0008021 突触囊泡 国际能源机构 Synap,神经递质(术语层面:12) - - - - - -
去:0045202 突触 国际能源机构 Synap神经元,神经递质,神经胶质(术语层面:2) - - - - - -
去:0016020 国际能源机构 - - - - - -
去:0016021 不可或缺的膜 国际能源机构 - - - - - -
去:0030054 细胞结 国际能源机构 - - - - - -
去:0031410 胞质囊泡 国际能源机构 - - - - - -

部分诉通路注释

路径名称 通道尺寸 # SZGR 2.0基因通路 信息
HATADA甲基化在肺癌 390年 236年 所有SZGR 2.0基因通路
BENPORATH SUZ12目标 1038年 678年 所有SZGR 2.0基因通路
BENPORATH速度的目标 1062年 725年 所有SZGR 2.0基因通路
米凯尔森MCV6 HCP H3K27ME3 435年 318年 所有SZGR 2.0基因通路
米凯尔森MEF HCP H3K27ME3 590年 403年 所有SZGR 2.0基因通路
BILANGES血清敏感基因 90年 54 所有SZGR 2.0基因通路
BILANGES血清反应翻译 37 20. 所有SZGR 2.0基因通路
ACEVEDO DN FGFR1在前列腺癌的目标模型 308年 187年 所有SZGR 2.0基因通路
ZWANG仅由二EGF脉冲瞬变 1725年 838年 所有SZGR 2.0基因通路

部分VI. microRNA注释

microrna的家庭 目标位置 microrna的ID microrna的seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
miR-26 180年 187年 1、m8 hsa-miR-26a大脑 UUCAAGUAAUCCAGGAUAGGC
hsa-miR-26b深圳 UUCAAGUAAUUCAGGAUAGGUU
miR-9 947年 953年 m8 hsa-miR-9深圳 UCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGA