基因页:Gldn
概括?
基因 | 342035 |
象征 | Gldn |
同义词 | Clom | Colm | Crg-L2 | Crgl2 | UNC-112 |
描述 | 神经胶质素 |
参考 | MIM:608603|HGNC:HGNC:29514|ENSEMBL:ENSG00000186417|HPRD:12267|Vega:Otthumg00000131746 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 15Q21.2 |
Pascal P值 | 8.358e-4 |
Sherlock P值 | 0.34 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关的关键字的命中:1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS1953828 | CHR1 | 14564700 | Gldn | 342035 | 0.04 | 反式 | ||
RS4893866 | CHR2 | 177363635 | Gldn | 342035 | 0.16 | 反式 | ||
RS5003961 | CHR7 | 78072443 | Gldn | 342035 | 0.07 | 反式 | ||
RS4515471 | CHR7 | 78072585 | Gldn | 342035 | 0.07 | 反式 | ||
RS10259327 | CHR7 | 78074924 | Gldn | 342035 | 0.07 | 反式 | ||
RS7830259 | CHR8 | 14087643 | Gldn | 342035 | 0.01 | 反式 | ||
RS17137051 | CHR16 | 4521748 | Gldn | 342035 | 0.07 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/GLDN_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0007399 | 神经系统的发展 | IEA | 神经突(GO期限:5) | - |
去:0007275 | 多细胞生物发育 | IEA | - | |
去:0030154 | 细胞分化 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
GO:0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - | |
去:0005886 | 质膜 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
sabates结直肠腺瘤尺寸DN | 14 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
剑麻结肠直肠腺瘤DN | 291 | 176 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Perez TP53目标 | 1174 | 695 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
狮子转移 | 539 | 324 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zheng由Foxp3绑定 | 491 | 310 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner NPC HCP,含H3未甲基化 | 536 | 296 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 1069 | 729 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 | 1725年 | 838 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang EGF间隔 | 105 | 46 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA ECM糖蛋白 | 196 | 99 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA核心母质 | 275 | 148 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA矩阵 | 1028 | 559 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |