Summary
基因 3431
象征 SP110
同义词 ifi41 | ifi75 | ipr1 | vodi
描述 SP110核体蛋白
参考 MIM:604457|HGNC:HGNC:5401|Ensembl:ENSG00000135899|HPRD:06832|Vega:OTTHUMG00000133204
基因类型 蛋白质编码
地图位置 2q37.1
Pascal P值 0.021
Sherlock p-value 0.873
胎儿β -1.256
DMG 1(# studies)
主持人 小脑
皮质
梭子基底神经节
Myers' cis & trans

Gene in Data Sources
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV:GWASdb 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 1
表达 元-analysis of gene expression p价值:3.131

Section I. Genetics and epigenetics annotation

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG02056135 2 231084523 SP110 5.48e-5 -0.697 0.022 DMG:Wockner_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS4973285 CHR2 231045942 SP110 3431 0.01 顺式
rs10804364 CHR2 231047302 SP110 3431 0.02 顺式
rs10755048 CHR2 231047644 SP110 3431 0.01 顺式
RS3948464 CHR2 231050714 SP110 3431 0.2 顺式
RS6752361 CHR2 231053317 SP110 3431 0.03 顺式
RS4973298 CHR2 231060002 SP110 3431 0.01 顺式
RS12474683 CHR2 231060445 SP110 3431 0.05 顺式
RS7601299 CHR2 231077993 SP110 3431 0.03 顺式
rs13023481 CHR2 213839772 SP110 3431 0.18 反式
RS9784019 2 231035575 SP110 ENSG00000135899.12 1.035E-6 0 54869 gtex_brain_putamen_basal
RS9783992 2 231035589 SP110 ENSG00000135899.12 1.035E-6 0 54855 gtex_brain_putamen_basal
RS13010998 2 231035729 SP110 ENSG00000135899.12 1.035E-6 0 54715 gtex_brain_putamen_basal
RS13010639 2 231035745 SP110 ENSG00000135899.12 1.035E-6 0 54699 gtex_brain_putamen_basal
RS9783994 2 231035957 SP110 ENSG00000135899.12 1.035E-6 0 54487 gtex_brain_putamen_basal
rs12988385 2 231036311 SP110 ENSG00000135899.12 1.035E-6 0 54133 gtex_brain_putamen_basal
RS34897866 2 231036754 SP110 ENSG00000135899.12 1.035E-6 0 53690 gtex_brain_putamen_basal
RS34034766 2 231036768 SP110 ENSG00000135899.12 1.035E-6 0 53676 gtex_brain_putamen_basal
RS13018234 2 231036866 SP110 ENSG00000135899.12 1.035E-6 0 53578 gtex_brain_putamen_basal
RS12995739 2 231037481 SP110 ENSG00000135899.12 1.035E-6 0 52963 gtex_brain_putamen_basal
rs13025520 2 231038029 SP110 ENSG00000135899.12 1.035E-6 0 52415 gtex_brain_putamen_basal
RS13025209 2 231038169 SP110 ENSG00000135899.12 1.035E-6 0 52275 gtex_brain_putamen_basal
RS13026323 2 231038403 SP110 ENSG00000135899.12 1.035E-6 0 52041 gtex_brain_putamen_basal
RS2162478 2 231038640 SP110 ENSG00000135899.12 1.035E-6 0 51804 gtex_brain_putamen_basal
RS139482435 2 231038830 SP110 ENSG00000135899.12 1.035E-6 0 51614 gtex_brain_putamen_basal
RS5839362 2 231038831 SP110 ENSG00000135899.12 1.035E-6 0 51613 gtex_brain_putamen_basal
RS1004868 2 231038910 SP110 ENSG00000135899.12 1.035E-6 0 51534 gtex_brain_putamen_basal
RS2114585 2 231039341 SP110 ENSG00000135899.12 1.035E-6 0 51103 gtex_brain_putamen_basal
rs34122378 2 231040163 SP110 ENSG00000135899.12 1.035E-6 0 50281 gtex_brain_putamen_basal
RS41543719 2 231041940 SP110 ENSG00000135899.12 1.035E-6 0 48504 gtex_brain_putamen_basal
RS35574529 2 231043479 SP110 ENSG00000135899.12 1.712E-7 0 46965 gtex_brain_putamen_basal
RS35849510 2 231043495 SP110 ENSG00000135899.12 1.712E-7 0 46949 gtex_brain_putamen_basal
RS3948464 2 231050715 SP110 ENSG00000135899.12 6.942E-7 0 39729 gtex_brain_putamen_basal
RS6756480 2 231054329 SP110 ENSG00000135899.12 6.301E-7 0 36115 gtex_brain_putamen_basal
RS2894695 2 231057189 SP110 ENSG00000135899.12 6.647E-7 0 33255 gtex_brain_putamen_basal
RS1007661 2 231062616 SP110 ENSG00000135899.12 6.061E-7 0 27828 gtex_brain_putamen_basal
RS4973299 2 231076617 SP110 ENSG00000135899.12 1.77E-8 0 13827 gtex_brain_putamen_basal
RS6749386 2 231077360 SP110 ENSG00000135899.12 1.764E-8 0 13084 gtex_brain_putamen_basal
RS1129411 2 231077725 SP110 ENSG00000135899.12 1.761E-8 0 12719 gtex_brain_putamen_basal
RS1427294 2 231078448 SP110 ENSG00000135899.12 1.761E-8 0 11996 gtex_brain_putamen_basal
RS1427293 2 231078645 SP110 ENSG00000135899.12 2.34E-8 0 11799 gtex_brain_putamen_basal

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

Footnote:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

Footnote:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

No co-expressed genes in brain regions


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0003677 DNA结合 TAS 7693701
去:0005062 造血素/干扰素级(D200域)细胞因子受体信号传感器活性 TAS 7693701
去:0005515 蛋白质结合 IEA -
去:0008270 锌离子结合 IEA -
GO:0046872 金属离子结合 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006355 调节转录,DNA依赖性的调节 IEA -
去:0006350 转录 IEA -
GO:0044419 种间国际米兰action between organisms IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005634 IEA -
去:0005634 TAS 7693701

Section V. Pathway annotation

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
家长mtor信号向上 567 375 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Onken Uveal黑色素瘤 783 507 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Fulcher炎症反应凝集素与LPS DN 463 290 All SZGR 2.0 genes in this pathway
DOANE RESPONSE TO ANDROGEN DN 241 146 All SZGR 2.0 genes in this pathway
奥斯曼膀胱癌DN 406 230 All SZGR 2.0 genes in this pathway
TAKEDA TARGETS OF NUP98 HOXA9 FUSION 3D UP 182 110 All SZGR 2.0 genes in this pathway
NUP98 HOXA9 Fusion 10D的Takeda目标 194 122 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Dittmer PTHLH靶向DN 73 51 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Gozgit ESR1靶向DN 781 465 All SZGR 2.0 genes in this pathway
ENK UV响应表皮增强 293 179 All SZGR 2.0 genes in this pathway
血清剥夺的Graessmann凋亡 552 347 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Graessmann对MC和血清剥夺的反应 211 136 All SZGR 2.0 genes in this pathway
阿霉素的Graessmann凋亡 1142 669 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Graessmann对MC和阿霉素的反应 612 367 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Baris甲状腺癌DN 59 45 All SZGR 2.0 genes in this pathway
甲基化调节的米西亚利亚 126 78 All SZGR 2.0 genes in this pathway
癌症中的EINAV干扰素签名 27 16 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Dauer Stat3靶向DN 50 34 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Pujana ATM PCC网络 1442 892 All SZGR 2.0 genes in this pathway
SCHAEFFER PROSTATE DEVELOPMENT 6HR UP 176 115 All SZGR 2.0 genes in this pathway
der ifn alpha响应 74 48 All SZGR 2.0 genes in this pathway
HBV感染的Wieland 101 66 All SZGR 2.0 genes in this pathway
der ifn beta响应 102 67 All SZGR 2.0 genes in this pathway
史密斯·泰特(Smith Tert)目标DN 87 69 All SZGR 2.0 genes in this pathway
der ifn伽马响应 71 45 All SZGR 2.0 genes in this pathway
葡萄病毒感染的Debiasi凋亡 314 201 All SZGR 2.0 genes in this pathway
布朗干扰素反应性基因 68 44 All SZGR 2.0 genes in this pathway
阿尔茨海默氏症疾病 1691 1088 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Martinez RB1靶向DN 543 317 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Martinez TP53目标DN 593 372 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Martinez RB1和TP53靶向DN 591 366 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Rizki肿瘤侵入性3D DN 270 181 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Smid乳腺癌正常 476 285 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Tacker吉西他滨抵抗 79 40 All SZGR 2.0 genes in this pathway
张干扰素反应 23 14 All SZGR 2.0 genes in this pathway
炎症反应和胆固醇 58 38 All SZGR 2.0 genes in this pathway
RUTELLA RESPONSE TO CSF2RB AND IL4 DN 315 201 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Rutella对HGF DN的响应 235 144 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Rutella对HGF与CSF2RB和IL4的反应 408 276 All SZGR 2.0 genes in this pathway
LEE DIFFERENTIATING T LYMPHOCYTE 200 115 All SZGR 2.0 genes in this pathway
张TLX目标36hr 221 150 All SZGR 2.0 genes in this pathway
张TLX目标60小时 293 203 All SZGR 2.0 genes in this pathway
张TLX目标 108 78 All SZGR 2.0 genes in this pathway
突变的TP53 DN的Stambolsky靶标 50 24 All SZGR 2.0 genes in this pathway
gregory合成致死与伊马替尼 145 83 All SZGR 2.0 genes in this pathway
CTBP1的PURBEY目标不是SATB1 344 215 All SZGR 2.0 genes in this pathway
CTBP1的Purbey目标不是SATB1 DN 448 282 All SZGR 2.0 genes in this pathway
杨Bcl3靶向 364 236 All SZGR 2.0 genes in this pathway