Gene Page:IFIT2
概括?
| 基因 | 3433 |
| Symbol | IFIT2 |
| Synonyms | G10P2|GARG-39|IFI-54|IFI-54K|IFI54|IFIT-2|ISG-54 K|ISG-54K|ISG54|P54|cig42 |
| Description | interferon induced protein with tetratricopeptide repeats 2 |
| Reference | MIM:147040|HGNC:HGNC:5409|Ensembl:ENSG00000119922|HPRD:00913|Vega:OTTHUMG00000018707 |
| Gene type | protein-coding |
| Map location | 10q23.31 |
| Pascal p-value | 0.14 |
| Sherlock p-value | 0.274 |
| Fetal beta | -3.086 |
| eGene | Myers' cis & trans |
数据源中的基因
| Gene set name | Method of gene set | Description | Info |
|---|---|---|---|
| CV:PGCnp | Genome-wide Association Study | GWAS | |
| PMID:cooccur | High-throughput literature-search | 系统atic search in PubMed for genes co-occurring with SCZ keywords. A total of 3027 genes were included. | |
| Literature | High-throughput literature-search | Co-occurance with Schizophrenia keywords: schizophrenia,schizophrenias | Click to show details |
第一节遗传学和表观遗传学注释
eQTL annotation
eQTL annotation| SNP ID | Chromosome | Position | eGene | Gene Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS distance | eQTL type |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs10186260 | chr2 | 129538777 | IFIT2 | 3433 | 0.19 | trans | ||
| rs1678893 | chr5 | 31763244 | IFIT2 | 3433 | 0.03 | trans | ||
| rs9397692 | chr6 | 154487314 | IFIT2 | 3433 | 0.08 | trans | ||
| rs17292544 | chr6 | 154544809 | IFIT2 | 3433 | 0.02 | trans | ||
| rs201062 | chr10 | 10985931 | IFIT2 | 3433 | 0.19 | trans | ||
| rs1341055 | chr10 | 112607604 | IFIT2 | 3433 | 0.05 | trans | ||
| rs2508654 | chr11 | 120405519 | IFIT2 | 3433 | 0.06 | trans | ||
| RS17066364 | chr13 | 45515988 | IFIT2 | 3433 | 0.17 | trans | ||
| rs7332969 | chr13 | 45612902 | IFIT2 | 3433 | 0.17 | trans | ||
| RS16965323 | chr15 | 53229859 | IFIT2 | 3433 | 0.16 | trans | ||
| rs17347454 | chrX | 23347700 | IFIT2 | 3433 | 0 | trans |
Section II. Transcriptome annotation
General gene expression (GTEx)
Gene expression during devlopment (BrainCloud)
脚注：
A total of 269 time points ploted, with n=38 fetal samples (x=1:38). Each triangle represents one time point.
Gene expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)
脚注：
SC: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.
No co-expressed genes in brain regions
Section V. Pathway annotation
| Pathway name | Pathway size | # SZGR 2.0 genes in pathway | Info |
|---|---|---|---|
| REACTOME INTERFERON ALPHA BETA SIGNALING | 64 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| REACTOME INTERFERON SIGNALING | 159 | 116 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| REACTOME IMMUNE SYSTEM | 933 | 616 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 免疫系统中的反应组细胞因子信号传导 | 270 | 204 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SENGUPTA NASOPHARYNGEAL CARCINOMA WITH LMP1 UP | 408 | 247 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| FULCHER INFLAMMATORY RESPONSE LECTIN VS LPS DN | 463 | 290 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NEWMAN ERCC6 TARGETS UP | 26 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| HORIUCHI WTAP TARGETS UP | 306 | 188 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| TAKEDA TARGETS OF NUP98 HOXA9 FUSION 3D UP | 182 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| TAKEDA TARGETS OF NUP98 HOXA9 FUSION 8D UP | 157 | 91 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| TAKEDA TARGETS OF NUP98 HOXA9 FUSION 10D UP | 194 | 122 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| TAKEDA TARGETS OF NUP98 HOXA9 FUSION 16D UP | 175 | 108 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SENESE HDAC3 TARGETS UP | 501 | 327 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ZHOU INFLAMMATORY RESPONSE LPS UP | 431 | 237 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| RODRIGUES THYROID CARCINOMA ANAPLASTIC UP | 722 | 443 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| GOZGIT ESR1 TARGETS DN | 781 | 465 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CHEBOTAEV GR TARGETS UP | 77 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MARKEY RB1 ACUTE LOF UP | 215 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| GRAESSMANN APOPTOSIS BY SERUM DEPRIVATION UP | 552 | 347 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| GRAESSMANN RESPONSE TO MC AND SERUM DEPRIVATION UP | 211 | 136 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BERENJENO通过RHOA转换 | 536 | 340 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BOWIE RESPONSE TO EXTRACELLULAR MATRIX | 17 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BOWIE RESPONSE TO TAMOXIFEN | 18 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SEITZ NEOPLASTIC TRANSFORMATION BY 8P DELETION UP | 73 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SHETH LIVER CANCER VS TXNIP LOSS PAM3 | 70 | 37 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CERVERA SDHB TARGETS 1 UP | 118 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| RADAEVA RESPONSE TO IFNA1 UP | 52 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| DER IFN BETA RESPONSE UP | 102 | 67 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| GRANDVAUX IRF3 TARGETS UP | 15 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| LEE LIVER CANCER MYC E2F1 UP | 56 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| LEE LIVER CANCER E2F1 UP | 62 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| DER IFN GAMMA RESPONSE UP | 71 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KUMAR TARGETS OF MLL AF9 FUSION | 405 | 264 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| LIANG SILENCED BY METHYLATION 2 | 53 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| DEBIASI APOPTOSIS BY REOVIRUS INFECTION UP | 314 | 201 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CHANG IMMORTALIZED BY HPV31 DN | 65 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BROWNE INTERFERON RESPONSIVE GENES | 68 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| WANG SMARCE1 TARGETS UP | 280 | 183 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MAHAJAN RESPONSE TO IL1A UP | 81 | 52 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| DOUGLAS BMI1 TARGETS DN | 314 | 188 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Creighton内分泌疗法抗性2 | 473 | 224 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MARSON BOUND BY FOXP3 UNSTIMULATED | 1229 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KONDO EZH2 TARGETS | 245 | 148 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| IWANAGA CARCINOGENESIS BY KRAS PTEN DN | 353 | 226 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ACEVEDO LIVER CANCER UP | 973 | 570 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ACEVEDO LIVER TUMOR VS NORMAL ADJACENT TISSUE UP | 863 | 514 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MOSERLE IFNA RESPONSE | 31 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| TSAI RESPONSE TO RADIATION THERAPY | 32 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| LINDSTEDT DENDRITIC CELL MATURATION A | 67 | 52 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 张干扰素反应 | 23 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 霍夫曼（Hoffmann | 75 | 61 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ZHANG TLX TARGETS 36HR DN | 185 | 116 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Han Satb1靶向 | 395 | 249 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Han Satb1靶向DN | 442 | 275 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| COLINA TARGETS OF 4EBP1 AND 4EBP2 | 356 | 214 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CHEN METABOLIC SYNDROM NETWORK | 1210 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MILI PSEUDOPODIA HAPTOTAXIS UP | 518 | 299 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CROONQUIST IL6 DEPRIVATION UP | 20 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| JISON SICKLE CELL DISEASE UP | 181 | 106 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| DORN ADENOVIRUS INFECTION 12HR UP | 29 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| DORN ADENOVIRUS INFECTION 24HR DN | 43 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| DORN ADENOVIRUS INFECTION 32HR UP | 11 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| DORN ADENOVIRUS INFECTION 48HR UP | 14 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MIKKELSEN ES ICP WITH H3K4ME3 | 718 | 401 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MIKKELSEN NPC ICP WITH H3K4ME3 | 445 | 257 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| YAO TEMPORAL RESPONSE TO PROGESTERONE CLUSTER 6 | 75 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BROWNE HCMV INFECTION 2HR DN | 49 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Browne HCMV感染4小时 | 55 | 41 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| WHITFIELD CELL CYCLE M G1 | 148 | 95 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CHICAS RB1 TARGETS CONFLUENT | 567 | 365 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| JOHNSTONE PARVB TARGETS 2 UP | 140 | 94 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| WINZEN DEGRADED VIA KHSRP | 100 | 70 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| GOBERT OLIGODENDROCYTE DIFFERENTIATION UP | 570 | 339 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SERVITJA ISLET HNF1A TARGETS UP | 163 | 111 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| YANG BCL3 TARGETS UP | 364 | 236 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Plasari TGFB1目标10小时DN | 244 | 157 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KRIEG HYPOXIA NOT VIA KDM3A | 770 | 480 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| FORTSCHEGGER PHF8 TARGETS DN | 784 | 464 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PEDRIOLI MIR31 TARGETS DN | 418 | 245 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ALTEMEIER RESPONSE TO LPS WITH MECHANICAL VENTILATION | 128 | 81 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| HECKER IFNB1 TARGETS | 95 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |