基因页:IFNA1
概括?
基因 | 3439 |
象征 | IFNA1 |
同义词 | ifl | ifn | ifn-alpha | ifn-alphad | ifna13 | ifna@ |
描述 | 干扰素,alpha 1 |
参考 | MIM:147660|HGNC:HGNC:5417|Ensembl:ENSG00000197919|HPRD:00974|Vega:Otthumg0000000019673 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 9p22 |
Pascal P值 | 0.014 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/IFNA1_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
PSPH | 0.70 | 0.51 |
PHF11 | 0.69 | 0.53 |
PRCP | 0.69 | 0.47 |
Selt | 0.68 | 0.60 |
C1QB | 0.68 | 0.43 |
Rab9a | 0.67 | 0.46 |
GPR183 | 0.67 | 0.40 |
CRBN | 0.67 | 0.59 |
glo1 | 0.66 | 0.57 |
TMEM165 | 0.66 | 0.56 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
C9orf131 | -0.34 | -0.32 |
克里帕克 | -0.33 | -0.36 |
AC010327.3 | -0.31 | -0.32 |
RP11-274B21.1 | -0.31 | -0.32 |
DMPK | -0.30 | -0.32 |
SLC29A4 | -0.30 | -0.29 |
Duox1 | -0.30 | -0.35 |
AC104115.1 | -0.30 | -0.33 |
CEP250 | -0.30 | -0.24 |
TIAF1 | -0.30 | -0.24 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG细胞因子细胞因子受体相互作用 | 267 | 161 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
自噬调节 | 35 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG抗原处理和演示 | 89 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kegg Toll像受体信号通路 | 102 | 88 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg钻机我喜欢受体信号通路 | 71 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg胞质DNA感应途径 | 56 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg jak stat信号通路 | 155 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg天然杀伤细胞介导的细胞毒性 | 137 | 92 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG自身免疫性甲状腺疾病 | 53 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
生物卡塔尔细胞因子途径 | 22 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta fordam途径 | 29 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta DC途径 | 22 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta IL1R途径 | 33 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID CD8 TCR下游途径 | 65 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome Traf6介导的IRF7激活 | 30 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
巨核细胞发育和血小板产生涉及的反应组因素 | 132 | 101 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome干扰素αβ信号传导 | 64 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
IFNA信号的反应组调节 | 24 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome干扰素信号传导 | 159 | 116 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome钻机I MDA5介导的IFNαβ途径的诱导 | 73 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组止血 | 466 | 331 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome先天免疫系统 | 279 | 178 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome免疫系统 | 933 | 616 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
免疫系统中的反应组细胞因子信号传导 | 270 | 204 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee Calorie限制性新皮层 | 83 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee Calorie限制新皮层DN | 88 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Acevedo肝癌,H3K27me3 UP | 295 | 149 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
VART KSHV感染血管生成标记 | 165 | 118 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA分泌因素 | 344 | 197 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA女性相关 | 753 | 411 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA矩阵 | 1028 | 559 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |