基因页:apoc2
概括?
基因 | 344 |
象征 | apoc2 |
同义词 | apo-cii | apoc-ii |
描述 | 载脂蛋白C-II |
参考 | MIM:608083|HGNC:HGNC:609|Ensembl:ENSG00000224916|HPRD:07457| |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 19q13.2 |
Pascal P值 | 0.003 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS17111364 | Chr10 | 97901813 | apoc2 | 344 | 9.51E-4 | 反式 | ||
RS17076272 | CHR13 | 22726361 | apoc2 | 344 | 0.02 | 反式 | ||
RS17076274 | CHR13 | 22726381 | apoc2 | 344 | 0.02 | 反式 | ||
RS10483856 | CHR14 | 74365294 | apoc2 | 344 | 0.13 | 反式 | ||
RS740505 | CHR14 | 74426853 | apoc2 | 344 | 0.19 | 反式 | ||
RS4887516 | CHR15 | 87432487 | apoc2 | 344 | 0.04 | 反式 | ||
RS16979927 | CHR20 | 55019249 | apoc2 | 344 | 0.13 | 反式 | ||
RS16982879 | Chrx | 92924110 | apoc2 | 344 | 0.02 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/APOC2_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
rtkn | 0.93 | 0.92 |
CYP27A1 | 0.91 | 0.93 |
PLLP | 0.91 | 0.95 |
马尔 | 0.90 | 0.94 |
dbndd2 | 0.90 | 0.92 |
CBR1 | 0.89 | 0.88 |
Cryab | 0.89 | 0.94 |
忍者 | 0.89 | 0.91 |
杂志 | 0.88 | 0.90 |
阿斯帕 | 0.88 | 0.94 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
nkiras2 | -0.68 | -0.76 |
KIAA1949 | -0.65 | -0.75 |
CRMP1 | -0.65 | -0.73 |
tubb2b | -0.65 | -0.78 |
ZNF821 | -0.65 | -0.74 |
HN1 | -0.65 | -0.74 |
mpp3 | -0.64 | -0.73 |
塔布 | -0.64 | -0.75 |
PCDHB18 | -0.63 | -0.74 |
Gmip | -0.63 | -0.72 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Reactome HDL介导的脂质转运 | 15 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
脂质和脂蛋白的反应组代谢 | 478 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome脂质消化和运输 | 46 | 37 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组脂蛋白代谢 | 28 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome Chylomicron介导的脂质转运 | 16 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mullighan MLL签名2 UP | 418 | 263 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甲状腺癌 | 443 | 294 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
McBryan Pubertal乳房3 4WK | 214 | 144 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
McBryan Pubertal乳房4 5WK DN | 196 | 131 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
McBryan Pubertal TGFB1靶向DN | 62 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
悍马皮肤癌进展 | 88 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
roversi神经胶质瘤副本编号 | 100 | 75 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
tarte浆细胞与Plasmablast向上 | 398 | 262 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ross AML带有MLL融合 | 78 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HSIAO肝特异性基因 | 244 | 154 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Taci的Moreaux多发性骨髓瘤 | 412 | 249 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
TACI UP淋巴细胞的淋巴细胞成熟 | 92 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee Calorie限制性新皮层 | 83 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nielsen Schwannoma Up | 18 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
在胰腺癌中被甲基化沉默的Sato 1 | 419 | 273 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马丁内斯RB1靶向 | 673 | 430 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez TP53靶向 | 602 | 364 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez RB1和TP53靶向 | 601 | 369 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
级结肠癌 | 871 | 505 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Labbe TGFB1靶向DN | 108 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
TGFB1和WNT3A DN的LABBE目标 | 108 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CADWELL ATG16L1靶向 | 93 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Valk AML群集16 | 26 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Valk AML,11q23重新排列 | 22 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yagi AML与T 9 11易位 | 130 | 87 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hoshida肝癌亚类S3 | 266 | 180 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Baus TFF2靶向 | 32 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ohguchi肝HNF4A靶向DN | 149 | 85 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Vandesluis Commd1目标4 | 19 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Brideau印迹基因 | 63 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 | 1839年 | 928 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |