概括
基因 344
象征 apoc2
同义词 apo-cii | apoc-ii
描述 载脂蛋白C-II
参考 MIM:608083|HGNC:HGNC:609|Ensembl:ENSG00000224916|HPRD:07457|
基因类型 蛋白质编码
地图位置 19q13.2
Pascal P值 0.003
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS17111364 Chr10 97901813 apoc2 344 9.51E-4 反式
RS17076272 CHR13 22726361 apoc2 344 0.02 反式
RS17076274 CHR13 22726381 apoc2 344 0.02 反式
RS10483856 CHR14 74365294 apoc2 344 0.13 反式
RS740505 CHR14 74426853 apoc2 344 0.19 反式
RS4887516 CHR15 87432487 apoc2 344 0.04 反式
RS16979927 CHR20 55019249 apoc2 344 0.13 反式
RS16982879 Chrx 92924110 apoc2 344 0.02 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
rtkn 0.93 0.92
CYP27A1 0.91 0.93
PLLP 0.91 0.95
马尔 0.90 0.94
dbndd2 0.90 0.92
CBR1 0.89 0.88
Cryab 0.89 0.94
忍者 0.89 0.91
杂志 0.88 0.90
阿斯帕 0.88 0.94
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
nkiras2 -0.68 -0.76
KIAA1949 -0.65 -0.75
CRMP1 -0.65 -0.73
tubb2b -0.65 -0.78
ZNF821 -0.65 -0.74
HN1 -0.65 -0.74
mpp3 -0.64 -0.73
塔布 -0.64 -0.75
PCDHB18 -0.63 -0.74
Gmip -0.63 -0.72

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Reactome HDL介导的脂质转运 15 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
脂质和脂蛋白的反应组代谢 478 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome脂质消化和运输 46 37 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组脂蛋白代谢 28 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Chylomicron介导的脂质转运 16 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan MLL签名2 UP 418 263 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌 443 294 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McBryan Pubertal乳房3 4WK 214 144 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McBryan Pubertal乳房4 5WK DN 196 131 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McBryan Pubertal TGFB1靶向DN 62 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
悍马皮肤癌进展 88 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
roversi神经胶质瘤副本编号 100 75 该途径中的所有SZGR 2.0基因
tarte浆细胞与Plasmablast向上 398 262 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ross AML带有MLL融合 78 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HSIAO肝特异性基因 244 154 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Taci的Moreaux多发性骨髓瘤 412 249 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TACI UP淋巴细胞的淋巴细胞成熟 92 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee Calorie限制性新皮层 83 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nielsen Schwannoma Up 18 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
在胰腺癌中被甲基化沉默的Sato 1 419 273 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马丁内斯RB1靶向 673 430 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez TP53靶向 602 364 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez RB1和TP53靶向 601 369 该途径中的所有SZGR 2.0基因
级结肠癌 871 505 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Labbe TGFB1靶向DN 108 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TGFB1和WNT3A DN的LABBE目标 108 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CADWELL ATG16L1靶向 93 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Valk AML群集16 26 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Valk AML,11q23重新排列 22 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yagi AML与T 9 11易位 130 87 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hoshida肝癌亚类S3 266 180 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Baus TFF2靶向 32 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ohguchi肝HNF4A靶向DN 149 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Vandesluis Commd1目标4 19 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Brideau印迹基因 63 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 1839年 928 该途径中的所有SZGR 2.0基因