基因页:IFNA2
概括?
基因 | 3440 |
象征 | IFNA2 |
同义词 | ifn-alphaa | ifna | ifna2b | infa2 |
描述 | 干扰素,alpha 2 |
参考 | MIM:147562|HGNC:HGNC:5423|ENSEMBL:ENSG00000188379|HPRD:00950|Vega:Otthumg0000000019674 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 9p22 |
Pascal P值 | 0.002 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/IFNA2_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
ZDHHC16 | 0.86 | 0.81 |
STK25 | 0.84 | 0.79 |
SNAP47 | 0.84 | 0.79 |
C11orf49 | 0.83 | 0.78 |
FAM54B | 0.83 | 0.78 |
GSK3A | 0.82 | 0.78 |
eral1 | 0.82 | 0.77 |
TMEM203 | 0.82 | 0.80 |
CCRK | 0.82 | 0.82 |
EMD | 0.81 | 0.77 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.26 | -0.74 | -0.67 |
AF347015.8 | -0.74 | -0.64 |
MT-CO2 | -0.72 | -0.60 |
AF347015.18 | -0.72 | -0.72 |
mt-cyb | -0.71 | -0.61 |
AF347015.27 | -0.70 | -0.62 |
AF347015.15 | -0.70 | -0.61 |
AF347015.2 | -0.70 | -0.59 |
AF347015.33 | -0.69 | -0.58 |
AF347015.21 | -0.68 | -0.60 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG细胞因子细胞因子受体相互作用 | 267 | 161 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
自噬调节 | 35 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG抗原处理和演示 | 89 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kegg Toll像受体信号通路 | 102 | 88 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg钻机我喜欢受体信号通路 | 71 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg胞质DNA感应途径 | 56 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg jak stat信号通路 | 155 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg天然杀伤细胞介导的细胞毒性 | 137 | 92 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG自身免疫性甲状腺疾病 | 53 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID CD8 TCR下游途径 | 65 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome Traf6介导的IRF7激活 | 30 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
巨核细胞发育和血小板产生涉及的反应组因素 | 132 | 101 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome干扰素αβ信号传导 | 64 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
IFNA信号的反应组调节 | 24 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome干扰素信号传导 | 159 | 116 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome钻机I MDA5介导的IFNαβ途径的诱导 | 73 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组止血 | 466 | 331 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome先天免疫系统 | 279 | 178 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome免疫系统 | 933 | 616 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
免疫系统中的反应组细胞因子信号传导 | 270 | 204 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Stanelle E2F1目标 | 29 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yagi AML与T 9 11易位 | 130 | 87 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA分泌因素 | 344 | 197 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA女性相关 | 753 | 411 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA矩阵 | 1028 | 559 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |