基因页：NCKAP5

概括？
基因 344148
象征 NCKAP5
同义词 erih1 | erih2 | nap5
描述 NCK相关蛋白5
参考 MIM：608789|HGNC：HGNC：29847|ENSEMBL：ENSG00000176771|HPRD：16936|Vega：Otthumg00000153573
基因类型 蛋白质编码
地图位置 2q21.2
Pascal P值 0.344
胎儿β 2.408
主持人 元

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DNM：Guipponi_2014 整个外显子组测序分析 通过比较53个散发性SCZ及其未受影响的父母的外显子组来识别49个DNM

第一节遗传学和表观遗传学注释

@DNM表

基因 染色体 位置 参考 alt 成绩单 AA更改 突变类型 筛 CG46 特征 学习
NCKAP5 C G NM_207363 P.A1466A 代名词 NA NA 精神分裂症 DNM：Guipponi_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0003674 Molecular_Function nd -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0008150 生物_Process nd -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005575 cellular_component nd -

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
Gozgit ESR1靶向DN 781 465 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gaussmann MLL AF4融合靶向F 185 119 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FLI1和DAX1的Garcia目标 57 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性1 528 324 该途径中的所有SZGR 2.0基因
riggi ewing肉瘤祖先 430 288 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner ES ICP与H3K4Me3 34 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner NPC ICP，具有H3未甲基化的 24 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain ICP带有H3K4ME3 32 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MCV6 ICP，带有H3K4ME3和H3K27ME3 34 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen IPS ICP带有H3K4ME3和H327Me3 126 83 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen ES ICP与H3K4Me3 718 401 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen NPC ICP带有H3K4Me3 445 257 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Durand Stroma S向上 297 194 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-130/301 510 516 M8 HSA-MIR-130A脑 cagugcaauguaaaaggggau
HSA-MIR-301 cagugcaauaugucaaagc
HSA-MIR-130b脑 Cagugcaaugaagggauggau
HSA-MIR-454-3P uagugcaauauugcuuauaggguuu
mir-137 586 592 1a HSA-MIR-137 uauugcuuaagaauacgcguag
mir-141/200a 1358 1365 1A，M8 HSA-MIR-141 uaacacugucugugugugugaugg
HSA-MIR-200A uaacacugucuguguguguaaacgaugu
mir-17-5p/20/93.mr/106/519.D 512 518 M8 HSA-MIR-17-5P caaagugcuuacugcagguagu
HSA-MIR-20A脑 uaaagugcuuauagugcagguag
HSA-MIR-106A aaaagugcuuacugugcagguagc
HSA-MIR-106BSZ uaaagugcugacagugcagau
HSA-MIR-20BSZ caaagugcuugugcagguag
HSA-MIR-519D caaagugccucccuuuagugugu
mir-19 509 515 M8 HSA-MIR-19A ugugcaaauaugauaugaaaacuga
HSA-MIR-19B ugugcaaauccaugcaaaacuga
mir-25/32/92/363/367 1378 1384 M8 HSA-MIR-25脑 Cauugcacuugucucggucuga
HSA-MIR-32 uauugcacauacuaaguugc
HSA-MIR-92 uauugcacuugucccgcgcug
HSA-MIR-367 Aauugcacuuuagcaaugga
HSA-MIR-92BSZ uauugcacucgucccgcgcuc
mir-29 1136 1143 1A，M8 HSA-MIR-29ASZ uagcaccaucugaaaucgguu
HSA-MIR-29BSZ uagcaccauuugaaaucaguguu
HSA-MIR-29CSZ uagcaccauuugaaaucggu
mir-335 610 617 1A，M8 HSA-MIR-335脑 UCAAGAGCAAUAACGAAAAAUAUGU