概括
基因 345
象征 apoc3
同义词 apociii | halp2
描述 载脂蛋白C-III
参考 MIM:107720|HGNC:HGNC:610|ENSEMBL:ENSG00000110245|HPRD:00132|Vega:Otthumg0000000046115
基因类型 蛋白质编码
地图位置 11q23.3
Pascal P值 0.618
胎儿β 0.05

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR:0.006
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
CST3 0.91 0.96
AC011427.1 0.86 0.93
SLC7A10 0.85 0.91
HSD17B14 0.84 0.91
Metrn 0.82 0.91
AIFM3 0.82 0.90
TSC22D4 0.81 0.90
S100A16 0.80 0.91
GATSL3 0.79 0.76
TLCD1 0.79 0.91
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
C6orf168 -0.75 -0.83
Spats2 -0.73 -0.85
eif4enif1 -0.73 -0.81
准备 -0.72 -0.81
rasa1 -0.72 -0.79
Arih2 -0.72 -0.82
terf2 -0.72 -0.84
ZNF329 -0.72 -0.83
UBP1 -0.72 -0.79
Zranb1 -0.72 -0.82

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005543 磷脂结合 艾达 4066713|11060345
去:0005319 脂质转运蛋白活性 IEA -
去:0030234 酶调节剂活性 艾达 11060345
GO:0015485 胆固醇结合 我知道了 11162594
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0007186 G蛋白偶联受体蛋白信号通路 艾达 16443932
GO:0016042 脂质分解代谢过程 IEA -
去:0006869 脂质运输 IEA -
GO:0033344 胆固醇外排 艾达 11162594|16443932
GO:0051005 脂蛋白脂肪酶活性的阴性调节 艾达 11060345
GO:0042157 脂蛋白代谢过程 IEA -
GO:0019433 三酰基甘油分解代谢过程 艾达 11060345
GO:0034375 高密度脂蛋白颗粒重塑 小鬼 17438339
GO:0032488 CDC42蛋白信号转导 艾达 16443932
GO:0033700 磷脂外排 艾达 11162594
GO:0045717 脂肪酸生物合成过程的负调节 艾达 11060345
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005576 细胞外区域 经验 4345202
去:0005576 细胞外区域 IEA -
去:0005615 细胞外空间 艾达 11060345
GO:0034366 球形高密度脂蛋白颗粒 艾达 17438339
GO:0034363 中密度脂蛋白颗粒 艾达 17336988
GO:0034361 非常低密度的脂蛋白颗粒 艾达 16935699
GO:0042627 乳糜微粒 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg ppar信号通路 69 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome HDL介导的脂质转运 15 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
脂质和脂蛋白的反应组代谢 478 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome脂质消化和运输 46 37 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组脂蛋白代谢 28 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Chylomicron介导的脂质转运 16 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
vecchi胃癌早期DN 367 220 该途径中的所有SZGR 2.0基因
tien肠益生菌24小时 557 331 该途径中的所有SZGR 2.0基因
tarte浆细胞与Plasmablast向上 398 262 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HSIAO肝特异性基因 244 154 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hoegerkorp CD44靶向时间DN 25 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
李肝癌的生存 185 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hoffmann小型前BII至未成熟的B淋巴细胞向上 70 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Woo肝癌复发DN 80 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
金双相情感障碍少突胶质细胞密度cor dn 88 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FEVR CTNNB1靶向 682 433 该途径中的所有SZGR 2.0基因