基因页:apoc3
概括?
基因 | 345 |
象征 | apoc3 |
同义词 | apociii | halp2 |
描述 | 载脂蛋白C-III |
参考 | MIM:107720|HGNC:HGNC:610|ENSEMBL:ENSG00000110245|HPRD:00132|Vega:Otthumg0000000046115 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 11q23.3 |
Pascal P值 | 0.618 |
胎儿β | 0.05 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR:0.006 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/APOC3_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
CST3 | 0.91 | 0.96 |
AC011427.1 | 0.86 | 0.93 |
SLC7A10 | 0.85 | 0.91 |
HSD17B14 | 0.84 | 0.91 |
Metrn | 0.82 | 0.91 |
AIFM3 | 0.82 | 0.90 |
TSC22D4 | 0.81 | 0.90 |
S100A16 | 0.80 | 0.91 |
GATSL3 | 0.79 | 0.76 |
TLCD1 | 0.79 | 0.91 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
C6orf168 | -0.75 | -0.83 |
Spats2 | -0.73 | -0.85 |
eif4enif1 | -0.73 | -0.81 |
准备 | -0.72 | -0.81 |
rasa1 | -0.72 | -0.79 |
Arih2 | -0.72 | -0.82 |
terf2 | -0.72 | -0.84 |
ZNF329 | -0.72 | -0.83 |
UBP1 | -0.72 | -0.79 |
Zranb1 | -0.72 | -0.82 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005543 | 磷脂结合 | 艾达 | 4066713|11060345 | |
去:0005319 | 脂质转运蛋白活性 | IEA | - | |
去:0030234 | 酶调节剂活性 | 艾达 | 11060345 | |
GO:0015485 | 胆固醇结合 | 我知道了 | 11162594 | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0007186 | G蛋白偶联受体蛋白信号通路 | 艾达 | 16443932 | |
GO:0016042 | 脂质分解代谢过程 | IEA | - | |
去:0006869 | 脂质运输 | IEA | - | |
GO:0033344 | 胆固醇外排 | 艾达 | 11162594|16443932 | |
GO:0051005 | 脂蛋白脂肪酶活性的阴性调节 | 艾达 | 11060345 | |
GO:0042157 | 脂蛋白代谢过程 | IEA | - | |
GO:0019433 | 三酰基甘油分解代谢过程 | 艾达 | 11060345 | |
GO:0034375 | 高密度脂蛋白颗粒重塑 | 小鬼 | 17438339 | |
GO:0032488 | CDC42蛋白信号转导 | 艾达 | 16443932 | |
GO:0033700 | 磷脂外排 | 艾达 | 11162594 | |
GO:0045717 | 脂肪酸生物合成过程的负调节 | 艾达 | 11060345 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005576 | 细胞外区域 | 经验 | 4345202 | |
去:0005576 | 细胞外区域 | IEA | - | |
去:0005615 | 细胞外空间 | 艾达 | 11060345 | |
GO:0034366 | 球形高密度脂蛋白颗粒 | 艾达 | 17438339 | |
GO:0034363 | 中密度脂蛋白颗粒 | 艾达 | 17336988 | |
GO:0034361 | 非常低密度的脂蛋白颗粒 | 艾达 | 16935699 | |
GO:0042627 | 乳糜微粒 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
kegg ppar信号通路 | 69 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome HDL介导的脂质转运 | 15 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
脂质和脂蛋白的反应组代谢 | 478 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome脂质消化和运输 | 46 | 37 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组脂蛋白代谢 | 28 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome Chylomicron介导的脂质转运 | 16 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
vecchi胃癌早期DN | 367 | 220 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
tien肠益生菌24小时 | 557 | 331 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
tarte浆细胞与Plasmablast向上 | 398 | 262 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HSIAO肝特异性基因 | 244 | 154 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hoegerkorp CD44靶向时间DN | 25 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
李肝癌的生存 | 185 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hoffmann小型前BII至未成熟的B淋巴细胞向上 | 70 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Woo肝癌复发DN | 80 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
金双相情感障碍少突胶质细胞密度cor dn | 88 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FEVR CTNNB1靶向 | 682 | 433 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |