基因页:IFNAR1
概括?
基因 | 3454 |
象征 | IFNAR1 |
同义词 | avp | ifn-alpha-rec | ifnar | ifnbr | ifrc |
描述 | 干扰素α和β受体亚基1 |
参考 | MIM:107450|HGNC:HGNC:5432|ENSEMBL:ENSG00000142166|HPRD:00126|Vega:Otthumg0000000065126 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 21q22.11 |
Pascal P值 | 0.079 |
胎儿β | -0.27 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 小脑 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG09885409 | 21 | 34697563 | IFNAR1 | 1.27E-10 | -0.008 | 4.83e-7 | DMG:JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/IFNAR1_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
CRKL | - | V-CRK肉瘤病毒CT10癌基因同源物(Avian)类似 | - | HPRD | 11167825 |
IFNA2 | ifna |Infa2 |MGC125764 |MGC125765 | 干扰素,alpha 2 | - | HPRD | 1834641 |
IFNB1 | IFB |iff |IFNB |MGC96956 | 干扰素,β1,成纤维细胞 | - | HPRD | 1834641 |
IFNW1 | - | 干扰素,欧米茄1 | - | HPRD | 1834641 |
MAPK1 | ERK |ERK2 |ERT1 |MAPK2 |p42mapk |prkm1 |prkm2 |p38 |P40 |P41 | p41mapk | 有丝分裂原激活的蛋白激酶1 | - | HPRD | 9029147 |
PIK3R1 | grb1 |P85 |p85-alpha | 磷酸肌醇3-激酶,调节亚基1(alpha) | - | HPRD,Biogrid | 10542297 |
Prkaca | MGC102831 |MGC48865 |pkaca | 蛋白激酶,cAMP依赖性,催化,α | - | HPRD | 9029147 |
PRMT1 | ANM1 |HCP1 |HRMT1L2 |IR1B4 | 蛋白精氨酸甲基转移酶1 | - | HPRD,Biogrid | 9029147 |
PTPN11 | bptp3 |CFC |MGC14433 |NS1 |PTP-1D |PTP2C |SH-PTP2 |sh-ptp3 |SHP2 | 蛋白质酪氨酸磷酸酶,非受体11型 | - | HPRD | 9029147 |
PTPN6 | HCP |HCPH |HPTP1C |PTP-1C |SH-PTP1 |SHP-1 |SHP-1L |SHP1 | 蛋白质酪氨酸磷酸酶,非受体6型 | - | HPRD | 9029147 |
PTPN6 | HCP |HCPH |HPTP1C |PTP-1C |SH-PTP1 |SHP-1 |SHP-1L |SHP1 | 蛋白质酪氨酸磷酸酶,非受体6型 | - | HPRD | 8524272|9029147 |
Stat2 | ISGF-3 |MGC59816 |P113 |Stat113 | 转录2,113KDA的信号换能器和激活剂 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 重构的复合物 |
Biogrid | 7559568|8605876 |9121453 |
Stat2 | ISGF-3 |MGC59816 |P113 |Stat113 | 转录2,113KDA的信号换能器和激活剂 | - | HPRD | 7559568 | 8605876|11786546 |
Stat3 | APRF |FLJ20882 |hies |MGC16063 | 转录3的信号换能器和激活因子(急性相反应因子) | - | HPRD,Biogrid | 8626489 |
tyk2 | JTK1 | 酪氨酸激酶2 | - | HPRD,Biogrid | 9733772 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG细胞因子细胞因子受体相互作用 | 267 | 161 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kegg Toll像受体信号通路 | 102 | 88 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg jak stat信号通路 | 155 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg天然杀伤细胞介导的细胞毒性 | 137 | 92 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta Rankl途径 | 14 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ST型I干扰素路径 | 9 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID CD8 TCR下游途径 | 65 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome干扰素αβ信号传导 | 64 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
IFNA信号的反应组调节 | 24 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome干扰素信号传导 | 159 | 116 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome免疫系统 | 933 | 616 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
免疫系统中的反应组细胞因子信号传导 | 270 | 204 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Horiuchi WTAP目标DN | 310 | 188 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mayburd对L663536 DN的反应 | 56 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gaussmann MLL AF4融合靶标C向上 | 170 | 114 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath Myc Max目标 | 775 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
霍夫曼细胞淋巴瘤DN | 39 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
罗德韦尔老化的肾脏 | 487 | 303 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝癌DN | 540 | 340 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hofmann骨髓发育异常综合症高风险DN | 20 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hofmann骨髓增生综合征风险DN | 23 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Han Satb1靶向DN | 442 | 275 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
陈代谢综合征网络 | 1210 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nakayama FGF2目标 | 29 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Worschech肿瘤逃避和耐受性 | 30 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由MYC约束 | 1103 | 714 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
惠特菲尔德细胞周期G2 | 182 | 102 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krieg缺氧不是通过KDM3A | 770 | 480 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |