概括
基因 3454
象征 IFNAR1
同义词 avp | ifn-alpha-rec | ifnar | ifnbr | ifrc
描述 干扰素α和β受体亚基1
参考 MIM:107450|HGNC:HGNC:5432|ENSEMBL:ENSG00000142166|HPRD:00126|Vega:Otthumg0000000065126
基因类型 蛋白质编码
地图位置 21q22.11
Pascal P值 0.079
胎儿β -0.27
DMG 1(#研究)
主持人 小脑

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG09885409 21 34697563 IFNAR1 1.27E-10 -0.008 4.83e-7 DMG:JAFFE_2016


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

互动者 别名b 官方全名b 实验 资源 PubMed ID
CRKL - V-CRK肉瘤病毒CT10癌基因同源物(Avian)类似 - HPRD 11167825
IFNA2 ifna |Infa2 |MGC125764 |MGC125765 干扰素,alpha 2 - HPRD 1834641
IFNB1 IFB |iff |IFNB |MGC96956 干扰素,β1,成纤维细胞 - HPRD 1834641
IFNW1 - 干扰素,欧米茄1 - HPRD 1834641
MAPK1 ERK |ERK2 |ERT1 |MAPK2 |p42mapk |prkm1 |prkm2 |p38 |P40 |P41 | p41mapk 有丝分裂原激活的蛋白激酶1 - HPRD 9029147
PIK3R1 grb1 |P85 |p85-alpha 磷酸肌醇3-激酶,调节亚基1(alpha) - HPRD,Biogrid 10542297
Prkaca MGC102831 |MGC48865 |pkaca 蛋白激酶,cAMP依赖性,催化,α - HPRD 9029147
PRMT1 ANM1 |HCP1 |HRMT1L2 |IR1B4 蛋白精氨酸甲基转移酶1 - HPRD,Biogrid 9029147
PTPN11 bptp3 |CFC |MGC14433 |NS1 |PTP-1D |PTP2C |SH-PTP2 |sh-ptp3 |SHP2 蛋白质酪氨酸磷酸酶,非受体11型 - HPRD 9029147
PTPN6 HCP |HCPH |HPTP1C |PTP-1C |SH-PTP1 |SHP-1 |SHP-1L |SHP1 蛋白质酪氨酸磷酸酶,非受体6型 - HPRD 9029147
PTPN6 HCP |HCPH |HPTP1C |PTP-1C |SH-PTP1 |SHP-1 |SHP-1L |SHP1 蛋白质酪氨酸磷酸酶,非受体6型 - HPRD 8524272|9029147
Stat2 ISGF-3 |MGC59816 |P113 |Stat113 转录2,113KDA的信号换能器和激活剂 亲和力捕获 - 韦斯特恩
重构的复合物
Biogrid 7559568|8605876
|9121453
Stat2 ISGF-3 |MGC59816 |P113 |Stat113 转录2,113KDA的信号换能器和激活剂 - HPRD 7559568 | 8605876|11786546
Stat3 APRF |FLJ20882 |hies |MGC16063 转录3的信号换能器和激活因子(急性相反应因子) - HPRD,Biogrid 8626489
tyk2 JTK1 酪氨酸激酶2 - HPRD,Biogrid 9733772


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KEGG细胞因子细胞因子受体相互作用 267 161 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kegg Toll像受体信号通路 102 88 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg jak stat信号通路 155 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg天然杀伤细胞介导的细胞毒性 137 92 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta Rankl途径 14 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ST型I干扰素路径 9 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID CD8 TCR下游途径 65 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome干扰素αβ信号传导 64 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
IFNA信号的反应组调节 24 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome干扰素信号传导 159 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome免疫系统 933 616 该途径中的所有SZGR 2.0基因
免疫系统中的反应组细胞因子信号传导 270 204 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Horiuchi WTAP目标DN 310 188 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mayburd对L663536 DN的反应 56 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gaussmann MLL AF4融合靶标C向上 170 114 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC网络 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Myc Max目标 775 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
霍夫曼细胞淋巴瘤DN 39 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗德韦尔老化的肾脏 487 303 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝癌DN 540 340 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hofmann骨髓发育异常综合症高风险DN 20 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hofmann骨髓增生综合征风险DN 23 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Han Satb1靶向DN 442 275 该途径中的所有SZGR 2.0基因
陈代谢综合征网络 1210 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nakayama FGF2目标 29 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Worschech肿瘤逃避和耐受性 30 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由MYC约束 1103 714 该途径中的所有SZGR 2.0基因
惠特菲尔德细胞周期G2 182 102 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krieg缺氧不是通过KDM3A 770 480 该途径中的所有SZGR 2.0基因