基因页面:LRRTM1
总结吗?
| GeneID | 347730年 |
| 象征 | LRRTM1 |
| 同义词 | - - - - - - |
| 描述 | 富亮氨酸重复跨膜神经1 |
| 参考 | MIM: 610867|HGNC: HGNC: 19408|运用:ENSG00000162951|HPRD: 14323|织女:OTTHUMG00000130021 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 2 p12 |
| 帕斯卡假定值 | 0.202 |
| 胎儿β | 0.982 |
| eGene | 迈尔斯的顺式和反式 |
| 支持 | G2Cdb.humanPSD G2Cdb.humanPSP |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| PMID: cooccur | 高通量文献检索 | 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。 | |
| GSMA_I | 基因组扫描分析 | Psr: 0.0004 | |
| 文学 | 高通量文献检索 | 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、精神分裂,schizotypy,神经,分裂型 | 点击显示详细信息 |
| GO_Annotation | neuro-related关键字映射到基因本体论注释 | 支安打与neuro-related关键词:2 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
eQTL注释
eQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs4975794 | chr5 | 2015329 | LRRTM1 | 347730年 | 0.09 | 反式 | ||
| rs2286499 | chr7 | 22857476 | LRRTM1 | 347730年 | 0.08 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
第三部分。基因本体论注释
| 分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0003674 | molecular_function | ND | - - - - - - | |
| 去:0005515 | 蛋白结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0008150 | biological_process | ND | - - - - - - | |
| 蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0030426 | 生长锥 | 艾达 | 轴突、树突(术语层面:5) | 17667961 |
| 去:0030424 | 轴突 | 艾达 | 神经元,轴突神经递质(术语层面:6) | 17667961 |
| 去:0005789 | 内质网的膜 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005783 | 内质网 | 艾达 | 17667961 | |
| 去:0016020 | 膜 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0016021 | 不可或缺的膜 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0009986 | 细胞表面 | 艾达 | 17667961 |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 佩雷斯TP53的目标 | 1174年 | 695年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BENPORATH SUZ12目标 | 1038年 | 678年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BENPORATH速度的目标 | 1062年 | 725年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BENPORATH ES与H3K27ME3 | 1118年 | 744年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BENPORATH PRC2目标 | 652年 | 441年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 程印的雌二醇 | 110年 | 68年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
| microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir - 208 | 164年 | 170年 | 1 | hsa - mir - 208 | AUAAGACGAGCAAAAAGCUUGU |
| miR-30-3p | 111年 | 117年 | m8 | hsa-miR-30a-3p | CUUUCAGUCGGAUGUUUGCAGC |
| hsa-miR-30e-3p | CUUUCAGUCGGAUGUUUACAGC | ||||
| mir - 320 | 153年 | 159年 | 1 | hsa - mir - 320 | AAAAGCUGGGUUGAGAGGGCGAA |
| mir - 326 | 134年 | 141年 | 1、m8 | hsa - mir - 326 | CCUCUGGGCCCUUCCUCCAG |
| mir - 378 | 282年 | 288年 | 1 | hsa - mir - 378 | CUCCUGACUCCAGGUCCUGUGU |
| mir - 499 | 164年 | 170年 | 1 | hsa - mir - 499 | UUAAGACUUGCAGUGAUGUUUAA |