Gene Page:IGFBP2

概括?
GeneID 3485
Symbol IGFBP2
同义词 IBP2|IGF-BP53
描述 insulin like growth factor binding protein 2
参考 MIM:146731|HGNC:HGNC:5471|Ensembl:ENSG00000115457|HPRD:00898|Vega:OTTHUMG00000155341
Gene type protein-coding
地图位置 2q35
Pascal P值 0.002
Fetal beta 1.608
DMG 1（＃研究）
eGene 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
Gene set name 基因组方法 描述 Info
CV:PGCnp Genome-wide Association Study GWAS
DMG:Jaffe_2016 Genome-wide DNA methylation analysis This dataset includes 2,104 probes/CpGs associated with SZ patients (n=108) compared to 136 controls at Bonferroni-adjusted P < 0.05. 1
PMID:cooccur 高通量文献搜索 Systematic search in PubMed for genes co-occurring with SCZ keywords. A total of 3027 genes were included.
GSMA_IIE 基因组扫描荟萃分析（欧洲官方样品） Psr: 0.01016
GSMA_IIA Genome scan meta-analysis (All samples) Psr: 0.00916
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症Co-occurance关键词:schizophrenia,schizophrenic,schizophrenias Click to show details

第一节遗传学和表观遗传学注释

@Differentially methylated gene

探测 Chromosome Position Nearest gene P (dis) beta（dis） FDR (dis) Study
cg05414479 2 217497892 IGFBP2 7.32e-9 -0.011 3.65e-6 DMG:Jaffe_2016

@eQTL annotation

SNP ID Chromosome Position eGene Gene Entrez ID pvalue qvalue TSS distance eQTL type
rs6599081 chr3 40273499 IGFBP2 3485 0.16 trans
RS3823550 chr7 137346101 IGFBP2 3485 0.06 trans
RS16907489 chr9 23656537 IGFBP2 3485 0.11 trans
rs12572674 chr10 107733982 IGFBP2 3485 0.09 trans
rs6095741 chr20 48666589 IGFBP2 3485 0.13 trans
rs5991662 chrX 43335796 IGFBP2 3485 0.03 trans

Section II. Transcriptome annotation

General gene expression (GTEx)

Not available

Gene expression during devlopment (BrainCloud)

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

Gene expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注：
SC: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

大脑区域没有共表达基因


Section III. Gene Ontology annotation

Molecular function GO term Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0005520 胰岛素样生长因子结合 IEA -
Biological process GO term Evidence Neuro keywords PubMed ID
去：0001558 regulation of cell growth IEA -
细胞分量 GO term Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0005576 extracellular region IEA -
GO:0005615 extracellular space IEA -

V.途径注释

Pathway name Pathway size ＃szgr 2.0基因 Info
REACTOME DIABETES PATHWAYS 133 91 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME REGULATION OF INSULIN LIKE GROWTH FACTOR IGF ACTIVITY BY INSULIN LIKE GROWTH FACTOR BINDING PROTEINS IGFBPS 16 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FOURNIER ACINAR DEVELOPMENT EARLY UP 21 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WILCOX RESPONSE TO PROGESTERONE DN 66 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌腔与间充质 450 256 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Doane对雄激素DN的反应 241 146 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GAL LEUKEMIC STEM CELL DN 244 153 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WANG LMO4 TARGETS UP 372 227 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WANG CLIM2 TARGETS UP 269 146 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TONKS TARGETS OF RUNX1 RUNX1T1 FUSION HSC DN 187 115 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SABATES COLORECTAL ADENOMA UP 141 75 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SCIBETTA KDM5B TARGETS DN 81 55 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KOKKINAKIS METHIONINE DEPRIVATION 48HR UP 128 95 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KOKKINAKIS METHIONINE DEPRIVATION 96HR UP 117 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARKEY RB1 CHRONIC LOF DN 118 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRAESSMANN APOPTOSIS BY DOXORUBICIN DN 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WANG ESOPHAGUS CANCER VS NORMAL DN 101 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MCBRYAN PUBERTAL BREAST 3 4WK UP 214 144 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MCBRYAN PUBERTAL BREAST 4 5WK UP 271 175 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McBryan Pubertal乳房6 7WK DN 79 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MCBRYAN TERMINAL END BUD UP 12 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LI在肺癌中扩增 178 108 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SCHLOSSER SERUM RESPONSE AUGMENTED BY MYC 108 74 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NAISHIRO CTNNB1 TARGETS WITH LEF1 MOTIF 8 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kang lith pdgfra up 50 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
dacosta ercc3等位基因XPCS vs ttd Up 28 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CALVET IRINOTECAN SENSITIVE VS RESISTANT DN 5 5 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LOPEZ MBD TARGETS 957 597 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GOUYER TATI TARGETS DN 17 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FRIDMAN SENESCENCE UP 77 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SCHAEFFER PROSTATE DEVELOPMENT 12HR UP 116 79 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer前列腺开发48小时 487 286 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Nanog目标 988 594 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BENPORATH SOX2 TARGETS 734 436 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onder CDH1目标1向上 140 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ROZANOV MMP14 TARGETS UP 266 171 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CERVERA SDHB TARGETS 1 UP 118 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ROSS AML WITH PML RARA FUSION 77 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SHEPARD BMYB MORPHOLINO DN 200 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee肝癌ACOX1 UP 64 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEE LIVER CANCER MYC E2F1 DN 64 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEE LIVER CANCER MYC DN 63 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEE LIVER CANCER CIPROFIBRATE UP 60 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans 882 572 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FLECHNER BIOPSY KIDNEY TRANSPLANT REJECTED VS OK DN 546 351 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ALCALAY AML BY NPM1 LOCALIZATION UP 140 83 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FERRANDO T ALL WITH MLL ENL FUSION DN 87 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PETROVA ENDOTHELIUM LYMPHATIC VS BLOOD UP 131 87 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BROWNE HCMV INFECTION 20HR UP 240 152 该途径中的所有SZGR 2.0基因
URS ADIPOCYTE DIFFERENTIATION UP 74 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Weigel氧化应激反应 35 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HARRIS HYPOXIA 81 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI TCF21 TARGETS UP 37 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHIBA RESPONSE TO TSA UP 52 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BROWNE HCMV INFECTION 8HR UP 105 73 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KANG FLUOROURACIL RESISTANCE UP 22 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BROWNE HCMV INFECTION 48HR UP 180 125 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yamazaki TCEB3靶向DN 215 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MACLACHLAN BRCA1 TARGETS UP 21 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张增殖与静止 51 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
dazard对紫外线nhek的反应 244 151 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Verrecchia对TGFB1的早期反应 58 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHU CMV 8 HR DN 53 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhu CMV全部DN 128 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI TCF21 TARGETS 2 UP 428 266 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BROWNE HCMV INFECTION 12HR UP 111 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BAELDE DIABETIC NEPHROPATHY DN 434 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Semenza HIF1目标 36 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WANG CISPLATIN RESPONSE AND XPC UP 202 115 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Verrecchia对TGFB1 C3的响应 14 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SANSOM WNT PATHWAY REQUIRE MYC 58 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WANG LSD1 TARGETS UP 24 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARTINEZ RB1 TARGETS DN 543 317 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez TP53目标DN 593 372 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARTINEZ RB1 AND TP53 TARGETS DN 591 366 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DAIRKEE CANCER PRONE RESPONSE BPA 51 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
OUYANG PROSTATE CANCER MARKERS 19 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
riggi ewing肉瘤祖先 430 288 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HUANG DASATINIB RESISTANCE DN 69 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MALONEY RESPONSE TO 17AAG UP 41 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WINTER HYPOXIA METAGENE 242 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura mapk8靶向 1305 895 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SWEET LUNG CANCER KRAS DN 435 289 该途径中的所有SZGR 2.0基因
COLINA TARGETS OF 4EBP1 AND 4EBP2 356 214 该途径中的所有SZGR 2.0基因
陈代谢综合征网络 1210 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McMurray TP53 HRAS合作响应DN 67 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MEISSNER BRAIN HCP WITH H3K4ME3 AND H3K27ME3 1069 729 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Poola侵入性乳腺癌DN 134 83 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NAKAYAMA SOFT TISSUE TUMORS PCA1 DN 74 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHANDRAN METASTASIS DN 306 191 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PANGAS TUMOR SUPPRESSION BY SMAD1 AND SMAD5 DN 157 106 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PILON KLF1 TARGETS UP 504 321 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 ETS融合的Miyagawa目标 259 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KIM GLIS2 TARGETS UP 84 61 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KATSANOU ELAVL1 TARGETS UP 169 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DELACROIX RAR BOUND ES 462 273 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ACEVEDO FGFR1 TARGETS IN PROSTATE CANCER MODEL DN 308 187 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LIM MAMMARY STEM CELL UP 489 314 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA ECM GLYCOPROTEINS 196 99 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA核心母质 275 148 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA矩阵 1028 559 该途径中的所有SZGR 2.0基因