概括?
基因ID 3487
Symbol IGFBP4
同义词 BP-4|HT29-IGFBP|IBP4|IGFBP-4
描述 insulin like growth factor binding protein 4
参考 MIM:146733|HGNC:HGNC:5473|Ensembl:ENSG00000141753|HPRD:00900|Vega:Otthumg00000133326
基因type protein-coding
地图位置 17q21.2
Pascal P值 0.009
Sherlock P值 0.49
Fetal beta -0.846
eGene 额叶皮质BA9

数据源中的基因
基因set name 基因组方法 描述 Info
简历:PGCNP Genome-wide Association Study GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 系统搜索PubMed的共病的基因with SCZ keywords. A total of 3027 genes were included.
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 Click to show details

第一节遗传学和表观遗传学注释


Section II. Transcriptome annotation

基因ral gene expression (GTEx)

Not available

基因expression during devlopment (BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

基因expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注:
SC: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

Top co-expressed genes in brain regions

Top 10 positively co-expressed genes
基因 Pearson's Correlation Spearman's Correlation
SIN3B 0.94 0.95
RUSC2 0.94 0.95
ube2o 0.94 0.94
DHX30 0.94 0.93
MBD1 0.94 0.93
Neurl4 0.93 0.94
FOXK2 0.93 0.95
BRSK2 0.93 0.92
URG4 0.93 0.91
AP3D1 0.93 0.93
Top 10 negatively co-expressed genes
基因 Pearson's Correlation Spearman's Correlation
AF347015.31 -0.85 -0.83
MT-CO2 -0.83 -0.83
AF347015.21 -0.82 -0.87
AF347015.8 -0.80 -0.82
AF347015.33 -0.80 -0.78
MT-CYB -0.80 -0.79
AF347015.27 -0.79 -0.81
higd1b -0.78 -0.79
AF347015.2 -0.76 -0.75
AF347015.15 -0.76 -0.77

V.途径注释

Pathway name Pathway size #szgr 2.0基因 Info
PID WNT SIGNALING PATHWAY 28 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME DIABETES PATHWAYS 133 91 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME REGULATION OF INSULIN LIKE GROWTH FACTOR IGF ACTIVITY BY INSULIN LIKE GROWTH FACTOR BINDING PROTEINS IGFBPS 16 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Puiffe入侵被腹水抑制 82 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
刘cmyb靶向 165 106 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NOJIMA SFRP2 TARGETS DN 25 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NUP98 HOXA9 Fusion 3D的Takeda目标 182 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TAKEDA TARGETS OF NUP98 HOXA9 FUSION 8D UP 157 91 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TAKEDA TARGETS OF NUP98 HOXA9 FUSION 16D DN 143 83 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TONKS TARGETS OF RUNX1 RUNX1T1 FUSION HSC DN 187 115 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GOZGIT ESR1 TARGETS DN 781 465 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KOKKINAKIS METHIONINE DEPRIVATION 48HR DN 64 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kokkinakis甲硫氨酸剥夺96小时 117 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHIARADONNA NEOPLASTIC TRANSFORMATION CDC25 DN 153 100 该途径中的所有SZGR 2.0基因
血清剥夺的Graessmann凋亡 552 347 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRAESSMANN APOPTOSIS BY DOXORUBICIN UP 1142 669 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GAUSSMANN MLL AF4 FUSION TARGETS E DN 22 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MCBRYAN PUBERTAL BREAST 4 5WK DN 196 131 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McBryan Pubertal乳房6 7WK UP 197 135 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HAMAI APOPTOSIS VIA TRAIL UP 584 356 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PAX3 FOXO1融合的Ebauer目标 207 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FARMER BREAST CANCER APOCRINE VS LUMINAL 326 213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FARMER BREAST CANCER BASAL VS LULMINAL 330 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SCHRAMM INHBA TARGETS DN 24 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kang lith pdgfra up 50 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
沙诺田顺铂耐药性DN 51 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
约翰逊脑癌早期与晚期DN 45 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HATADA METHYLATED IN LUNG CANCER UP 390 236 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WILLIAMS ESR1 TARGETS UP 26 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GROSS HYPOXIA VIA ELK3 ONLY DN 44 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
INGRAM SHH TARGETS UP 127 79 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FRIDMAN SENESCENCE UP 77 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FRIDMAN IMMORTALIZATION DN 34 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SCHAEFFER PROSTATE DEVELOPMENT 12HR DN 57 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SCHAEFFER PROSTATE DEVELOPMENT 48HR DN 428 306 该途径中的所有SZGR 2.0基因
AMIT EGF RESPONSE 480 HELA 164 118 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NIKOLSKY BREAST CANCER 17Q11 Q21 AMPLICON 133 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ONDER CDH1 TARGETS 2 UP 256 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BYSTRYKH HEMATOPOIESIS STEM CELL AND BRAIN QTL TRANS 185 114 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FRASOR RESPONSE TO ESTRADIOL UP 37 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SANA TNF SIGNALING DN 90 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TARTE PLASMA CELL VS PLASMABLAST UP 398 262 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZUCCHI METASTASIS UP 43 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
IIZUKA LIVER CANCER PROGRESSION L1 G1 UP 25 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FLECHNER BIOPSY KIDNEY TRANSPLANT REJECTED VS OK DN 546 351 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NING CHRONIC OBSTRUCTIVE PULMONARY DISEASE UP 157 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FLECHNER BIOPSY KIDNEY TRANSPLANT OK VS DONOR UP 555 346 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SANSOM APC TARGETS UP 126 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 FLI1融合的Zhang目标 88 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
松本自然杀手差分 475 313 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GILDEA METASTASIS 30 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
IGLESIAS E2F TARGETS UP 151 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEE CALORIE RESTRICTION NEOCORTEX UP 83 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hendricks Smarca4靶向 56 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAMAZAKI TCEB3 TARGETS UP 175 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SIMBULAN PARP1 TARGETS UP 31 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BROWNE HCMV INFECTION 48HR DN 504 323 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MACLACHLAN BRCA1 TARGETS UP 21 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MOREIRA RESPONSE TO TSA UP 28 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Verrecchia延迟对TGFB1的响应 39 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MCLACHLAN DENTAL CARIES DN 245 144 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TSENG IRS1 TARGETS DN 135 88 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BURTON ADIPOGENESIS 4 48 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kayo卡路里限制肌肉 95 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
XU GH1 AUTOCRINE TARGETS DN 142 94 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WANG SMARCE1 TARGETS UP 280 183 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HAN JNK SINGALING DN 39 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
麦克拉克兰牙科龋齿 253 147 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHONG SECRETOME OF LUNG CANCER AND MACROPHAGE 77 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHONG SECRETOME OF LUNG CANCER AND ENDOTHELIUM 66 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gavin Foxp3目标集群P3 160 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SANSOM APC TARGETS 212 121 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HELLER SILENCED BY METHYLATION UP 282 183 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARTINEZ RB1 TARGETS DN 543 317 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez TP53目标DN 593 372 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARTINEZ RB1 AND TP53 TARGETS DN 591 366 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Massarweh他莫昔芬抵抗DN 258 160 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MASSARWEH RESPONSE TO ESTRADIOL 61 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多的正常组织与肝肿瘤DN相邻 354 216 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ACEVEDO LIVER CANCER DN 540 340 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌基础DN 701 446 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BONOME OVARIAN CANCER SURVIVAL SUBOPTIMAL DEBULKING 510 309 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHENG GLIOBLASTOMA PLASTICITY UP 250 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BOCHKIS FOXA2 TARGETS 425 261 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WEST ADRENOCORTICAL TUMOR DN 546 362 该途径中的所有SZGR 2.0基因
huper乳房基础与腔内DN 59 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WANG NEOPLASTIC TRANSFORMATION BY CCND1 MYC 21 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LINDSTEDT DENDRITIC CELL MATURATION C 69 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Vantveer乳腺癌ESR1 UP 167 99 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Han Satb1靶向 395 249 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MEISSNER BRAIN HCP WITH H3K4ME3 AND H3K27ME3 1069 729 该途径中的所有SZGR 2.0基因
cro骨基质刺激 60 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CROONQUIST NRAS VS STROMAL STIMULATION DN 99 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Coulouarn颞TGFB1签名DN 138 99 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ONO AML1 TARGETS DN 41 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ONO FOXP3 TARGETS DN 42 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
STEIN ESR1 TARGETS 85 55 该途径中的所有SZGR 2.0基因
STEIN ESTROGEN RESPONSE NOT VIA ESRRA 18 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Verrecchia对TGFB1 C6的反应 5 5 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Karlsson TGFB1靶向DN 207 139 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WANG RESPONSE TO GSK3 INHIBITOR SB216763 DN 374 217 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DUTERTRE ESTRADIOL RESPONSE 6HR UP 229 149 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DUTERTRE ESTRADIOL RESPONSE 24HR UP 324 193 该途径中的所有SZGR 2.0基因
王掺杂基因被SIRT1抑制 28 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WIERENGA STAT5A TARGETS UP 217 131 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WIERENGA STAT5A TARGETS GROUP1 136 76 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BHAT ESR1目标不是通过AKT1向上的 211 131 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BHAT ESR1通过AKT1 UP目标 281 183 该途径中的所有SZGR 2.0基因
JOHNSTONE PARVB TARGETS 2 UP 140 94 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PASINI SUZ12 TARGETS DN 315 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TORCHIA TARGETS OF EWSR1 FLI1 FUSION DN 321 200 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KATSANOU ELAVL1 TARGETS DN 148 88 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SERVITJA LIVER HNF1A TARGETS DN 157 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LIM MAMMARY STEM CELL UP 489 314 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA ECM GLYCOPROTEINS 196 99 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA核心母质 275 148 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA矩阵 1028 559 该途径中的所有SZGR 2.0基因