基因页:NMNAT3
概括?
基因 | 349565 |
象征 | NMNAT3 |
同义词 | FKSG76 | PNAT-3 | PNAT33 |
描述 | 烟酰胺核苷酸腺苷转移酶3 |
参考 | MIM:608702|HGNC:HGNC:20989|ENSEMBL:ENSG00000163864|HPRD:16370|Vega:Otthumg00000159951 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 3Q23 |
Pascal P值 | 0.043 |
Sherlock P值 | 0.124 |
主持人 | 前扣带回皮层BA24 小脑半球 小脑 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS10975953 | Chr9 | 6996620 | NMNAT3 | 349565 | 0.16 | 反式 | ||
RS9822952 | 3 | 139385257 | NMNAT3 | ENSG00000163864.10 | 7.895e-7 | 0.01 | 11602 | gtex_brain_ba24 |
RS7639511 | 3 | 139392368 | NMNAT3 | ENSG00000163864.10 | 6.791E-7 | 0.01 | 4491 | gtex_brain_ba24 |
RS6798004 | 3 | 139392922 | NMNAT3 | ENSG00000163864.10 | 1.441E-6 | 0.01 | 3937 | gtex_brain_ba24 |
RS6785099 | 3 | 139392951 | NMNAT3 | ENSG00000163864.10 | 6.791E-7 | 0.01 | 3908 | gtex_brain_ba24 |
RS4327348 | 3 | 139414375 | NMNAT3 | ENSG00000163864.10 | 1.416E-6 | 0.01 | -17516 | gtex_brain_ba24 |
RS4532089 | 3 | 139418599 | NMNAT3 | ENSG00000163864.10 | 2.167E-6 | 0.01 | -21740 | gtex_brain_ba24 |
RS4640518 | 3 | 139420246 | NMNAT3 | ENSG00000163864.10 | 2.354e-6 | 0.01 | -23387 | gtex_brain_ba24 |
RS7648532 | 3 | 139429937 | NMNAT3 | ENSG00000163864.10 | 2.382E-6 | 0.01 | -33078 | gtex_brain_ba24 |
RS4683684 | 3 | 139438653 | NMNAT3 | ENSG00000163864.10 | 3.666e-7 | 0.01 | -41794 | gtex_brain_ba24 |
RS7649565 | 3 | 139440620 | NMNAT3 | ENSG00000163864.10 | 3.656E-7 | 0.01 | -43761 | gtex_brain_ba24 |
RS7619522 | 3 | 139442437 | NMNAT3 | ENSG00000163864.10 | 4.123E-7 | 0.01 | -45578 | gtex_brain_ba24 |
RS9838164 | 3 | 139445900 | NMNAT3 | ENSG00000163864.10 | 3.656E-7 | 0.01 | -49041 | gtex_brain_ba24 |
RS13073922 | 3 | 139449872 | NMNAT3 | ENSG00000163864.10 | 3.656E-7 | 0.01 | -53013 | gtex_brain_ba24 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/NMNAT3_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Kegg Nicotinate和Nicotinamide代谢 | 24 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
维生素和辅因子的反应组代谢 | 51 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Koyama Sema3b靶向DN | 411 | 249 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
道格拉斯BMI1靶向 | 566 | 371 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
肝癌DN中的阿塞维多甲基化 | 940 | 425 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Noushmehr GBM被甲基化沉默 | 50 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
棕熊UVC响应很晚 | 317 | 190 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |