基因页:学院
概括?
基因 | 35 |
象征 | 学院 |
同义词 | Acad3 | SCAD |
描述 | 酰基-COA脱氢酶,C-2至C-3短链 |
参考 | MIM:606885|HGNC:HGNC:90|ENSEMBL:ENSG00000122971|HPRD:06053|Vega:Otthumg00000169203 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 12Q24.31 |
Pascal P值 | 0.002 |
主持人 | 前扣带回皮层BA24 尾状基底神经节 小脑半球 小脑 皮质 额叶皮质BA9 海马 下丘脑 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS17070904 | CHR18 | 60917055 | 学院 | 35 | 0.18 | 反式 | ||
RS10853963 | CHR19 | 2909032 | 学院 | 35 | 0.13 | 反式 | ||
RS2005455 | 12 | 121128699 | 学院 | ENSG00000122971.4 | 6.777E-7 | 0.01 | -34839 | gtex_brain_ba24 |
RS10431385 | 12 | 121128882 | 学院 | ENSG00000122971.4 | 6.777E-7 | 0.01 | -34656 | gtex_brain_ba24 |
RS998727 | 12 | 121149064 | 学院 | ENSG00000122971.4 | 2.725E-7 | 0.01 | -14474 | gtex_brain_ba24 |
RS57623705 | 12 | 121151062 | 学院 | ENSG00000122971.4 | 8.223E-7 | 0.01 | -12476 | gtex_brain_ba24 |
RS34734847 | 12 | 121154221 | 学院 | ENSG00000122971.4 | 9.859E-7 | 0.01 | -9317 | gtex_brain_ba24 |
RS56273049 | 12 | 121156041 | 学院 | ENSG00000122971.4 | 9.864e-7 | 0.01 | -7497 | gtex_brain_ba24 |
RS35360964 | 12 | 121156290 | 学院 | ENSG00000122971.4 | 9.864e-7 | 0.01 | -7248 | gtex_brain_ba24 |
RS56179458 | 12 | 121157535 | 学院 | ENSG00000122971.4 | 9.848e-7 | 0.01 | -6003 | gtex_brain_ba24 |
RS55730005 | 12 | 121157536 | 学院 | ENSG00000122971.4 | 1.035E-6 | 0.01 | -6002 | gtex_brain_ba24 |
RS3752531 | 12 | 121157851 | 学院 | ENSG00000122971.4 | 9.848e-7 | 0.01 | -5687 | gtex_brain_ba24 |
RS2948149 | 12 | 121162854 | 学院 | ENSG00000122971.4 | 1.084E-7 | 0.01 | -684 | gtex_brain_ba24 |
RS3021338 | 12 | 121162989 | 学院 | ENSG00000122971.4 | 9.021E-7 | 0.01 | -549 | gtex_brain_ba24 |
RS2239760 | 12 | 121163518 | 学院 | ENSG00000122971.4 | 1.123E-7 | 0.01 | -20 | gtex_brain_ba24 |
RS12302189 | 12 | 121199329 | 学院 | ENSG00000122971.4 | 9.985e-7 | 0.01 | 35791 | gtex_brain_ba24 |
RS10437837 | 12 | 121211693 | 学院 | ENSG00000122971.4 | 9.985e-7 | 0.01 | 48155 | gtex_brain_ba24 |
RS141767075 | 12 | 121219266 | 学院 | ENSG00000122971.4 | 9.985e-7 | 0.01 | 55728 | gtex_brain_ba24 |
RS10849789 | 12 | 121231461 | 学院 | ENSG00000122971.4 | 9.985e-7 | 0.01 | 67923 | gtex_brain_ba24 |
RS73229135 | 12 | 121250315 | 学院 | ENSG00000122971.4 | 9.985e-7 | 0.01 | 86777 | gtex_brain_ba24 |
RS10849795 | 12 | 121251889 | 学院 | ENSG00000122971.4 | 9.985e-7 | 0.01 | 88351 | gtex_brain_ba24 |
RS145414824 | 12 | 121252464 | 学院 | ENSG00000122971.4 | 9.992E-7 | 0.01 | 88926 | gtex_brain_ba24 |
RS11065276 | 12 | 121254654 | 学院 | ENSG00000122971.4 | 9.985e-7 | 0.01 | 91116 | gtex_brain_ba24 |
RS10849796 | 12 | 121265642 | 学院 | ENSG00000122971.4 | 9.985e-7 | 0.01 | 102104 | gtex_brain_ba24 |
RS73229156 | 12 | 121270733 | 学院 | ENSG00000122971.4 | 1.49E-6 | 0.01 | 107195 | gtex_brain_ba24 |
RS10849798 | 12 | 121273374 | 学院 | ENSG00000122971.4 | 9.984e-7 | 0.01 | 109836 | gtex_brain_ba24 |
RS10849799 | 12 | 121274189 | 学院 | ENSG00000122971.4 | 9.981E-7 | 0.01 | 110651 | gtex_brain_ba24 |
RS10849808 | 12 | 121315630 | 学院 | ENSG00000122971.4 | 9.985e-7 | 0.01 | 152092 | gtex_brain_ba24 |
RS10849809 | 12 | 121316726 | 学院 | ENSG00000122971.4 | 9.985e-7 | 0.01 | 153188 | gtex_brain_ba24 |
RS10431373 | 12 | 121319619 | 学院 | ENSG00000122971.4 | 9.985e-7 | 0.01 | 156081 | gtex_brain_ba24 |
RS74416604 | 12 | 121341495 | 学院 | ENSG00000122971.4 | 1.013E-6 | 0.01 | 177957 | gtex_brain_ba24 |
RS10849817 | 12 | 121349427 | 学院 | ENSG00000122971.4 | 9.985e-7 | 0.01 | 185889 | gtex_brain_ba24 |
RS11065331 | 12 | 121359856 | 学院 | ENSG00000122971.4 | 5.166E-7 | 0.01 | 196318 | gtex_brain_ba24 |
RS11065341 | 12 | 121369960 | 学院 | ENSG00000122971.4 | 7.657E-7 | 0.01 | 206422 | gtex_brain_ba24 |
RS11065344 | 12 | 121372509 | 学院 | ENSG00000122971.4 | 1E-6 | 0.01 | 208971 | gtex_brain_ba24 |
RS10849821 | 12 | 121377329 | 学院 | ENSG00000122971.4 | 1.165E-6 | 0.01 | 213791 | gtex_brain_ba24 |
RS11065355 | 12 | 121378477 | 学院 | ENSG00000122971.4 | 1.152E-6 | 0.01 | 214939 | gtex_brain_ba24 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/ACADS_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
STMN1 | 0.91 | 0.89 |
STMN2 | 0.90 | 0.88 |
CDC42 | 0.90 | 0.90 |
PWP1 | 0.89 | 0.89 |
NT5C3 | 0.89 | 0.90 |
抢 | 0.89 | 0.90 |
ASNSD1 | 0.88 | 0.90 |
ppp3cc | 0.88 | 0.87 |
CCDC90B | 0.88 | 0.88 |
ACAT2 | 0.88 | 0.90 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.27 | -0.71 | -0.78 |
AF347015.33 | -0.70 | -0.77 |
MT-CO2 | -0.69 | -0.76 |
HLA-F | -0.69 | -0.73 |
mt-cyb | -0.69 | -0.77 |
AF347015.8 | -0.68 | -0.77 |
AF347015.15 | -0.68 | -0.78 |
AF347015.31 | -0.68 | -0.76 |
AF347015.2 | -0.67 | -0.80 |
AF347015.9 | -0.64 | -0.75 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
kegg脂肪酸代谢 | 42 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kegg Valine亮氨酸和异亮氨酸降解 | 44 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg butanoate代谢 | 34 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组线粒体脂肪酸β氧化 | 14 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
脂质和脂蛋白的反应组代谢 | 478 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组脂肪酸三酰甘油和酮体代谢 | 168 | 115 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bidus转移DN | 161 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
王·巴雷特(Wang Barretts)食道 | 51 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Vantveer乳腺癌转移 | 56 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MLL AF9融合的Kumar目标 | 405 | 264 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
RUAN对TNF DN的反应 | 84 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kaab心脏中心与心室DN | 261 | 183 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
玛丽亚达森对姜黄素苏琳克5的反应 | 23 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
JI对FSH的响应 | 74 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gerhold脂肪形成 | 49 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伯顿成生成6 | 189 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
李肝癌 | 49 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝癌DN | 540 | 340 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝肿瘤与正常的邻近组织DN | 274 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mootha Human Mitodb 6 2002 | 429 | 260 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mootha PGC | 420 | 269 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
李肝癌的生存 | 185 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mootha线粒体 | 447 | 277 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Keshelava多种耐药性 | 88 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hoshida肝癌亚类S3 | 266 | 180 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
开罗肝母细胞瘤DN | 267 | 160 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mootha FFA氧气 | 22 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
wakabayashi脂肪生成pparg rxra绑定36小时 | 152 | 88 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D | 882 | 506 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |