概括
基因 35
象征 学院
同义词 Acad3 | SCAD
描述 酰基-COA脱氢酶,C-2至C-3短链
参考 MIM:606885|HGNC:HGNC:90|ENSEMBL:ENSG00000122971|HPRD:06053|Vega:Otthumg00000169203
基因类型 蛋白质编码
地图位置 12Q24.31
Pascal P值 0.002
主持人 前扣带回皮层BA24
尾状基底神经节
小脑半球
小脑
皮质
额叶皮质BA9
海马
下丘脑
迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS17070904 CHR18 60917055 学院 35 0.18 反式
RS10853963 CHR19 2909032 学院 35 0.13 反式
RS2005455 12 121128699 学院 ENSG00000122971.4 6.777E-7 0.01 -34839 gtex_brain_ba24
RS10431385 12 121128882 学院 ENSG00000122971.4 6.777E-7 0.01 -34656 gtex_brain_ba24
RS998727 12 121149064 学院 ENSG00000122971.4 2.725E-7 0.01 -14474 gtex_brain_ba24
RS57623705 12 121151062 学院 ENSG00000122971.4 8.223E-7 0.01 -12476 gtex_brain_ba24
RS34734847 12 121154221 学院 ENSG00000122971.4 9.859E-7 0.01 -9317 gtex_brain_ba24
RS56273049 12 121156041 学院 ENSG00000122971.4 9.864e-7 0.01 -7497 gtex_brain_ba24
RS35360964 12 121156290 学院 ENSG00000122971.4 9.864e-7 0.01 -7248 gtex_brain_ba24
RS56179458 12 121157535 学院 ENSG00000122971.4 9.848e-7 0.01 -6003 gtex_brain_ba24
RS55730005 12 121157536 学院 ENSG00000122971.4 1.035E-6 0.01 -6002 gtex_brain_ba24
RS3752531 12 121157851 学院 ENSG00000122971.4 9.848e-7 0.01 -5687 gtex_brain_ba24
RS2948149 12 121162854 学院 ENSG00000122971.4 1.084E-7 0.01 -684 gtex_brain_ba24
RS3021338 12 121162989 学院 ENSG00000122971.4 9.021E-7 0.01 -549 gtex_brain_ba24
RS2239760 12 121163518 学院 ENSG00000122971.4 1.123E-7 0.01 -20 gtex_brain_ba24
RS12302189 12 121199329 学院 ENSG00000122971.4 9.985e-7 0.01 35791 gtex_brain_ba24
RS10437837 12 121211693 学院 ENSG00000122971.4 9.985e-7 0.01 48155 gtex_brain_ba24
RS141767075 12 121219266 学院 ENSG00000122971.4 9.985e-7 0.01 55728 gtex_brain_ba24
RS10849789 12 121231461 学院 ENSG00000122971.4 9.985e-7 0.01 67923 gtex_brain_ba24
RS73229135 12 121250315 学院 ENSG00000122971.4 9.985e-7 0.01 86777 gtex_brain_ba24
RS10849795 12 121251889 学院 ENSG00000122971.4 9.985e-7 0.01 88351 gtex_brain_ba24
RS145414824 12 121252464 学院 ENSG00000122971.4 9.992E-7 0.01 88926 gtex_brain_ba24
RS11065276 12 121254654 学院 ENSG00000122971.4 9.985e-7 0.01 91116 gtex_brain_ba24
RS10849796 12 121265642 学院 ENSG00000122971.4 9.985e-7 0.01 102104 gtex_brain_ba24
RS73229156 12 121270733 学院 ENSG00000122971.4 1.49E-6 0.01 107195 gtex_brain_ba24
RS10849798 12 121273374 学院 ENSG00000122971.4 9.984e-7 0.01 109836 gtex_brain_ba24
RS10849799 12 121274189 学院 ENSG00000122971.4 9.981E-7 0.01 110651 gtex_brain_ba24
RS10849808 12 121315630 学院 ENSG00000122971.4 9.985e-7 0.01 152092 gtex_brain_ba24
RS10849809 12 121316726 学院 ENSG00000122971.4 9.985e-7 0.01 153188 gtex_brain_ba24
RS10431373 12 121319619 学院 ENSG00000122971.4 9.985e-7 0.01 156081 gtex_brain_ba24
RS74416604 12 121341495 学院 ENSG00000122971.4 1.013E-6 0.01 177957 gtex_brain_ba24
RS10849817 12 121349427 学院 ENSG00000122971.4 9.985e-7 0.01 185889 gtex_brain_ba24
RS11065331 12 121359856 学院 ENSG00000122971.4 5.166E-7 0.01 196318 gtex_brain_ba24
RS11065341 12 121369960 学院 ENSG00000122971.4 7.657E-7 0.01 206422 gtex_brain_ba24
RS11065344 12 121372509 学院 ENSG00000122971.4 1E-6 0.01 208971 gtex_brain_ba24
RS10849821 12 121377329 学院 ENSG00000122971.4 1.165E-6 0.01 213791 gtex_brain_ba24
RS11065355 12 121378477 学院 ENSG00000122971.4 1.152E-6 0.01 214939 gtex_brain_ba24

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
STMN1 0.91 0.89
STMN2 0.90 0.88
CDC42 0.90 0.90
PWP1 0.89 0.89
NT5C3 0.89 0.90
0.89 0.90
ASNSD1 0.88 0.90
ppp3cc 0.88 0.87
CCDC90B 0.88 0.88
ACAT2 0.88 0.90
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.27 -0.71 -0.78
AF347015.33 -0.70 -0.77
MT-CO2 -0.69 -0.76
HLA-F -0.69 -0.73
mt-cyb -0.69 -0.77
AF347015.8 -0.68 -0.77
AF347015.15 -0.68 -0.78
AF347015.31 -0.68 -0.76
AF347015.2 -0.67 -0.80
AF347015.9 -0.64 -0.75

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg脂肪酸代谢 42 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kegg Valine亮氨酸和异亮氨酸降解 44 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg butanoate代谢 34 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组线粒体脂肪酸β氧化 14 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
脂质和脂蛋白的反应组代谢 478 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组脂肪酸三酰甘油和酮体代谢 168 115 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bidus转移DN 161 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
王·巴雷特(Wang Barretts)食道 51 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Vantveer乳腺癌转移 56 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MLL AF9融合的Kumar目标 405 264 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RUAN对TNF DN的反应 84 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kaab心脏中心与心室DN 261 183 该途径中的所有SZGR 2.0基因
玛丽亚达森对姜黄素苏琳克5的反应 23 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
JI对FSH的响应 74 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gerhold脂肪形成 49 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伯顿成生成6 189 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
李肝癌 49 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝癌DN 540 340 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝肿瘤与正常的邻近组织DN 274 165 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mootha Human Mitodb 6 2002 429 260 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mootha PGC 420 269 该途径中的所有SZGR 2.0基因
李肝癌的生存 185 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mootha线粒体 447 277 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Keshelava多种耐药性 88 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hoshida肝癌亚类S3 266 180 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝母细胞瘤DN 267 160 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mootha FFA氧气 22 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
wakabayashi脂肪生成pparg rxra绑定36小时 152 88 该途径中的所有SZGR 2.0基因
wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D 882 506 该途径中的所有SZGR 2.0基因