概括?
GeneID 351
Symbol APP
Synonyms AAA|ABETA|ABPP|AD1|APPI|CTFgamma|CVAP|PN-II|PN2
Description 淀粉样β前体蛋白
参考 MIM:104760|HGNC:HGNC:620|Ensembl:ENSG00000142192|HPRD:00100|Vega:OTTHUMG00000078438
Gene type protein-coding
地图位置 21q21.3
Pascal p-value 0.079
Sherlock P值 0.726
Fetal beta -1.23
DMG 1(#研究)
支持 COMPOSITESET
Darnell FMRP targets
Ascano FMRP targets

数据源中的基因
基因集名称 Method of gene set Description Info
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
CV:PGCnp 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Nishioka_2013 Genome-wide DNA methylation analysis The authors investigated the methylation profiles of DNA in peripheral blood cells from 18 patients with first-episode schizophrenia (FESZ) and from 15 normal controls. 1
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 Co-occurance with Schizophrenia keywords: schizophrenia,schizophrenic,schizophrenics,schizophrenias 点击to show details
网络 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 Contribution to shortest path in PPI network: 8.0457

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 Chromosome Position 最近的基因 P (dis) beta(dis) FDR (dis) Study
CG13169373 21 27542843 APP -0.027 0.32 DMG:Nishioka_2013


Section II. Transcriptome annotation

General gene expression (GTEx)

无法使用

Gene expression during devlopment (BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

大脑区域没有共表达基因


Section III. Gene Ontology annotation

Molecular function 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
去:0004867 serine-type endopeptidase inhibitor activity 艾达 10652580
去:0004867 serine-type endopeptidase inhibitor activity NAS 11279603
: 0005506 iron ion binding IEA -
: 0005507 copper ion binding IEA -
: 0008201 heparin binding IEA -
: 0008270 zinc ion binding IEA -
去:0033130 acetylcholine receptor binding IPI 10681545
: 0042802 相同的蛋白质结合 IPI 16286452
: 0046872 metal ion binding IEA -
Biological process 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
: 0007155 细胞粘附 IEA -
: 0007219 Notch信号通路 IEA -
去:0006915 apoptosis IEA -
: 0006878 细胞铜离子稳态 塔斯 15910549
: 0006897 endocytosis IEA -
GO:0050905 neuromuscular process NAS 7593229
Cellular component 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
: 0005794 Golgi apparatus 艾达 18029348
: 0005576 extracellular region EXP 2110384
: 0005576 extracellular region 塔斯 10806211
: 0005737 细胞质 艾达 18029348
: 0009986 cell surface 艾达 7593229
去:0005905 涂层坑 IEA -
去:0005886 质膜 艾达 18029348
去:0005887 质膜的积分 塔斯 10806211
GO:0031093 platelet alpha granule lumen EXP 2110384

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

Interactors Aliases B Official full name B Experimental 资源 PubMed ID
ABL1 ABL |JTK7 |BCR/ABL |c-abl |P150 |V-ABL C-ABL癌基因1,受体酪氨酸激酶 - HPRD 11279131
ACHE Arache |n-ache |是 acetylcholinesterase (Yt blood group) - HPRD,Biogrid 12427014
APBA1 D9S411E | MINT1 | X11 | X11A | X11ALPHA 淀粉样β(A4)前体蛋白-binding, family A, member 1 - HPRD,Biogrid 8887653
APBA1 D9S411E | MINT1 | X11 | X11A | X11ALPHA 淀粉样β(A4)前体蛋白-binding, family A, member 1 AppSwe与X11-Alpha互动。 绑定 12849748|14756819
APBA1 D9S411E | MINT1 | X11 | X11A | X11ALPHA 淀粉样β(A4)前体蛋白-binding, family A, member 1 Beta-App与X11相互作用。 绑定 8887653
APBA2 D15S1518E | HsT16821 | LIN-10 | MGC99508 | MGC:14091 | MINT2 | X11L 淀粉样β(A4)前体蛋白-binding, family A, member 2 - HPRD,Biogrid 9890987
APBA3 MGC:15815 | X11L2 | mint3 淀粉样β(A4)前体蛋白-binding, family A, member 3 - HPRD,Biogrid 10049767
APBB1 FE65 | MGC:9072 | RIR 淀粉样β(A4)前体蛋白-binding, family B, member 1 (Fe65) Affinity Capture-Western
Reconstituted Complex
两个杂交
BioGRID 8855266|8887653
|9045663|9837937
|10081969
APBB1 FE65 | MGC:9072 | RIR 淀粉样β(A4)前体蛋白-binding, family B, member 1 (Fe65) - HPRD 8887653|8955346
|9045663|9799084
|9837937|11085987
APBB2 DKFZp434E033 | FE65L | FE65L1 | MGC35575 淀粉样β(A4)前体蛋白-binding, family B, member 2 - HPRD,Biogrid 8855266|14527950
APBB3 Fe65l2 |MGC150555 |MGC87674 |SRA 淀粉样β(A4)前体蛋白-binding, family B, member 3 - HPRD,Biogrid 10081969 | 14527950
apoe AD2 | LPG | MGC1571 | apoprotein apolipoprotein E - HPRD 10559559
APP AAA | ABETA | ABPP | AD1 | APPI | CTFgamma | CVAP | PN2 淀粉样β(A4)前体蛋白 APP (Abeta) isoform b forms homodimers, homotrimers and oligomers. 绑定 15834427
AppBP2 HS.84084 |KIAA0228 |pat1 淀粉样β前体蛋白(cytoplasmic tail) binding protein 2 - HPRD,Biogrid 9843960
BCAP31 6C6-AG | BAP31 | CDM | DXS1357E B-cell receptor-associated protein 31 - HPRD,Biogrid 12529377
BGN DSPG1 | PG-S1 | PGI | SLRR1A 大扫描 - HPRD,Biogrid 7793988
BLMH BH | BMH 博来霉素水解酶 - HPRD,Biogrid 10973933
卡尔 CRT |FLJ26680 |ro |SSA |CC1QR 钙网蛋白 - HPRD,Biogrid 11378243
CASP4 ICE(rel)II | ICEREL-II | ICH-2 | Mih1/TX | TX caspase 4,与凋亡相关的半胱氨酸肽酶 - HPRD 15123740
CASP8 ALPS2B | CAP4 | FLICE | FLJ17672 | MACH | MCH5 | MGC78473 caspase 8,与凋亡相关的半胱氨酸肽酶 - HPRD 10911620
CAV1 CAV | MSTP085 | VIP21 caveolin 1, caveolae protein, 22kDa - HPRD,Biogrid 9553108
CLSTN1 ALC-ALPHA | CSTN1 | FLJ32258 | KIAA0911 | PIK3CD | XB31alpha | alcalpha1 | alcalpha2 Calsyntenin 1 - HPRD,Biogrid 15037614
COL1A2 OI4 胶原蛋白,I型,Alpha 2 - HPRD 7688497
COL25A1 clac |CLACP 胶原蛋白,XXV类型,Alpha 1 - HPRD,Biogrid 11927537
COL4A1 arresten 胶原蛋白,IV型,Alpha 1 - HPRD 9136074
COL4A2 DKFZP686I14213 |FLJ22259 胶原蛋白,IV型,Alpha 2 - HPRD 9136074
COL4A3 - 胶原蛋白,IV型,Alpha 3(Goodpasture抗原) - HPRD 9136074
COL4A5 asln |ATS |CA54 |MGC167109 |MGC42377 胶原蛋白,IV型,Alpha 5 - HPRD 9136074
COL4A6 MGC88184 胶原蛋白,IV型,Alpha 6 - HPRD 9136074
DAB1 - 残疾同源1(果蝇) - HPRD,Biogrid 10460257
DAB1 - 残疾同源1(果蝇) - HPRD 9837937|10460257
DAB2 DOC-2 | DOC2 | FLJ26626 残疾同源物2,有丝分裂原反应性磷蛋白(果蝇) Reconstituted Complex BioGRID 11247302
F12 hae3 |哈克斯|哈夫 凝血因子XII(Hageman因子) - HPRD 11589915
fbln1 fbln 斐杜蛋白1 - HPRD,Biogrid 11238726
GAPDH G3PD |GAPD |MGC88685 glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase - HPRD 8473906
GRB2 ASH | EGFRBP-GRB2 | Grb3-3 | MST084 | MSTP084 growth factor receptor-bound protein 2 - HPRD 12485888
GSN DKFZP313L0718 gelsolin (amyloidosis, Finnish type) - HPRD,Biogrid 10329371
hadhb ECHB | MGC87480 | MSTP029 | TP-BETA hydroxyacyl-Coenzyme A dehydrogenase/3-ketoacyl-Coenzyme A thiolase/enoyl-Coenzyme A hydratase (trifunctional protein), beta subunit - HPRD 11430884
HMOX2 HO-2 血红素氧合酶(Deycling)2 - HPRD 12057765
HSD17B10 17B-HSD10 |Abad |CAMR |Erab |hadh2 |HCD2 |MHBD |MRX17 |MRX31 |MRXS10 | SCHAD hydroxysteroid (17-beta) dehydrogenase 10 - HPRD,Biogrid 9338779|10371197
HSPG2 PLC | PRCAN | SJA | SJS | SJS1 heparan sulfate proteoglycan 2 - HPRD 9136074
htra2 omi |Park13 |PRSS25 HTRA丝氨酸肽酶2 HTRA2与应用程序交互。 绑定 15036614
IDE FLJ35968 | INSULYSIN insulin-degrading enzyme - HPRD 9830016
KAT5 ESA1 | HTATIP | HTATIP1 | PLIP | TIP | TIP60 | cPLA2 K(lysine) acetyltransferase 5 - HPRD 12888553
KLC1 KLC |kns2 |kns2a |MGC15245 kinesin light chain 1 - HPRD,Biogrid 11144355
KNG1 BDK | KNG 差异1 - HPRD 12090937
喇嘛1 LAMA 层粘连蛋白,alpha 1 - HPRD 9136074
LRP1 A2MR | APOER | APR | CD91 | FLJ16451 | IGFBP3R | LRP | MGC88725 | TGFBR5 低密度脂蛋白相关蛋白1(Alpha-2-巨球蛋白受体) - HPRD 7543026|12212791
LRP1B LRP-DIT | LRPDIT 低密度脂蛋白相关蛋白1B(在肿瘤中删除) - HPRD 15126508
MAPK8IP1 IB1 |JIP-1 |JIP1 |prkm8ip mitogen-activated protein kinase 8 interacting protein 1 JIP1 interacts with APP. 绑定 11724784
MAPK8IP1 IB1 |JIP-1 |JIP1 |prkm8ip mitogen-activated protein kinase 8 interacting protein 1 - HPRD 11517249|11724784
NAE1 A-116A10.1 | APPBP1 | HPP1 | ula-1 NEDD8激活酶E1亚基1 淀粉样前体蛋白(APP)的羧基末端介导了与App-BP1的相互作用。 绑定 8626687
NAE1 A-116A10.1 | APPBP1 | HPP1 | ula-1 NEDD8激活酶E1亚基1 - HPRD,Biogrid 8626687
NCSTN aph2 |KIAA0253 尼科斯特林 - HPRD,Biogrid 10993067
NID1 NID nidogen 1 - HPRD 11376898
NUMB S171 numb homolog (Drosophila) - HPRD 12011466
PRSS2 MGC111183 | MGC120174 | TRY2 | TRY8 | TRYP2 蛋白酶,丝氨酸,2(胰蛋白酶2) - HPRD 8478942
PRSS3 MTG | PRSS4 | TRY3 | TRY4 蛋白酶,丝氨酸,3 - HPRD 11827488
PSEN1 AD3 | FAD | PS1 | S182 presenilin 1 - HPRD 10593990
PSEN1 AD3 | FAD | PS1 | S182 presenilin 1 APPswe interacts with PS-1delta-9. 绑定 14756819
PSEN1 AD3 | FAD | PS1 | S182 presenilin 1 PS1 interacts with APP via the APP-C100 fragment. 绑定 10801777
PSEN1 AD3 | FAD | PS1 | S182 presenilin 1 PS1与App751相互作用。 绑定 9223340
PSEN1 AD3 | FAD | PS1 | S182 presenilin 1 PS1与App695相互作用。 绑定 9223340
PSEN1 AD3 | FAD | PS1 | S182 presenilin 1 PS1 interacts with APP. 绑定 15448688
PSEN2 AD3L |ad4 |PS2 |STM2 Presenilin 2(阿尔茨海默氏病4) PS2 interacts with APP. 绑定 9223340
serpina3 AACT | ACT | GIG24 | GIG25 | MGC88254 serpin peptidase inhibitor, clade A (alpha-1 antiproteinase, antitrypsin), member 3 - HPRD 2190106|10048303
SHC1 FLJ26504 | SHC | SHCA SHC (Src homology 2 domain containing) transforming protein 1 - HPRD,Biogrid 9045663|11877420
SHC3 N-Shc | NSHC | RAI | SHCC SHC (Src homology 2 domain containing) transforming protein 3 - HPRD 11877420
SNCA MGC110988 |NACP |park1 |park4 |PD1 突触核蛋白,α(淀粉样蛋白前体的非A4成分) - HPRD,Biogrid 9163350
SNCB - synuclein, beta - HPRD,Biogrid 9163350
SPON1 KIAA0762 |MGC10724 |F-Spondin spondin 1, extracellular matrix protein - HPRD 14983046
TGFB1 CED | DPD1 | TGFB | TGFbeta 转化生长因子,β1 TGF-beta-1 interacts with Amyloid-beta. This interaction was modelled on a demonstrated interaction between TGF-beta-1 from an unspecified species and consensus Amyloid-beta peptides. 绑定 12867422
TGFB2 MGC116892 | TGF-beta2 转化生长因子,beta 2 TGF-beta-2 interacts with Amyloid-beta. This interaction was modelled on a demonstrated interaction between TGF-beta-2 from an unspecified species and consensus Amyloid-beta peptides. 绑定 12867422
TM2D1 BBP 包含1的TM2域 - HPRD 11278849
TP53BP2 53BP2 | ASPP2 | BBP | PPP1R13A | p53BP2 tumor protein p53 binding protein, 2 - HPRD 11278849


V.途径注释

Pathway name Pathway size #szgr 2.0基因 Info
Kegg阿尔茨海默氏病 169 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA P35ALZHEIMERS PATHWAY 11 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta血小板途径 14 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID Glypican 1 Pathway 27 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID P75 NTR PATHWAY 69 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID CASPASE PATHWAY 52 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Trif介导的TLR3信号传导 74 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过戴REACTOME RIP介导NFKB激活 18 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME GASTRIN CREB SIGNALLING PATHWAY VIA PKC AND MAPK 205 136 该途径中的所有SZGR 2.0基因
对血小板胞质CA2升高的反应组反应 89 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GPCR的反应组信号传导 920 449 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME PEPTIDE LIGAND BINDING RECEPTORS 188 108 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome A1级Rhodopsin喜欢受体 305 177 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME G ALPHA Q SIGNALLING EVENTS 184 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome GPCR下游信号传导 805 368 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome G alpha I信号事件 195 114 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Tak1通过磷酸化和激活IKKS复合物激活NFKB 23 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME GPCR LIGAND BINDING 408 246 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Traf6介导的NFKB激活 21 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME TRAF6 MEDIATED INDUCTION OF NFKB AND MAP KINASES UPON TLR7 8 OR 9 ACTIVATION 77 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME ADVANCED GLYCOSYLATION ENDPRODUCT RECEPTOR SIGNALING 13 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME NFKB AND MAP KINASES ACTIVATION MEDIATED BY TLR4 SIGNALING REPERTOIRE 72 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME RIG I MDA5 MEDIATED INDUCTION OF IFN ALPHA BETA PATHWAYS 73 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME HEMOSTASIS 466 331 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME MYD88 MAL CASCADE INITIATED ON PLASMA MEMBRANE 83 63 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome先天免疫系统 279 178 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome激活的TLR4信号传导 93 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME IMMUNE SYSTEM 933 616 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME TOLL RECEPTOR CASCADES 118 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME THE NLRP3 INFLAMMASOME 12 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组炎症 17 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME NUCLEOTIDE BINDING DOMAIN LEUCINE RICH REPEAT CONTAINING RECEPTOR NLR SIGNALING PATHWAYS 46 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组淀粉样蛋白 83 63 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME PLATELET ACTIVATION SIGNALING AND AGGREGATION 208 138 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ONKEN UVEAL MELANOMA UP 783 507 该途径中的所有SZGR 2.0基因
OSWALD HEMATOPOIETIC STEM CELL IN COLLAGEN GEL DN 275 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
AKL HTLV1 INFECTION UP 27 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MULLIGHAN MLL SIGNATURE 1 DN 242 165 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MULLIGHAN MLL SIGNATURE 2 DN 281 186 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TONKS TARGETS OF RUNX1 RUNX1T1 FUSION ERYTHROCYTE UP 157 104 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim WT1靶向 214 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRAHAM CML QUIESCENT VS NORMAL QUIESCENT DN 47 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHIARADONNA NEOPLASTIC TRANSFORMATION KRAS DN 142 95 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Markey RB1急性lof 215 137 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gaussmann MLL AF4融合靶向G 238 135 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DARWICHE SKIN TUMOR PROMOTER DN 185 115 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Darwiche Papilloma风险低 162 104 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Darwiche Papilloma风险高DN 180 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
darwiche鳞状细胞癌DN 181 107 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schlosser MYC靶向血清抑制 159 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DACOSTA UV RESPONSE VIA ERCC3 DN 855 609 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SASAI RESISTANCE TO NEOPLASTIC TRANSFROMATION 50 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SHETH LIVER CANCER VS TXNIP LOSS PAM2 153 102 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KHETCHOUMIAN TRIM24 TARGETS UP 47 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NUYTTEN EZH2 TARGETS UP 1037 673 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LOPEZ MBD TARGETS 957 597 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SCHAEFFER PROSTATE DEVELOPMENT 6HR DN 514 330 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BENPORATH SOX2 TARGETS 734 436 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath MYC带Ebox的目标 230 156 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甜Kras靶向DN 66 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GOLDRATH HOMEOSTATIC PROLIFERATION 171 102 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee Liver Cancer Myc TGFA UP 61 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
费尔南德斯(Fernandez)由迈克(Myc)约束 182 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ABRAHAM ALPC VS MULTIPLE MYELOMA UP 26 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
VERHAAK AML WITH NPM1 MUTATED DN 246 180 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sesto对UV C8的反应 72 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BLALOCK ALZHEIMERS DISEASE INCIPIENT UP 390 242 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KAAB FAILED HEART ATRIUM DN 141 99 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Weigel氧化应激反应 35 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
IVANOVA HEMATOPOIESIS LATE PROGENITOR 544 307 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BLALOCK ALZHEIMERS DISEASE DN 1237 837 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAMAZAKI TCEB3 TARGETS UP 175 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SIMBULAN PARP1 TARGETS UP 31 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
APRELIKOVA BRCA1 TARGETS 49 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BURTON ADIPOGENESIS 8 86 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kayo卡路里限制肌肉 95 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHENG RESPONSE TO NICKEL ACETATE 45 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zamora NOS2靶向DN 96 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHONG SECRETOME OF LUNG CANCER AND MACROPHAGE 77 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHONG SECRETOME OF LUNG CANCER AND FIBROBLAST 132 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gavin Foxp3目标集群P7 90 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KONDO EZH2 TARGETS 245 148 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马丁内斯RB1靶向 673 430 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARTINEZ TP53 TARGETS UP 602 364 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez RB1和TP53靶向DN 591 366 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CAMPS COLON CANCER COPY NUMBER DN 74 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SMID乳腺癌腔B DN 564 326 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BOCHKIS FOXA2 TARGETS 425 261 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MOOTHA MITOCHONDRIA 447 277 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boylan多发性骨髓瘤C D DN 252 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PARK APL PATHOGENESIS DN 50 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YOSHIMURA MAPK8 TARGETS DN 366 257 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chang Core血清反应DN 209 137 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MILI假足趋化性DN 457 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
VALK AML CLUSTER 11 36 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
flt3 itd的valk aml 40 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yagi AML带8 21易位 368 247 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BOYLAN MULTIPLE MYELOMA PCA1 UP 101 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DANG REGULATED BY MYC DN 253 192 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DANG MYC TARGETS DN 31 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由MYC约束 1103 714 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WONG ADULT TISSUE STEM MODULE 721 492 该途径中的所有SZGR 2.0基因
raghavachari血小板特异性基因 70 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHYLA CBFA2T3 TARGETS UP 387 225 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BRUINS UVC RESPONSE VIA TP53 GROUP B 549 316 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BRUINS UVC RESPONSE LATE 1137 655 该途径中的所有SZGR 2.0基因
pasini suz12靶向DN 315 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FOSTER KDM1A TARGETS UP 266 142 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PECE MAMMARY STEM CELL DN 146 88 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WARTERS IR RESPONSE 5GY 47 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因

Section VI. microRNA annotation

miRNA family Target position mirna id miRNA seq
UTR start UTR end Match method
miR-101 243 250 1A,M8 HSA-MIR-101 UACAGUACUGUGAUAACUGAAG
HSA-MIR-101 UACAGUACUGUGAUAACUGAAG
mir-144 532 538 1A hsa-miR-144 uacaguauagauguauguaguag
hsa-miR-144 uacaguauagauguauguaguag
mir-15/16/195/424/497 544 550 m8 hsa-miR-15a UAGCAGCACAUAAUGGUUUGUG
HSA-MIR-16 uagcagcacguaaauauuggcg
hsa-miR-15b UAGCAGCACAUCAUGGUUUACA
hsa-miR-195SZ UAGCAGCACAGAAAUAUUGGC
HSA-MIR-424 CAGCAGCAAUUCAUGUUUUGAA
HSA-MIR-497 CAGCAGCACACUGUGGUUUGU
mir-153 458 464 m8 hsa-miR-153 Uugcauagucacaaaaguga
miR-17-5p/20/93.mr/106/519.d 710 716 m8 hsa-miR-17-5p CAAAGUGCUUACAGUGCAGGUAGU
HSA-MIR-20A uaaagugcuuauagugcagguag
hsa-miR-106a aaaagugcuuacugugcagguagc
hsa-miR-106bSZ uaaagugcugacagugcagau
HSA-MIR-20BSZ CAAAGUGCUCAUAGUGCAGGUAG
hsa-miR-519d CAAAGUGCCUCCCUUUAGAGUGU
mir-185 288 294 m8 hsa-miR-185 Uggagaaaggcaguuc
mir-324-5p 393 399 m8 HSA-MIR-324-5p CGCAUCCCCUAGGGCAUUGGUGU
mir-381 325 331 1A hsa - mir - 381 UAUACAAGGGCAAGCUCUCUGU
mir-383 451 457 1A hsa-miR-383 AGAUCAGAAGGUGAUUGUGGCU
mir-93.hd/291-3p/294/295/302/372/373/520 709 715 m8 hsa-miR-93 AAAGUGCUGUUCGUGCAGGUAG
HSA-MIR-302A UAAGUGCUUCCAUGUUUUGGUGA
HSA-MIR-302B uaagugcuuccauguuuaguag
HSA-MIR-302C UAAGUGCUUCCAUGUUUCAGUGG
HSA-MIR-302D Uaagugcuauguugugugu
hsa-miR-372 aaagugcugcgacauuugagcgu
hsa-miR-373 GAAGUGCUUCGAUUUUGGGGUGU
HSA-MIR-520E AAAGUGCUUCCUUUUUGAGGG
HSA-MIR-520A aaagugcuucccuuguggugu
HSA-MIR-520B AAAGUGCUUCCUUUUAGAGGG
HSA-MIR-520C AAAGUGCUUCCUUUUAGAGGGUU
HSA-MIR-520D AAAGUGCUUCUCUUUGGUGGGUU