基因页:APP
概括?
GeneID | 351 |
Symbol | APP |
Synonyms | AAA|ABETA|ABPP|AD1|APPI|CTFgamma|CVAP|PN-II|PN2 |
Description | 淀粉样β前体蛋白 |
参考 | MIM:104760|HGNC:HGNC:620|Ensembl:ENSG00000142192|HPRD:00100|Vega:OTTHUMG00000078438 |
Gene type | protein-coding |
地图位置 | 21q21.3 |
Pascal p-value | 0.079 |
Sherlock P值 | 0.726 |
Fetal beta | -1.23 |
DMG | 1(#研究) |
支持 | COMPOSITESET Darnell FMRP targets Ascano FMRP targets |
数据源中的基因
基因集名称 | Method of gene set | Description | Info |
---|---|---|---|
CV:GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
CV:PGCnp | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Nishioka_2013 | Genome-wide DNA methylation analysis | The authors investigated the methylation profiles of DNA in peripheral blood cells from 18 patients with first-episode schizophrenia (FESZ) and from 15 normal controls. | 1 |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | Co-occurance with Schizophrenia keywords: schizophrenia,schizophrenic,schizophrenics,schizophrenias | 点击to show details |
网络 | 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 | Contribution to shortest path in PPI network: 8.0457 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | Chromosome | Position | 最近的基因 | P (dis) | beta(dis) | FDR (dis) | Study |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG13169373 | 21 | 27542843 | APP | -0.027 | 0.32 | DMG:Nishioka_2013 |
Section II. Transcriptome annotation
General gene expression (GTEx)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/APP_DE_GTEx.png)
Gene expression during devlopment (BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.
大脑区域没有共表达基因
Section III. Gene Ontology annotation
Molecular function | 去的术语 | Evidence | Neuro keywords | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0004867 | serine-type endopeptidase inhibitor activity | 艾达 | 10652580 | |
去:0004867 | serine-type endopeptidase inhibitor activity | NAS | 11279603 | |
: 0005506 | iron ion binding | IEA | - | |
: 0005507 | copper ion binding | IEA | - | |
: 0008201 | heparin binding | IEA | - | |
: 0008270 | zinc ion binding | IEA | - | |
去:0033130 | acetylcholine receptor binding | IPI | 10681545 | |
: 0042802 | 相同的蛋白质结合 | IPI | 16286452 | |
: 0046872 | metal ion binding | IEA | - | |
Biological process | 去的术语 | Evidence | Neuro keywords | PubMed ID |
: 0007155 | 细胞粘附 | IEA | - | |
: 0007219 | Notch信号通路 | IEA | - | |
去:0006915 | apoptosis | IEA | - | |
: 0006878 | 细胞铜离子稳态 | 塔斯 | 15910549 | |
: 0006897 | endocytosis | IEA | - | |
GO:0050905 | neuromuscular process | NAS | 7593229 | |
Cellular component | 去的术语 | Evidence | Neuro keywords | PubMed ID |
: 0005794 | Golgi apparatus | 艾达 | 18029348 | |
: 0005576 | extracellular region | EXP | 2110384 | |
: 0005576 | extracellular region | 塔斯 | 10806211 | |
: 0005737 | 细胞质 | 艾达 | 18029348 | |
: 0009986 | cell surface | 艾达 | 7593229 | |
去:0005905 | 涂层坑 | IEA | - | |
去:0005886 | 质膜 | 艾达 | 18029348 | |
去:0005887 | 质膜的积分 | 塔斯 | 10806211 | |
GO:0031093 | platelet alpha granule lumen | EXP | 2110384 |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
Interactors | Aliases B | Official full name B | Experimental | 资源 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
ABL1 | ABL |JTK7 |BCR/ABL |c-abl |P150 |V-ABL | C-ABL癌基因1,受体酪氨酸激酶 | - | HPRD | 11279131 |
ACHE | Arache |n-ache |是 | acetylcholinesterase (Yt blood group) | - | HPRD,Biogrid | 12427014 |
APBA1 | D9S411E | MINT1 | X11 | X11A | X11ALPHA | 淀粉样β(A4)前体蛋白-binding, family A, member 1 | - | HPRD,Biogrid | 8887653 |
APBA1 | D9S411E | MINT1 | X11 | X11A | X11ALPHA | 淀粉样β(A4)前体蛋白-binding, family A, member 1 | AppSwe与X11-Alpha互动。 | 绑定 | 12849748|14756819 |
APBA1 | D9S411E | MINT1 | X11 | X11A | X11ALPHA | 淀粉样β(A4)前体蛋白-binding, family A, member 1 | Beta-App与X11相互作用。 | 绑定 | 8887653 |
APBA2 | D15S1518E | HsT16821 | LIN-10 | MGC99508 | MGC:14091 | MINT2 | X11L | 淀粉样β(A4)前体蛋白-binding, family A, member 2 | - | HPRD,Biogrid | 9890987 |
APBA3 | MGC:15815 | X11L2 | mint3 | 淀粉样β(A4)前体蛋白-binding, family A, member 3 | - | HPRD,Biogrid | 10049767 |
APBB1 | FE65 | MGC:9072 | RIR | 淀粉样β(A4)前体蛋白-binding, family B, member 1 (Fe65) | Affinity Capture-Western Reconstituted Complex 两个杂交 |
BioGRID | 8855266|8887653 |9045663|9837937 |10081969 |
APBB1 | FE65 | MGC:9072 | RIR | 淀粉样β(A4)前体蛋白-binding, family B, member 1 (Fe65) | - | HPRD | 8887653|8955346 |9045663|9799084 |9837937|11085987 |
APBB2 | DKFZp434E033 | FE65L | FE65L1 | MGC35575 | 淀粉样β(A4)前体蛋白-binding, family B, member 2 | - | HPRD,Biogrid | 8855266|14527950 |
APBB3 | Fe65l2 |MGC150555 |MGC87674 |SRA | 淀粉样β(A4)前体蛋白-binding, family B, member 3 | - | HPRD,Biogrid | 10081969 | 14527950 |
apoe | AD2 | LPG | MGC1571 | apoprotein | apolipoprotein E | - | HPRD | 10559559 |
APP | AAA | ABETA | ABPP | AD1 | APPI | CTFgamma | CVAP | PN2 | 淀粉样β(A4)前体蛋白 | APP (Abeta) isoform b forms homodimers, homotrimers and oligomers. | 绑定 | 15834427 |
AppBP2 | HS.84084 |KIAA0228 |pat1 | 淀粉样β前体蛋白(cytoplasmic tail) binding protein 2 | - | HPRD,Biogrid | 9843960 |
BCAP31 | 6C6-AG | BAP31 | CDM | DXS1357E | B-cell receptor-associated protein 31 | - | HPRD,Biogrid | 12529377 |
BGN | DSPG1 | PG-S1 | PGI | SLRR1A | 大扫描 | - | HPRD,Biogrid | 7793988 |
BLMH | BH | BMH | 博来霉素水解酶 | - | HPRD,Biogrid | 10973933 |
卡尔 | CRT |FLJ26680 |ro |SSA |CC1QR | 钙网蛋白 | - | HPRD,Biogrid | 11378243 |
CASP4 | ICE(rel)II | ICEREL-II | ICH-2 | Mih1/TX | TX | caspase 4,与凋亡相关的半胱氨酸肽酶 | - | HPRD | 15123740 |
CASP8 | ALPS2B | CAP4 | FLICE | FLJ17672 | MACH | MCH5 | MGC78473 | caspase 8,与凋亡相关的半胱氨酸肽酶 | - | HPRD | 10911620 |
CAV1 | CAV | MSTP085 | VIP21 | caveolin 1, caveolae protein, 22kDa | - | HPRD,Biogrid | 9553108 |
CLSTN1 | ALC-ALPHA | CSTN1 | FLJ32258 | KIAA0911 | PIK3CD | XB31alpha | alcalpha1 | alcalpha2 | Calsyntenin 1 | - | HPRD,Biogrid | 15037614 |
COL1A2 | OI4 | 胶原蛋白,I型,Alpha 2 | - | HPRD | 7688497 |
COL25A1 | clac |CLACP | 胶原蛋白,XXV类型,Alpha 1 | - | HPRD,Biogrid | 11927537 |
COL4A1 | arresten | 胶原蛋白,IV型,Alpha 1 | - | HPRD | 9136074 |
COL4A2 | DKFZP686I14213 |FLJ22259 | 胶原蛋白,IV型,Alpha 2 | - | HPRD | 9136074 |
COL4A3 | - | 胶原蛋白,IV型,Alpha 3(Goodpasture抗原) | - | HPRD | 9136074 |
COL4A5 | asln |ATS |CA54 |MGC167109 |MGC42377 | 胶原蛋白,IV型,Alpha 5 | - | HPRD | 9136074 |
COL4A6 | MGC88184 | 胶原蛋白,IV型,Alpha 6 | - | HPRD | 9136074 |
DAB1 | - | 残疾同源1(果蝇) | - | HPRD,Biogrid | 10460257 |
DAB1 | - | 残疾同源1(果蝇) | - | HPRD | 9837937|10460257 |
DAB2 | DOC-2 | DOC2 | FLJ26626 | 残疾同源物2,有丝分裂原反应性磷蛋白(果蝇) | Reconstituted Complex | BioGRID | 11247302 |
F12 | hae3 |哈克斯|哈夫 | 凝血因子XII(Hageman因子) | - | HPRD | 11589915 |
fbln1 | fbln | 斐杜蛋白1 | - | HPRD,Biogrid | 11238726 |
GAPDH | G3PD |GAPD |MGC88685 | glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase | - | HPRD | 8473906 |
GRB2 | ASH | EGFRBP-GRB2 | Grb3-3 | MST084 | MSTP084 | growth factor receptor-bound protein 2 | - | HPRD | 12485888 |
GSN | DKFZP313L0718 | gelsolin (amyloidosis, Finnish type) | - | HPRD,Biogrid | 10329371 |
hadhb | ECHB | MGC87480 | MSTP029 | TP-BETA | hydroxyacyl-Coenzyme A dehydrogenase/3-ketoacyl-Coenzyme A thiolase/enoyl-Coenzyme A hydratase (trifunctional protein), beta subunit | - | HPRD | 11430884 |
HMOX2 | HO-2 | 血红素氧合酶(Deycling)2 | - | HPRD | 12057765 |
HSD17B10 | 17B-HSD10 |Abad |CAMR |Erab |hadh2 |HCD2 |MHBD |MRX17 |MRX31 |MRXS10 | SCHAD | hydroxysteroid (17-beta) dehydrogenase 10 | - | HPRD,Biogrid | 9338779|10371197 |
HSPG2 | PLC | PRCAN | SJA | SJS | SJS1 | heparan sulfate proteoglycan 2 | - | HPRD | 9136074 |
htra2 | omi |Park13 |PRSS25 | HTRA丝氨酸肽酶2 | HTRA2与应用程序交互。 | 绑定 | 15036614 |
IDE | FLJ35968 | INSULYSIN | insulin-degrading enzyme | - | HPRD | 9830016 |
KAT5 | ESA1 | HTATIP | HTATIP1 | PLIP | TIP | TIP60 | cPLA2 | K(lysine) acetyltransferase 5 | - | HPRD | 12888553 |
KLC1 | KLC |kns2 |kns2a |MGC15245 | kinesin light chain 1 | - | HPRD,Biogrid | 11144355 |
KNG1 | BDK | KNG | 差异1 | - | HPRD | 12090937 |
喇嘛1 | LAMA | 层粘连蛋白,alpha 1 | - | HPRD | 9136074 |
LRP1 | A2MR | APOER | APR | CD91 | FLJ16451 | IGFBP3R | LRP | MGC88725 | TGFBR5 | 低密度脂蛋白相关蛋白1(Alpha-2-巨球蛋白受体) | - | HPRD | 7543026|12212791 |
LRP1B | LRP-DIT | LRPDIT | 低密度脂蛋白相关蛋白1B(在肿瘤中删除) | - | HPRD | 15126508 |
MAPK8IP1 | IB1 |JIP-1 |JIP1 |prkm8ip | mitogen-activated protein kinase 8 interacting protein 1 | JIP1 interacts with APP. | 绑定 | 11724784 |
MAPK8IP1 | IB1 |JIP-1 |JIP1 |prkm8ip | mitogen-activated protein kinase 8 interacting protein 1 | - | HPRD | 11517249|11724784 |
NAE1 | A-116A10.1 | APPBP1 | HPP1 | ula-1 | NEDD8激活酶E1亚基1 | 淀粉样前体蛋白(APP)的羧基末端介导了与App-BP1的相互作用。 | 绑定 | 8626687 |
NAE1 | A-116A10.1 | APPBP1 | HPP1 | ula-1 | NEDD8激活酶E1亚基1 | - | HPRD,Biogrid | 8626687 |
NCSTN | aph2 |KIAA0253 | 尼科斯特林 | - | HPRD,Biogrid | 10993067 |
NID1 | NID | nidogen 1 | - | HPRD | 11376898 |
NUMB | S171 | numb homolog (Drosophila) | - | HPRD | 12011466 |
PRSS2 | MGC111183 | MGC120174 | TRY2 | TRY8 | TRYP2 | 蛋白酶,丝氨酸,2(胰蛋白酶2) | - | HPRD | 8478942 |
PRSS3 | MTG | PRSS4 | TRY3 | TRY4 | 蛋白酶,丝氨酸,3 | - | HPRD | 11827488 |
PSEN1 | AD3 | FAD | PS1 | S182 | presenilin 1 | - | HPRD | 10593990 |
PSEN1 | AD3 | FAD | PS1 | S182 | presenilin 1 | APPswe interacts with PS-1delta-9. | 绑定 | 14756819 |
PSEN1 | AD3 | FAD | PS1 | S182 | presenilin 1 | PS1 interacts with APP via the APP-C100 fragment. | 绑定 | 10801777 |
PSEN1 | AD3 | FAD | PS1 | S182 | presenilin 1 | PS1与App751相互作用。 | 绑定 | 9223340 |
PSEN1 | AD3 | FAD | PS1 | S182 | presenilin 1 | PS1与App695相互作用。 | 绑定 | 9223340 |
PSEN1 | AD3 | FAD | PS1 | S182 | presenilin 1 | PS1 interacts with APP. | 绑定 | 15448688 |
PSEN2 | AD3L |ad4 |PS2 |STM2 | Presenilin 2(阿尔茨海默氏病4) | PS2 interacts with APP. | 绑定 | 9223340 |
serpina3 | AACT | ACT | GIG24 | GIG25 | MGC88254 | serpin peptidase inhibitor, clade A (alpha-1 antiproteinase, antitrypsin), member 3 | - | HPRD | 2190106|10048303 |
SHC1 | FLJ26504 | SHC | SHCA | SHC (Src homology 2 domain containing) transforming protein 1 | - | HPRD,Biogrid | 9045663|11877420 |
SHC3 | N-Shc | NSHC | RAI | SHCC | SHC (Src homology 2 domain containing) transforming protein 3 | - | HPRD | 11877420 |
SNCA | MGC110988 |NACP |park1 |park4 |PD1 | 突触核蛋白,α(淀粉样蛋白前体的非A4成分) | - | HPRD,Biogrid | 9163350 |
SNCB | - | synuclein, beta | - | HPRD,Biogrid | 9163350 |
SPON1 | KIAA0762 |MGC10724 |F-Spondin | spondin 1, extracellular matrix protein | - | HPRD | 14983046 |
TGFB1 | CED | DPD1 | TGFB | TGFbeta | 转化生长因子,β1 | TGF-beta-1 interacts with Amyloid-beta. This interaction was modelled on a demonstrated interaction between TGF-beta-1 from an unspecified species and consensus Amyloid-beta peptides. | 绑定 | 12867422 |
TGFB2 | MGC116892 | TGF-beta2 | 转化生长因子,beta 2 | TGF-beta-2 interacts with Amyloid-beta. This interaction was modelled on a demonstrated interaction between TGF-beta-2 from an unspecified species and consensus Amyloid-beta peptides. | 绑定 | 12867422 |
TM2D1 | BBP | 包含1的TM2域 | - | HPRD | 11278849 |
TP53BP2 | 53BP2 | ASPP2 | BBP | PPP1R13A | p53BP2 | tumor protein p53 binding protein, 2 | - | HPRD | 11278849 |
V.途径注释
Pathway name | Pathway size | #szgr 2.0基因 | Info |
---|---|---|---|
Kegg阿尔茨海默氏病 | 169 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BIOCARTA P35ALZHEIMERS PATHWAY | 11 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta血小板途径 | 14 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID Glypican 1 Pathway | 27 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID P75 NTR PATHWAY | 69 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID CASPASE PATHWAY | 52 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome Trif介导的TLR3信号传导 | 74 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
通过戴REACTOME RIP介导NFKB激活 | 18 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME GASTRIN CREB SIGNALLING PATHWAY VIA PKC AND MAPK | 205 | 136 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
对血小板胞质CA2升高的反应组反应 | 89 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GPCR的反应组信号传导 | 920 | 449 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME PEPTIDE LIGAND BINDING RECEPTORS | 188 | 108 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome A1级Rhodopsin喜欢受体 | 305 | 177 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME G ALPHA Q SIGNALLING EVENTS | 184 | 116 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome GPCR下游信号传导 | 805 | 368 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome G alpha I信号事件 | 195 | 114 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome Tak1通过磷酸化和激活IKKS复合物激活NFKB | 23 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME GPCR LIGAND BINDING | 408 | 246 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome Traf6介导的NFKB激活 | 21 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME TRAF6 MEDIATED INDUCTION OF NFKB AND MAP KINASES UPON TLR7 8 OR 9 ACTIVATION | 77 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME ADVANCED GLYCOSYLATION ENDPRODUCT RECEPTOR SIGNALING | 13 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME NFKB AND MAP KINASES ACTIVATION MEDIATED BY TLR4 SIGNALING REPERTOIRE | 72 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME RIG I MDA5 MEDIATED INDUCTION OF IFN ALPHA BETA PATHWAYS | 73 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME HEMOSTASIS | 466 | 331 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME MYD88 MAL CASCADE INITIATED ON PLASMA MEMBRANE | 83 | 63 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome先天免疫系统 | 279 | 178 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome激活的TLR4信号传导 | 93 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME IMMUNE SYSTEM | 933 | 616 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME TOLL RECEPTOR CASCADES | 118 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME THE NLRP3 INFLAMMASOME | 12 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组炎症 | 17 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME NUCLEOTIDE BINDING DOMAIN LEUCINE RICH REPEAT CONTAINING RECEPTOR NLR SIGNALING PATHWAYS | 46 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组淀粉样蛋白 | 83 | 63 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME PLATELET ACTIVATION SIGNALING AND AGGREGATION | 208 | 138 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ONKEN UVEAL MELANOMA UP | 783 | 507 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
OSWALD HEMATOPOIETIC STEM CELL IN COLLAGEN GEL DN | 275 | 168 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
AKL HTLV1 INFECTION UP | 27 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MULLIGHAN MLL SIGNATURE 1 DN | 242 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MULLIGHAN MLL SIGNATURE 2 DN | 281 | 186 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
TONKS TARGETS OF RUNX1 RUNX1T1 FUSION ERYTHROCYTE UP | 157 | 104 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim WT1靶向 | 214 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GRAHAM CML QUIESCENT VS NORMAL QUIESCENT DN | 47 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CHIARADONNA NEOPLASTIC TRANSFORMATION KRAS DN | 142 | 95 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Markey RB1急性lof | 215 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gaussmann MLL AF4融合靶向G | 238 | 135 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
DARWICHE SKIN TUMOR PROMOTER DN | 185 | 115 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Darwiche Papilloma风险低 | 162 | 104 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Darwiche Papilloma风险高DN | 180 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
darwiche鳞状细胞癌DN | 181 | 107 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schlosser MYC靶向血清抑制 | 159 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
DACOSTA UV RESPONSE VIA ERCC3 DN | 855 | 609 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SASAI RESISTANCE TO NEOPLASTIC TRANSFROMATION | 50 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SHETH LIVER CANCER VS TXNIP LOSS PAM2 | 153 | 102 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KHETCHOUMIAN TRIM24 TARGETS UP | 47 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NUYTTEN EZH2 TARGETS UP | 1037 | 673 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LOPEZ MBD TARGETS | 957 | 597 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SCHAEFFER PROSTATE DEVELOPMENT 6HR DN | 514 | 330 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BENPORATH SOX2 TARGETS | 734 | 436 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath MYC带Ebox的目标 | 230 | 156 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甜Kras靶向DN | 66 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GOLDRATH HOMEOSTATIC PROLIFERATION | 171 | 102 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee Liver Cancer Myc TGFA UP | 61 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
费尔南德斯(Fernandez)由迈克(Myc)约束 | 182 | 116 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ABRAHAM ALPC VS MULTIPLE MYELOMA UP | 26 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
VERHAAK AML WITH NPM1 MUTATED DN | 246 | 180 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sesto对UV C8的反应 | 72 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BLALOCK ALZHEIMERS DISEASE INCIPIENT UP | 390 | 242 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KAAB FAILED HEART ATRIUM DN | 141 | 99 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Weigel氧化应激反应 | 35 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
IVANOVA HEMATOPOIESIS LATE PROGENITOR | 544 | 307 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BLALOCK ALZHEIMERS DISEASE DN | 1237 | 837 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
YAMAZAKI TCEB3 TARGETS UP | 175 | 116 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SIMBULAN PARP1 TARGETS UP | 31 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
APRELIKOVA BRCA1 TARGETS | 49 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BURTON ADIPOGENESIS 8 | 86 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kayo卡路里限制肌肉 | 95 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CHENG RESPONSE TO NICKEL ACETATE | 45 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zamora NOS2靶向DN | 96 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ZHONG SECRETOME OF LUNG CANCER AND MACROPHAGE | 77 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ZHONG SECRETOME OF LUNG CANCER AND FIBROBLAST | 132 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gavin Foxp3目标集群P7 | 90 | 52 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KONDO EZH2 TARGETS | 245 | 148 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马丁内斯RB1靶向 | 673 | 430 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MARTINEZ TP53 TARGETS UP | 602 | 364 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez RB1和TP53靶向DN | 591 | 366 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CAMPS COLON CANCER COPY NUMBER DN | 74 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SMID乳腺癌腔B DN | 564 | 326 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BOCHKIS FOXA2 TARGETS | 425 | 261 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MOOTHA MITOCHONDRIA | 447 | 277 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boylan多发性骨髓瘤C D DN | 252 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PARK APL PATHOGENESIS DN | 50 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
YOSHIMURA MAPK8 TARGETS DN | 366 | 257 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chang Core血清反应DN | 209 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MILI假足趋化性DN | 457 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
VALK AML CLUSTER 11 | 36 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
flt3 itd的valk aml | 40 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yagi AML带8 21易位 | 368 | 247 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BOYLAN MULTIPLE MYELOMA PCA1 UP | 101 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
DANG REGULATED BY MYC DN | 253 | 192 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
DANG MYC TARGETS DN | 31 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由MYC约束 | 1103 | 714 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
WONG ADULT TISSUE STEM MODULE | 721 | 492 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
raghavachari血小板特异性基因 | 70 | 46 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CHYLA CBFA2T3 TARGETS UP | 387 | 225 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BRUINS UVC RESPONSE VIA TP53 GROUP B | 549 | 316 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BRUINS UVC RESPONSE LATE | 1137 | 655 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
pasini suz12靶向DN | 315 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FOSTER KDM1A TARGETS UP | 266 | 142 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PECE MAMMARY STEM CELL DN | 146 | 88 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
WARTERS IR RESPONSE 5GY | 47 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Section VI. microRNA annotation
miRNA family | Target position | mirna id | miRNA seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR start | UTR end | Match method | |||
miR-101 | 243 | 250 | 1A,M8 | HSA-MIR-101 | UACAGUACUGUGAUAACUGAAG |
HSA-MIR-101 | UACAGUACUGUGAUAACUGAAG | ||||
mir-144 | 532 | 538 | 1A | hsa-miR-144 | uacaguauagauguauguaguag |
hsa-miR-144 | uacaguauagauguauguaguag | ||||
mir-15/16/195/424/497 | 544 | 550 | m8 | hsa-miR-15a脑 | UAGCAGCACAUAAUGGUUUGUG |
HSA-MIR-16脑 | uagcagcacguaaauauuggcg | ||||
hsa-miR-15b脑 | UAGCAGCACAUCAUGGUUUACA | ||||
hsa-miR-195SZ | UAGCAGCACAGAAAUAUUGGC | ||||
HSA-MIR-424 | CAGCAGCAAUUCAUGUUUUGAA | ||||
HSA-MIR-497 | CAGCAGCACACUGUGGUUUGU | ||||
mir-153 | 458 | 464 | m8 | hsa-miR-153 | Uugcauagucacaaaaguga |
miR-17-5p/20/93.mr/106/519.d | 710 | 716 | m8 | hsa-miR-17-5p | CAAAGUGCUUACAGUGCAGGUAGU |
HSA-MIR-20A脑 | uaaagugcuuauagugcagguag | ||||
hsa-miR-106a | aaaagugcuuacugugcagguagc | ||||
hsa-miR-106bSZ | uaaagugcugacagugcagau | ||||
HSA-MIR-20BSZ | CAAAGUGCUCAUAGUGCAGGUAG | ||||
hsa-miR-519d | CAAAGUGCCUCCCUUUAGAGUGU | ||||
mir-185 | 288 | 294 | m8 | hsa-miR-185脑 | Uggagaaaggcaguuc |
mir-324-5p | 393 | 399 | m8 | HSA-MIR-324-5p | CGCAUCCCCUAGGGCAUUGGUGU |
mir-381 | 325 | 331 | 1A | hsa - mir - 381 | UAUACAAGGGCAAGCUCUCUGU |
mir-383 | 451 | 457 | 1A | hsa-miR-383脑 | AGAUCAGAAGGUGAUUGUGGCU |
mir-93.hd/291-3p/294/295/302/372/373/520 | 709 | 715 | m8 | hsa-miR-93脑 | AAAGUGCUGUUCGUGCAGGUAG |
HSA-MIR-302A | UAAGUGCUUCCAUGUUUUGGUGA | ||||
HSA-MIR-302B | uaagugcuuccauguuuaguag | ||||
HSA-MIR-302C | UAAGUGCUUCCAUGUUUCAGUGG | ||||
HSA-MIR-302D | Uaagugcuauguugugugu | ||||
hsa-miR-372 | aaagugcugcgacauuugagcgu | ||||
hsa-miR-373 | GAAGUGCUUCGAUUUUGGGGUGU | ||||
HSA-MIR-520E | AAAGUGCUUCCUUUUUGAGGG | ||||
HSA-MIR-520A | aaagugcuucccuuguggugu | ||||
HSA-MIR-520B | AAAGUGCUUCCUUUUAGAGGG | ||||
HSA-MIR-520C | AAAGUGCUUCCUUUUAGAGGGUU | ||||
HSA-MIR-520D | AAAGUGCUUCUCUUUGGUGGGUU |