基因页:RBPJ
Summary?
GeneID | 3516 |
Symbol | RBPJ |
同义词 | aos3 | cbf1 | igkjrb | igkjrb1 | kbf2 | rbp-j | rbpjk | rbpsuh | suh | csl | csl |
描述 | 免疫球蛋白kappa J区的重组信号结合蛋白 |
参考 | MIM:147183|HGNC:HGNC:5724|ENSEMBL:ENSG00000168214|HPRD:00920|Vega:Otthumg0000000097793 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 4P15.2 |
Pascal P值 | 0.078 |
Sherlock P值 | 0.892 |
胎儿β | 1.675 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
Gene in Data Sources
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
CV:GWASdb | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 1 |
Section I. Genetics and epigenetics annotation
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG01880437 | 4 | 26321873 | RBPJ | 1.28E-9 | -0.022 | 1.34E-6 | DMG:JAFFE_2016 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | eQTL type |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS6128541 | CHR20 | 57917688 | RBPJ | 3516 | 0.17 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/RBPJ_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
Footnote:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
Footnote:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
Section IV. Protein-protein interaction annotation
互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | Source | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
CIR | - | CBF1 interacting corepressor | - | HPRD,Biogrid | 9874765 |
FHL1 | FHL1B | FLH1A | KYO-T | MGC111107 | SLIM1 | XMPMA | bA535K18.1 | four and a half LIM domains 1 | Kyot与RBP-J相互作用。这种相互作用是根据来自未指定的物种的Kyot和RBP-J之间的相互作用进行了建模的。 | 绑定 | 15710417 |
HES1 | FLJ20408 |hes-1 |HHL |hry |BHLHB39 | 分裂1的毛茸茸和增强子(果蝇) | HES1启动子与CBF1相互作用。 | 绑定 | 15546612 |
kat2a | GCN5 |GCN5L2 |MGC102791 |PCAF-B |HGCN5 | K(赖氨酸)乙酰转移酶2A | Two-hybrid | Biogrid | 10747963 |
kat2b | CAF |P |P/CAF |PCAF | K(赖氨酸)乙酰转移酶2B | - | HPRD,Biogrid | 10747963 |
NCOR2 | CTG26 |SMRT |Smrte |smrte-tau |TNRC14 |TRAC-1 |trac1 | 核受体共抑制剂2 | - | HPRD,Biogrid | 11509665 |
Notch1 | tan1 |HN1 | Notch同源1,易位相关(果蝇) | - | HPRD,Biogrid | 8749394|9111040 |10637481 |
Notch2 | AGS2 |HN2 | Notch同源2(果蝇) | - | HPRD,Biogrid | 9032325 |
Notch3 | 卡达西尔|卡西尔 | Notch同源3(果蝇) | - | HPRD | 11404076 |
sin3a | DKFZP434K2235 |FLJ90319 |KIAA0700 | SIN3同源物A,转录调节剂(酵母) | 重构的复合物 | Biogrid | 10644367 |
SND1 | TDRD11 |P100 | 葡萄球菌核酸酶和tudor结构域,含有1个 | Two-hybrid | Biogrid | 9874765|10644367 |
SND1 | TDRD11 |P100 | 葡萄球菌核酸酶和tudor结构域,含有1个 | - | HPRD | 7651391 |
SNW1 | BX42 |MGC119379 |NCOA-62 |PRPF45 |prp45 |滑雪|跳过 | SNW domain containing 1 | - | HPRD,Biogrid | 10713164 |
SPEN | KIAA0929 |薄荷|RP1-134O19.1 |锋利的 | 口头的相同器官,transcriptional regulator (Drosophila) | - | HPRD,Biogrid | 12374742 |
苏富 | Pro1280 |Sufuh |sufuxl | 融合同源物(果蝇)的抑制剂 | - | HPRD | 14611647 |