Summary
GeneID 3516
Symbol RBPJ
同义词 aos3 | cbf1 | igkjrb | igkjrb1 | kbf2 | rbp-j | rbpjk | rbpsuh | suh | csl | csl
描述 免疫球蛋白kappa J区的重组信号结合蛋白
参考 MIM:147183|HGNC:HGNC:5724|ENSEMBL:ENSG00000168214|HPRD:00920|Vega:Otthumg0000000097793
基因类型 蛋白质编码
地图位置 4P15.2
Pascal P值 0.078
Sherlock P值 0.892
胎儿β 1.675
DMG 1(#研究)
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

Gene in Data Sources
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV:GWASdb 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 1

Section I. Genetics and epigenetics annotation

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG01880437 4 26321873 RBPJ 1.28E-9 -0.022 1.34E-6 DMG:JAFFE_2016

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 eQTL type
RS6128541 CHR20 57917688 RBPJ 3516 0.17 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

Footnote:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

Footnote:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


Section IV. Protein-protein interaction annotation

互动者 别名b 官方全名b 实验 Source PubMed ID
CIR - CBF1 interacting corepressor - HPRD,Biogrid 9874765
FHL1 FHL1B | FLH1A | KYO-T | MGC111107 | SLIM1 | XMPMA | bA535K18.1 four and a half LIM domains 1 Kyot与RBP-J相互作用。这种相互作用是根据来自未指定的物种的Kyot和RBP-J之间的相互作用进行了建模的。 绑定 15710417
HES1 FLJ20408 |hes-1 |HHL |hry |BHLHB39 分裂1的毛茸茸和增强子(果蝇) HES1启动子与CBF1相互作用。 绑定 15546612
kat2a GCN5 |GCN5L2 |MGC102791 |PCAF-B |HGCN5 K(赖氨酸)乙酰转移酶2A Two-hybrid Biogrid 10747963
kat2b CAF |P |P/CAF |PCAF K(赖氨酸)乙酰转移酶2B - HPRD,Biogrid 10747963
NCOR2 CTG26 |SMRT |Smrte |smrte-tau |TNRC14 |TRAC-1 |trac1 核受体共抑制剂2 - HPRD,Biogrid 11509665
Notch1 tan1 |HN1 Notch同源1,易位相关(果蝇) - HPRD,Biogrid 8749394|9111040
|10637481
Notch2 AGS2 |HN2 Notch同源2(果蝇) - HPRD,Biogrid 9032325
Notch3 卡达西尔|卡西尔 Notch同源3(果蝇) - HPRD 11404076
sin3a DKFZP434K2235 |FLJ90319 |KIAA0700 SIN3同源物A,转录调节剂(酵母) 重构的复合物 Biogrid 10644367
SND1 TDRD11 |P100 葡萄球菌核酸酶和tudor结构域,含有1个 Two-hybrid Biogrid 9874765|10644367
SND1 TDRD11 |P100 葡萄球菌核酸酶和tudor结构域,含有1个 - HPRD 7651391
SNW1 BX42 |MGC119379 |NCOA-62 |PRPF45 |prp45 |滑雪|跳过 SNW domain containing 1 - HPRD,Biogrid 10713164
SPEN KIAA0929 |薄荷|RP1-134O19.1 |锋利的 口头的相同器官,transcriptional regulator (Drosophila) - HPRD,Biogrid 12374742
苏富 Pro1280 |Sufuh |sufuxl 融合同源物(果蝇)的抑制剂 - HPRD 14611647


Section V. Pathway annotation

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Kegg Notch信号通路 47 35 All SZGR 2.0 genes in this pathway
BIOCARTA PS1 PATHWAY 14 14 All SZGR 2.0 genes in this pathway
PID Notch途径 59 49 All SZGR 2.0 genes in this pathway
PID PS1途径 46 39 All SZGR 2.0 genes in this pathway
pid his hey pathway 48 39 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome发育生物学 396 292 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome PreNCH的转录和翻译 29 17 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome Pre Notch表达和处理 44 24 All SZGR 2.0 genes in this pathway
REACTOME NOTCH1 INTRACELLULAR DOMAIN REGULATES TRANSCRIPTION 46 28 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Notch的Reactome信号传导1 70 46 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome通用转录途径 352 181 All SZGR 2.0 genes in this pathway
β细胞开发的反应组调节 30 23 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome Notch HLH转录途径 13 8 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Notch的Reactome信号传导 103 64 All SZGR 2.0 genes in this pathway
中村肿瘤区周围与中央DN 634 384 All SZGR 2.0 genes in this pathway
DAVICIONI MOLECULAR ARMS VS ERMS UP 332 228 All SZGR 2.0 genes in this pathway
迪亚兹慢性巨态性白血病 1382 904 All SZGR 2.0 genes in this pathway
ELVIDGE HYPOXIA UP 171 112 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Elvidge Hif1a靶向​​DN 91 58 All SZGR 2.0 genes in this pathway
ELVIDGE HIF1A AND HIF2A TARGETS DN 104 72 All SZGR 2.0 genes in this pathway
DODD NASOPHARYNGEAL CARCINOMA DN 1375 806 All SZGR 2.0 genes in this pathway
lastowska神经母细胞瘤副本编号dn 800 473 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Rashi对电离辐射2的响应2 127 92 All SZGR 2.0 genes in this pathway
斯尼德斯在头部和颈部肿瘤中放大 37 27 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN 855 609 All SZGR 2.0 genes in this pathway
DACOSTA UV RESPONSE VIA ERCC3 COMMON DN 483 336 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲DN 584 395 All SZGR 2.0 genes in this pathway
通过ELK3 DN的缺氧总缺氧 156 106 All SZGR 2.0 genes in this pathway
通过ELK3和HIF1A的总缺氧 142 104 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Nuytten Nipp1靶向 769 437 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Nuytten EZH2靶向 1037 673 All SZGR 2.0 genes in this pathway
SCHAEFFER PROSTATE DEVELOPMENT 48HR DN 428 306 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Shen Smarca2目标 424 268 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Flechner PBL肾脏移植OK vs捐助者 151 100 All SZGR 2.0 genes in this pathway
BYSTRYKH HEMATOPOIESIS STEM CELL QTL TRANS 882 572 All SZGR 2.0 genes in this pathway
MA髓样分化DN 44 30 All SZGR 2.0 genes in this pathway
量缺氧 98 71 All SZGR 2.0 genes in this pathway
外邦紫外线响应集群D9 28 15 All SZGR 2.0 genes in this pathway
阿尔茨海默氏症疾病初期 390 242 All SZGR 2.0 genes in this pathway
阿尔茨海默氏症疾病 1691 1088 All SZGR 2.0 genes in this pathway
dazard对UV SCC DN的响应 123 86 All SZGR 2.0 genes in this pathway
莫迪海马产前 42 33 All SZGR 2.0 genes in this pathway
DAZARD应对紫外线这些DN 318 220 All SZGR 2.0 genes in this pathway
dazard UV响应集群G6 153 112 All SZGR 2.0 genes in this pathway
道格拉斯BMI1靶向 566 371 All SZGR 2.0 genes in this pathway
monnier tradiatiation肿瘤逃脱DN 373 196 All SZGR 2.0 genes in this pathway
由FOXP3绑定的Marson刺激 1022 619 All SZGR 2.0 genes in this pathway
MARSON BOUND BY FOXP3 UNSTIMULATED 1229 713 All SZGR 2.0 genes in this pathway
RIGGINS TAMOXIFEN RESISTANCE DN 220 147 All SZGR 2.0 genes in this pathway
冬季缺氧metagene 242 168 All SZGR 2.0 genes in this pathway
王肿瘤的侵入性DN 210 128 All SZGR 2.0 genes in this pathway
verhaak胶质母细胞瘤pro 177 132 All SZGR 2.0 genes in this pathway
福岛TNFSF11目标 16 14 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Johnstone Parvb目标1 DN 63 39 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Johnstone Parvb目标2 DN 336 211 All SZGR 2.0 genes in this pathway
棕熊UVC响应迟到 1137 655 All SZGR 2.0 genes in this pathway
KOINUMA TARGETS OF SMAD2 OR SMAD3 824 528 All SZGR 2.0 genes in this pathway
ikeda mir133靶向 43 27 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Krieg缺氧不是通过KDM3A 770 480 All SZGR 2.0 genes in this pathway
PEDRIOLI MIR31 TARGETS DN 418 245 All SZGR 2.0 genes in this pathway
rao由SALL4同工型B绑定 517 302 All SZGR 2.0 genes in this pathway