基因页:我知道
概括?
基因 | 3550 |
象征 | 我知道 |
同义词 | CSA2 |红色 |
描述 | IK Cytokine,HLA II的下调剂 |
参考 | MIM:600549|HGNC:HGNC:5958|ENSEMBL:ENSG00000113141|HPRD:02771|Vega:Otthumg00000163374 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 5Q31.3 |
Pascal P值 | 9.088e-6 |
Sherlock P值 | 0.805 |
胎儿β | 0.848 |
DMG | 1(#研究) |
支持 | Ascano FMRP目标 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Nishioka_2013 | 全基因组DNA甲基化分析 | 作者研究了来自18例第一期精神分裂症(FESZ)和15个正常对照的18例外周血细胞中DNA的甲基化谱。 | 1 |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR:0.0032 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG09507928 | 5 | 140027484 | 我知道 | -0.03 | 0.27 | DMG:Nishioka_2013 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/IK_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
PCSK1 | 0.64 | 0.43 |
snap25 | 0.61 | 0.47 |
LRRK2 | 0.61 | 0.46 |
Mkx | 0.60 | 0.40 |
FGFR1OP2 | 0.60 | 0.47 |
ZNF365 | 0.58 | 0.40 |
htr1f | 0.58 | 0.42 |
Gabra1 | 0.58 | 0.43 |
AC110760.2 | 0.58 | 0.41 |
nipal2 | 0.58 | 0.44 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
Bcl7c | -0.33 | -0.36 |
WDR86 | -0.30 | -0.30 |
TBC1D10A | -0.29 | -0.23 |
AL110504.3 | -0.29 | -0.25 |
PKN1 | -0.29 | -0.29 |
emid1 | -0.29 | -0.30 |
SH2B2 | -0.28 | -0.33 |
CENPB | -0.28 | -0.26 |
FADS2 | -0.28 | -0.20 |
C1orf86 | -0.28 | -0.27 |
第三节。基因本体论注释
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0007267 | 细胞细胞信号传导 | 塔斯 | 7970704 | |
去:0006955 | 免疫反应 | 塔斯 | 7970704 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005615 | 细胞外空间 | 塔斯 | 7970704 | |
去:0005625 | 可溶性部分 | 塔斯 | 7970704 | |
去:0005634 | 核 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Deurig t细胞促进性白血病DN | 320 | 184 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌 | 1821年 | 933 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿霉素的Graessmann凋亡 | 1142 | 669 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schlosser血清反应DN | 712 | 443 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pujana ATM PCC网络 | 1442 | 892 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nuytten EZH2靶向DN | 1024 | 594 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath SOX2目标 | 734 | 436 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shipp DLBCL治愈与致命DN | 45 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Flechner PBL肾脏移植OK vs捐助者 | 151 | 100 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Flechner PBL肾脏移植被拒绝与OK DN | 51 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
TACI DN的moreaux b淋巴细胞成熟 | 73 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
整合素信号传导 | 59 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
TACI DN的Moreaux多发性骨髓瘤 | 172 | 107 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Creighton内分泌疗法抗性2 | 473 | 224 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gavin Foxp3目标集群T7 | 98 | 63 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝癌 | 973 | 570 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝肿瘤与正常的相邻组织向上 | 863 | 514 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
肝癌DN中的阿塞维多甲基化 | 940 | 425 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
张乳腺癌祖细胞 | 425 | 253 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pilon KLF1靶向DN | 1972年 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
wakabayashi脂肪形成PPARG绑定8D | 658 | 397 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |