概括
基因 3550
象征 我知道
同义词 CSA2 |红色
描述 IK Cytokine,HLA II的下调剂
参考 MIM:600549|HGNC:HGNC:5958|ENSEMBL:ENSG00000113141|HPRD:02771|Vega:Otthumg00000163374
基因类型 蛋白质编码
地图位置 5Q31.3
Pascal P值 9.088e-6
Sherlock P值 0.805
胎儿β 0.848
DMG 1(#研究)
支持 Ascano FMRP目标

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Nishioka_2013 全基因组DNA甲基化分析 作者研究了来自18例第一期精神分裂症(FESZ)和15个正常对照的18例外周血细胞中DNA的甲基化谱。 1
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR:0.0032
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG09507928 5 140027484 我知道 -0.03 0.27 DMG:Nishioka_2013


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
PCSK1 0.64 0.43
snap25 0.61 0.47
LRRK2 0.61 0.46
Mkx 0.60 0.40
FGFR1OP2 0.60 0.47
ZNF365 0.58 0.40
htr1f 0.58 0.42
Gabra1 0.58 0.43
AC110760.2 0.58 0.41
nipal2 0.58 0.44
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
Bcl7c -0.33 -0.36
WDR86 -0.30 -0.30
TBC1D10A -0.29 -0.23
AL110504.3 -0.29 -0.25
PKN1 -0.29 -0.29
emid1 -0.29 -0.30
SH2B2 -0.28 -0.33
CENPB -0.28 -0.26
FADS2 -0.28 -0.20
C1orf86 -0.28 -0.27

第三节。基因本体论注释

生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0007267 细胞细胞信号传导 塔斯 7970704
去:0006955 免疫反应 塔斯 7970704
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005615 细胞外空间 塔斯 7970704
去:0005625 可溶性部分 塔斯 7970704
去:0005634 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Deurig t细胞促进性白血病DN 320 184 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌 1821年 933 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素的Graessmann凋亡 1142 669 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schlosser血清反应DN 712 443 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pujana ATM PCC网络 1442 892 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten EZH2靶向DN 1024 594 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath SOX2目标 734 436 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shipp DLBCL治愈与致命DN 45 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Flechner PBL肾脏移植OK vs捐助者 151 100 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Flechner PBL肾脏移植被拒绝与OK DN 51 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TACI DN的moreaux b淋巴细胞成熟 73 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
整合素信号传导 59 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TACI DN的Moreaux多发性骨髓瘤 172 107 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性2 473 224 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gavin Foxp3目标集群T7 98 63 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝癌 973 570 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝肿瘤与正常的相邻组织向上 863 514 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肝癌DN中的阿塞维多甲基化 940 425 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张乳腺癌祖细胞 425 253 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
wakabayashi脂肪形成PPARG绑定8D 658 397 该途径中的所有SZGR 2.0基因