Gene Page:IL1A

概括?
GeneID 3552
Symbol IL1A
同义词 IL-1A | IL1 | IL1-ALPHA | IL1F1
描述 interleukin 1 alpha
参考 MIM:147760|HGNC：HGNC：5991|HPRD：00988|
Gene type protein-coding
Map location 2q14
Pascal p-value 0.653
eGene 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
Gene set name Method of gene set 描述 Info
CV:GWAScat 全基因组关联研究 This data set includes 560 SNPs associated with schizophrenia. A total of 486 genes were mapped to these SNPs within 50kb.
CV：GWASDB 全基因组关联研究 gwasdbrecords for schizophrenia
PMID:cooccur 高通量文献搜索 Systematic search in PubMed for genes co-occurring with SCZ keywords. A total of 3027 genes were included.
Association 组合的优势比方法（Sun et al. 2008），协会研究 1 Link to SZGene
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 Psr: 0.0004
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析(All samples) PSR：0.00755
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 Click to show details

第一节遗传学和表观遗传学注释

@eQTL annotation

SNP ID Chromosome Position eGene Gene Entrez ID pvalue qvalue TSS distance eQTL type
RS4854166 chr2 3297005 IL1A 3552 0.13 trans
RS973990 chr4 169763251 IL1A 3552 0.19 trans

Section II. Transcriptome annotation

General gene expression (GTEx)

Not available

Gene expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注：
SC: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

大脑区域没有共表达基因


Section III. Gene Ontology annotation

Molecular function 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
去：0004871 signal transducer activity 塔斯 10748004|10861041
GO:0005149 白介素-1受体结合 IEA -
GO:0005515 protein binding 新闻学会 18329368
Biological process 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
去：0001660 发烧 IEA -
去：0008285 negative regulation of cell proliferation 塔斯 3493774
GO:0006955 immune response IEA -
GO:0006954 inflammatory response 塔斯 6209582
去：0006916 anti-apoptosis 塔斯 10748004
去：0006915 apoptosis 塔斯 1924307
细胞分量 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0005576 extracellular region IEA -
GO:0005615 extracellular space 塔斯 1924307

V.途径注释

Pathway name Pathway size ＃szgr 2.0基因 Info
KEGG MAPK SIGNALING PATHWAY 267 205 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG CYTOKINE CYTOKINE RECEPTOR INTERACTION 267 161 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG APOPTOSIS 88 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG HEMATOPOIETIC CELL LINEAGE 88 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG I型糖尿病 44 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG PRION DISEASES 35 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kegg Leishmania感染 72 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG GRAFT VERSUS HOST DISEASE 42 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA GRANULOCYTES PATHWAY 14 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA LYM PATHWAY 11 6 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA LAIR PATHWAY 17 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA CYTOKINE PATHWAY 22 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA INFLAMPATHWAY 29 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA ERYTH PATHWAY 15 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA IL10 PATHWAY 17 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta NFKB途径 23 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta IL1R途径 33 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA HSP27 PATHWAY 15 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
St FAS信号通路 65 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID IL1途径 34 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID DELTA NP63 PATHWAY 47 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID A6B1 A6B4 INTEGRIN PATHWAY 46 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME SIGNALING BY ILS 107 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome IL1信号传导 39 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME IMMUNE SYSTEM 933 616 该途径中的所有SZGR 2.0基因
免疫系统中的反应组细胞因子信号传导 270 204 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fulcher炎症反应凝集素与LPS 579 346 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHOU INFLAMMATORY RESPONSE LIVE UP 485 293 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHARAFE BREAST CANCER LUMINAL VS BASAL DN 455 304 该途径中的所有SZGR 2.0基因
奥斯曼膀胱癌 404 246 该途径中的所有SZGR 2.0基因
OSWALD HEMATOPOIETIC STEM CELL IN COLLAGEN GEL UP 233 161 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SENESE HDAC1 TARGETS UP 457 269 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC1和HDAC2靶向 238 144 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SENESE HDAC2 TARGETS UP 114 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
周的炎症反应fima 544 308 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KOKKINAKIS METHIONINE DEPRIVATION 48HR UP 128 95 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KOKKINAKIS METHIONINE DEPRIVATION 96HR UP 117 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lindgren膀胱癌簇2B 392 251 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SEITZ NEOPLASTIC TRANSFORMATION BY 8P DELETION DN 30 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
温曼对缺氧DN的适应 41 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BUYTAERT PHOTODYNAMIC THERAPY STRESS UP 811 508 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RICKMAN TUMOR DIFFERENTIATED WELL VS POORLY DN 382 224 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RICKMAN TUMOR DIFFERENTIATED WELL VS MODERATELY DN 110 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WU CELL MIGRATION 184 114 该途径中的所有SZGR 2.0基因
AMIT EGF RESPONSE 120 MCF10A 43 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿米特血清反应40 MCF10A 32 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHANG RESPONSE TO IKK INHIBITOR AND TNF UP 223 140 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ONDER CDH1 TARGETS 2 DN 464 276 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HADDAD B LYMPHOCYTE PROGENITOR 293 193 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hoegerkorp CD44靶向直接 27 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHENG RESPONSE TO ARSENITE DN 18 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHANG RESPONSE TO CANTHARIDIN UP 19 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BLALOCK ALZHEIMERS DISEASE UP 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PAL PRMT5 TARGETS DN 29 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MAHAJAN RESPONSE TO IL1A UP 81 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BILD HRAS ONCOGENIC SIGNATURE 261 166 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BILD CTNNB1致癌特征 82 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FOSTER TOLERANT MACROPHAGE DN 409 268 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Marzec IL2发出信号 115 80 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WORSCHECH TUMOR REJECTION UP 56 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gaurnier PSMD4目标 73 55 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WILENSKY RESPONSE TO DARAPLADIB 29 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRADE COLON VS RECTAL CANCER UP 38 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BHATI G2M ARREST BY 2METHOXYESTRADIOL DN 127 75 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HUPER BREAST BASAL VS LUMINAL UP 54 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RAY ALZHEIMERS DISEASE 13 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura mapk8靶向 1305 895 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RUTELLA RESPONSE TO CSF2RB AND IL4 UP 338 225 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RUTELLA RESPONSE TO HGF UP 418 282 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RUTELLA RESPONSE TO HGF VS CSF2RB AND IL4 UP 408 276 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HINATA NFKB TARGETS KERATINOCYTE UP 91 63 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BUDHU LIVER CANCER METASTASIS DN 7 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SCHOEN NFKB SIGNALING 34 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SEIKE LUNG CANCER POOR SURVIVAL 11 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KUROZUMI RESPONSE TO ONCOCYTIC VIRUS 44 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HIRSCH CELLULAR TRANSFORMATION SIGNATURE UP 242 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHICAS RB1 TARGETS SENESCENT 572 352 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ALTEMEIER RESPONSE TO LPS WITH MECHANICAL VENTILATION 128 81 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GHANDHI DIRECT IRRADIATION UP 110 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GHANDHI BYSTANDER IRRADIATION UP 86 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZWANG CLASS 3 TRANSIENTLY INDUCED BY EGF 222 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA SECRETED FACTORS 344 197 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA女性相关 753 411 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA矩阵 1028 559 该途径中的所有SZGR 2.0基因

Section VI. microRNA annotation

miRNA family Target position mirna id miRNA seq
UTR start UTR end Match method
mir-181 125 131 m8 hsa-miR-181a脑 aacauucaacgcugucggugagu
hsa-miR-181bSZ AACAUUCAUUGCUGUCGGUGGG
hsa-miR-181c脑 aacauucaaccugucggugagu
hsa-miR-181d脑 AACAUUCAUUGUUGUCGGUGGGUU
miR-30-5p 129 136 1A,m8 hsa-miR-30a-5p UGUAAACAUCCUCGACUGGAAG
HSA-MIR-30C脑 uguaaacauccuacucucucucucagc
HSA-MIR-30DSZ uguaaacauccccgacuggaag
HSA-MIR-30BSZ UGUAAACAUCCUACACUCAGCU
HSA-MIR-30E-5P uguaaacauccuugacugga
mir-493-5p 53 59 m8 hsa-miR-493-5p UUGUACAUGGUAGGCUUUCAUU
miR-543 126 132 m8 HSA-MIR-543 AAACAUUCGCGGUGCACUUCU