概括?
GeneID 3553
Symbol IL1B
同义词 IL-1|IL1-BETA|IL1F2
描述 interleukin 1 beta
参考 MIM:147720|HGNC:HGNC:5992|ENSEMBL:ENSG00000125538|HPRD:00985|织女:OTTHUMG00000131344
Gene type protein-coding
地图位置 2q14
Pascal P值 0.876
Fetal beta -1.873
eGene 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
Gene set name 基因组方法 描述 Info
PMID:cooccur 高通量文献搜索 Systematic search in PubMed for genes co-occurring with SCZ keywords. A total of 3027 genes were included.
Association 组合的优势比方法(Sun et al. 2008),协会研究 2 链接到Szgene
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 Psr: 0.0004
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析(所有样品) PSR:0.00755
文学 高通量文献搜索 Co-occurance with Schizophrenia keywords: schizophrenia,schizophrenic,schizophrenics,schizophrenias Click to show details
网络 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 PPI网络中最短路径的贡献:31

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID Chromosome Position eGene Gene Entrez ID PVALUE qvalue TSS distance eQTL type
rs17013080 chr1 208862652 IL1B 3553 4.485E-4 trans
rs4844714 chr1 208874118 IL1B 3553 0 trans
RS10494904 chr1 208883320 IL1B 3553 0 trans
rs12097986 chr1 208883360 IL1B 3553 0 trans
rs848543 chr2 36706946 IL1B 3553 0.16 trans
rs17652498 chr2 107381016 IL1B 3553 0.09 trans
rs1374998 chr2 107398083 IL1B 3553 0.06 trans
rs7445750 chr5 104331223 IL1B 3553 0.05 trans
rs1498477 chr11 5440619 IL1B 3553 0.14 trans
rs1498476 chr11 5440664 IL1B 3553 0.18 trans
RS2016533 chr12 51366259 IL1B 3553 0.08 trans
rs8072151 chr17 50228268 IL1B 3553 0.19 trans
RS1373093 chr18 69804840 IL1B 3553 0 trans
rs1344430 chr20 60099390 IL1B 3553 0.03 trans
RS6639914 chrX 7554094 IL1B 3553 0.04 trans

Section II. Transcriptome annotation

General gene expression (GTEx)

无法使用

Gene expression during devlopment (BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

Gene expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

大脑区域没有共表达基因


Section III. Gene Ontology annotation

Molecular function 去term Evidence Neuro keywords PubMed ID
去:0004871 signal transducer activity 塔斯 10786823
去:0005149 白介素-1受体结合 NAS 1919436
去:0005515 protein binding 新闻学会 9062193
Biological process 去term Evidence Neuro keywords PubMed ID
去:0000187 activation of MAPK activity 艾达 10748004
去:0001660 发烧 IEA -
去:0001934 positive regulation of protein amino acid phosphorylation 艾达 10748004
去:0007267 cell-cell signaling 塔斯 2989698
去:0007165 signal transduction 塔斯 9218611|10786823
去:0008285 细胞增殖的阴性调节 塔斯 3493774
去:0006955 immune response IEA -
去:0006954 inflammatory response NAS 1919436
去:0006916 anti-apoptosis 艾达 10748004
去:0006915 apoptosis 塔斯 9218611
去:0051091 转录因子活性的正调控 艾达 10748004
去:0032755 positive regulation of interleukin-6 production IEA -
去:0019221 cytokine-mediated signaling pathway 艾达 10748004
去:0030593 中性粒细胞趋化性 IEA -
去:0043123 positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB cascade IEA -
去:0045080 positive regulation of chemokine biosynthetic process IEA -
去:0046330 positive regulation of JNK cascade IEA -
去:0045410 positive regulation of interleukin-6 biosynthetic process IEA -
去:0045429 一氧化氮生物合成过程的阳性调节 艾达 8383325
去:0050900 leukocyte migration IEA -
去:0050796 regulation of insulin secretion 艾达 8383325
细胞分量 去term Evidence Neuro keywords PubMed ID
去:0005576 extracellular region NAS 1919436
去:0005615 extracellular space 塔斯 3493774

V.途径注释

Pathway name Pathway size #szgr 2.0基因 Info
KEGG MAPK SIGNALING PATHWAY 267 205 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG细胞因子细胞因子受体相互作用 267 161 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg凋亡 88 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG TOLL LIKE RECEPTOR SIGNALING PATHWAY 102 88 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG NOD LIKE RECEPTOR SIGNALING PATHWAY 62 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg胞质DNA感应途径 56 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG HEMATOPOIETIC CELL LINEAGE 88 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG I型糖尿病 44 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kegg阿尔茨海默氏病 169 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG PRION DISEASES 35 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kegg Leishmania感染 72 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG GRAFT VERSUS HOST DISEASE 42 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA IL5 PATHWAY 10 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA NTHI PATHWAY 24 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta IL1R途径 33 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SA MMP CYTOKINE CONNECTION 15 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID IL27 PATHWAY 26 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID IL12 2PATHWAY 63 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID IL1途径 34 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID IFNG途径 40 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID IL23 PATHWAY 37 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID ANTHRAX PATHWAY 17 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME SIGNALING BY ILS 107 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome IL1信号传导 39 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome免疫系统 933 616 该途径中的所有SZGR 2.0基因
免疫系统中的反应组细胞因子信号传导 270 204 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fulcher炎症反应凝集素与LPS 579 346 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHOU INFLAMMATORY RESPONSE LIVE UP 485 293 该途径中的所有SZGR 2.0基因
pramoonjago sox4靶向 52 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Corre多发性骨髓瘤 74 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DIAZ CHRONIC MEYLOGENOUS LEUKEMIA UP 1382 904 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DOANE RESPONSE TO ANDROGEN UP 184 125 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GAL LEUKEMIC STEM CELL DN 244 153 该途径中的所有SZGR 2.0基因
OSWALD HEMATOPOIETIC STEM CELL IN COLLAGEN GEL UP 233 161 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HOEBEKE LYMPHOID STEM CELL DN 86 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PEPPER CHRONIC LYMPHOCYTIC LEUKEMIA UP 33 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
周的炎症反应fima 544 308 该途径中的所有SZGR 2.0基因
周炎性反应lps up 431 237 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graham CML静止与CML分裂 23 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graham CML静止与正常分裂 57 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graham CML划分与正常静止DN 95 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRAHAM NORMAL QUIESCENT VS NORMAL DIVIDING UP 66 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
hahtola兄弟姐妹fungoides cd4 up 64 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KOKKINAKIS METHIONINE DEPRIVATION 48HR UP 128 95 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KOKKINAKIS METHIONINE DEPRIVATION 96HR DN 75 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV响应角质形成细胞 530 342 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲基化调节的米西亚利亚 126 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DARWICHE SKIN TUMOR PROMOTER DN 185 115 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Darwiche Papilloma风险低 162 104 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DARWICHE PAPILLOMA RISK HIGH UP 147 101 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DARWICHE SQUAMOUS CELL CARCINOMA UP 146 104 该途径中的所有SZGR 2.0基因
标记HDAC目标DN 15 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
烟程序NFKB靶向被糖皮质激素抑制 24 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NUYTTEN EZH2 TARGETS UP 1037 673 该途径中的所有SZGR 2.0基因
AMIT EGF RESPONSE 120 MCF10A 43 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SHIN B CELL LYMPHOMA CLUSTER 6 11 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张对IKK抑制剂和TNF的反应 223 140 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onder CDH1目标2 DN 464 276 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ONDER CDH1 TARGETS 1 DN 169 102 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ONDER CDH1 TARGETS 3 DN 59 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FLECHNER PBL KIDNEY TRANSPLANT OK VS DONOR DN 41 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MAGRANGEAS MULTIPLE MYELOMA IGG VS IGA DN 26 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TENEDINI MEGAKARYOCYTE MARKERS 66 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BROWN MYELOID CELL DEVELOPMENT UP 165 100 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Galindo对肠毒素的免疫反应 85 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
松本自然杀手差分 475 313 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEI MYB TARGETS 318 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HESS TARGETS OF HOXA9 AND MEIS1 DN 77 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LENAOUR DENDRITIC CELL MATURATION DN 128 90 该途径中的所有SZGR 2.0基因
THEILGAARD NEUTROPHIL AT SKIN WOUND UP 77 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NPM1的Verhaak AML突变 183 111 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Basso CD40信号向上 101 76 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MCLACHLAN DENTAL CARIES DN 245 144 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEEN RESPONSE TO ROSIGLITAZONE DN 106 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Jazaeri乳腺癌BRCA1 vs BRCA2 UP 49 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
dazard对UV SCC的反应 123 75 该途径中的所有SZGR 2.0基因
在胰腺癌中被甲基化沉默的Sato 1 419 273 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SESTO RESPONSE TO UV C3 20 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MAHAJAN RESPONSE TO IL1A UP 81 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
麦克拉克兰牙科龋齿 253 147 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BILD E2F3 ONCOGENIC SIGNATURE 246 153 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BILD HRAS ONCOGENIC SIGNATURE 261 166 该途径中的所有SZGR 2.0基因
促进耐受巨噬细胞DN 409 268 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kondo EZH2目标 245 148 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Worschech肿瘤排斥 56 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ACEVEDO METHYLATED IN LIVER CANCER DN 940 425 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HUPER BREAST BASAL VS LUMINAL UP 54 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CROMER TUMORIGENESIS UP 63 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
VART KSHV INFECTION ANGIOGENIC MARKERS UP 165 118 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LINDSTEDT DENDRITIC CELL MATURATION A 67 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对CSF2RB和IL4 DN的响应 315 201 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RUTELLA RESPONSE TO HGF UP 418 282 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RUTELLA RESPONSE TO HGF VS CSF2RB AND IL4 UP 408 276 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SWEET LUNG CANCER KRAS DN 435 289 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HINATA NFKB TARGETS KERATINOCYTE UP 91 63 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HINATA NFKB TARGETS FIBROBLAST UP 84 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Han Satb1靶向 395 249 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HAN SATB1 TARGETS DN 442 275 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BUDHU LIVER CANCER METASTASIS DN 7 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SCHOEN NFKB SIGNALING 34 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SEIKE LUNG CANCER POOR SURVIVAL 11 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KUROZUMI RESPONSE TO ONCOCYTIC VIRUS 44 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
黄成人组织茎模块 721 492 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HIRSCH CELLULAR TRANSFORMATION SIGNATURE UP 242 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PILON KLF1 TARGETS UP 504 321 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BOSCO过敏原诱导TH2相关模块 151 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ALTEMEIER RESPONSE TO LPS WITH MECHANICAL VENTILATION 128 81 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LIM MAMMARY STEM CELL UP 489 314 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GHANDHI DIRECT IRRADIATION UP 110 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GHANDHI BYSTANDER IRRADIATION UP 86 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZWANG CLASS 3 TRANSIENTLY INDUCED BY EGF 222 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA SECRETED FACTORS 344 197 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA女性相关 753 411 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA矩阵 1028 559 该途径中的所有SZGR 2.0基因