Gene Page:IL1RN

概括?
基因 3557
象征 IL1RN
Synonyms DIRA|ICIL-1RA|IL-1RN|IL-1ra|IL-1ra3|IL1F3|IL1RA|IRAP|MVCD4
Description interleukin 1 receptor antagonist
Reference MIM:147679|HGNC:HGNC:6000|Ensembl:ENSG00000136689|HPRD:00978|Vega:OTTHUMG00000131341
Gene type protein-coding
Map location 2q14.2
Pascal p-value 0.672
Fetal beta -0.287

数据源中的基因
Gene set name Method of gene set Description Info
CV:PGCnp Genome-wide Association Study GWAS
PMID:cooccur High-throughput literature-search Systematic search in PubMed for genes co-occurring with SCZ keywords. A total of 3027 genes were included.
Association A combined odds ratio method (Sun et al. 2008），协会研究 2 Link to SZGene
GSMA_I Genome scan meta-analysis Psr: 0.0004
GSMA_IIA Genome scan meta-analysis (All samples) Psr: 0.00755
Literature High-throughput literature-search 与精神分裂症Co-occurance关键词: schizophrenia,schizophrenic,schizophrenias 点击to show details

第一节遗传学和表观遗传学注释


Section II. Transcriptome annotation

General gene expression (GTEx)

Not available

Gene expression during devlopment (BrainCloud)

脚注：
A total of 269 time points ploted, with n=38 fetal samples (x=1:38). Each triangle represents one time point.

Gene expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注：
SC: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

No co-expressed genes in brain regions


Section III. Gene Ontology annotation

Molecular function GO term Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0005152 interleukin-1 receptor antagonist activity TAS 7629520
GO:0005515 protein binding 新闻学会 9062194
生物过程 GO term Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0006955 immune response NAS 7629520
GO:0006954 inflammatory response IDA 10443688
GO:0051384 response to glucocorticoid stimulus IDA 10443688
Cellular component GO term Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0005576 extracellular region IEA -
GO:0005615 extracellular space TAS 1385987
GO:0005622 intracellular NAS 7629520
GO:0005737 细胞质 IEA -

V.途径注释

Pathway name Pathway size # SZGR 2.0 genes in pathway Info
Biocarta IL1R途径 33 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID IL1 PATHWAY 34 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME SIGNALING BY ILS 107 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome IL1信号传导 39 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME IMMUNE SYSTEM 933 616 该途径中的所有SZGR 2.0基因
免疫系统中的反应组细胞因子信号传导 270 204 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FULCHER INFLAMMATORY RESPONSE LECTIN VS LPS UP 579 346 该途径中的所有SZGR 2.0基因
gal白血病干细胞DN 244 153 该途径中的所有SZGR 2.0基因
OSWALD HEMATOPOIETIC STEM CELL IN COLLAGEN GEL UP 233 161 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MULLIGHAN MLL SIGNATURE 1 UP 380 236 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MULLIGHAN MLL SIGNATURE 2 UP 418 263 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TONKS TARGETS OF RUNX1 RUNX1T1 FUSION HSC DN 187 115 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TONKS TARGETS OF RUNX1 RUNX1T1 FUSION ERYTHROCYTE UP 157 104 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TONKS TARGETS OF RUNX1 RUNX1T1 FUSION SUSTAINDED IN ERYTHROCYTE UP 44 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
JAATINEN HEMATOPOIETIC STEM CELL DN 226 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graham CML静止与正常静止 87 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRAHAM CML QUIESCENT VS NORMAL DIVIDING UP 57 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DELYS THYROID CANCER UP 443 294 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CASTELLANO NRAS TARGETS UP 68 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PEREZ TP63 TARGETS 355 243 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SANCHEZ MDM2 TARGETS 15 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
悍马皮肤癌进展 88 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRUETZMANN PANCREATIC CANCER UP 358 245 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SHETH LIVER CANCER VS TXNIP LOSS PAM2 153 102 该途径中的所有SZGR 2.0基因
INGRAM SHH TARGETS DN 64 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FUJIWARA PARK2 IN LIVER CANCER UP 8 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
里克曼头颈癌E 89 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GOTZMANN EPITHELIAL TO MESENCHYMAL TRANSITION DN 206 136 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SHEN SMARCA2 TARGETS DN 357 212 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LIN SILENCED BY TUMOR MICROENVIRONMENT 108 73 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHANG RESPONSE TO IKK INHIBITOR AND TNF UP 223 140 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ONDER CDH1 TARGETS 2 DN 464 276 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SMITH TERT TARGETS DN 87 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BYSTRYKH HEMATOPOIESIS STEM CELL QTL TRANS 882 572 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BROWN MYELOID CELL DEVELOPMENT UP 165 100 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GALINDO IMMUNE RESPONSE TO ENTEROTOXIN 85 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEI MYB TARGETS 318 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NEMETH INFLAMMATORY RESPONSE LPS UP 88 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TAVOR CEBPA TARGETS UP 48 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KUMAR TARGETS OF MLL AF9 FUSION 405 264 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZAMORA NOS2 TARGETS UP 69 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHANG IMMORTALIZED BY HPV31 DN 65 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BROWNE HCMV INFECTION 18HR UP 178 111 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SESTO RESPONSE TO UV C0 107 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MCLACHLAN DENTAL CARIES DN 245 144 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MCLACHLAN DENTAL CARIES UP 253 147 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KRIGE RESPONSE TO TOSEDOSTAT 6HR UP 953 554 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KRIGE RESPONSE TO TOSEDOSTAT 24HR UP 783 442 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性1 528 324 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FOSTER TOLERANT MACROPHAGE UP 156 92 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SARRIO EPITHELIAL MESENCHYMAL TRANSITION DN 154 101 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ambrosini Flavopiridol处理TP53 109 63 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CROMER TUMORIGENESIS DN 51 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ICHIBA GRAFT VERSUS HOST DISEASE D7 UP 107 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LINDSTEDT DENDRITIC CELL MATURATION A 67 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura mapk8靶向 1305 895 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SCHRAETS MLL TARGETS DN 33 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
VANASSE BCL2 TARGETS UP 40 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hinata NFKB靶向角质形成细胞 91 63 该途径中的所有SZGR 2.0基因
COLINA TARGETS OF 4EBP1 AND 4EBP2 356 214 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MIKKELSEN MEF LCP WITH H3K4ME3 128 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CAIRO LIVER DEVELOPMENT DN 222 141 该途径中的所有SZGR 2.0基因
OHGUCHI LIVER HNF4A TARGETS UP 44 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Plasari TGFB1目标10小时DN 244 157 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WANG MLL TARGETS 289 188 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Delacroix Rarg Bound MEF 367 231 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ALTEMEIER RESPONSE TO LPS WITH MECHANICAL VENTILATION 128 81 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZWANG CLASS 3 TRANSIENTLY INDUCED BY EGF 222 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA SECRETED FACTORS 344 197 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA MATRISOME ASSOCIATED 753 411 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA MATRISOME 1028 559 该途径中的所有SZGR 2.0基因

Section VI. microRNA annotation

miRNA family Target position miRNA ID miRNA seq
UTR start UTR end Match method
mir-122 763 769 1A hsa-miR-122a UGGAGUGUGACAAUGGUGUUUGU
miR-224 1103 1109 m8 HSA-MIR-224 CAAGUCACUAGUGGUUCCGUUUA