基因页:IL5
概括?
基因 | 3567 |
象征 | IL5 |
同义词 | EDF | IL-5 | TRF |
描述 | 白介素5 |
参考 | MIM:147850|HGNC:HGNC:6016|ENSEMBL:ENSG00000113525|HPRD:00997|Vega:Otthumg0000000059496 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 5Q31.1 |
Pascal P值 | 0.108 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR:0.0032 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS2385509 | CHR1 | 237006972 | IL5 | 3567 | 0.12 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/IL5_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
ABHD3 | 0.62 | 0.45 |
pygl | 0.58 | 0.43 |
Scube2 | 0.54 | 0.40 |
MTMR11 | 0.53 | 0.43 |
GDPD2 | 0.53 | 0.40 |
SLC2A10 | 0.52 | 0.30 |
ITGB5 | 0.52 | 0.43 |
GPR1 | 0.52 | 0.20 |
PTN | 0.51 | 0.37 |
C18orf51 | 0.51 | 0.43 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
GPR22 | -0.27 | -0.23 |
Sorcs1 | -0.27 | -0.28 |
klhl1 | -0.26 | -0.21 |
IER5L | -0.26 | -0.26 |
LMO7 | -0.26 | -0.22 |
ppm1l | -0.26 | -0.25 |
GPR21 | -0.25 | -0.26 |
myt1l | -0.25 | -0.25 |
NDRG1 | -0.25 | -0.22 |
C1orf96 | -0.25 | -0.24 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005125 | 细胞因子活性 | IEA | - | |
去:0005137 | 白介素-5受体结合 | 塔斯 | 3024129 | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0006955 | 免疫反应 | IEA | - | |
去:0006954 | 炎症反应 | 塔斯 | 3498940 | |
去:0050731 | 肽基 - 酪氨酸磷酸化的阳性调节 | ISS | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005576 | 细胞外区域 | IEA | - | |
去:0005615 | 细胞外空间 | 塔斯 | 3024129 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG细胞因子细胞因子受体相互作用 | 267 | 161 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg jak stat信号通路 | 155 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG造血细胞谱系 | 88 | 60 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg t细胞受体信号通路 | 108 | 89 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg fc epsilon ri信号传导途径 | 79 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
IGA生产的KEGG肠道免疫网络 | 48 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kegg哮喘 | 30 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG自身免疫性甲状腺疾病 | 53 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG同种异体拒绝 | 38 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
生物卡塔尔细胞因子途径 | 22 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta fordam途径 | 29 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta DC途径 | 22 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta GATA3途径 | 16 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta IL5途径 | 10 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
生物卡塔茎途径 | 15 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta NKT途径 | 29 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID SMAD2 3核途径 | 82 | 63 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID IL4 2 Pathway | 65 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
pid nfat tfpathway | 47 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
pid reg gr途径 | 82 | 60 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID IL5途径 | 14 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID AP1途径 | 70 | 60 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ILS的Reactome信号传导 | 107 | 86 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome IL 3 5和GM CSF信号传导 | 43 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome IL受体SHC信号传导 | 27 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome IL 2信号传导 | 41 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome免疫系统 | 933 | 616 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
免疫系统中的反应组细胞因子信号传导 | 270 | 204 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Odonnell TFRC靶向 | 456 | 228 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
烟程序NFKB靶向被糖皮质激素抑制 | 24 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
真菌IL2信号2 | 12 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
具有STAT5结合位点的真菌IL2目标T1 | 9 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Okumura炎症反应LPS | 183 | 115 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Marzec IL2发出信号 | 115 | 80 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Worschech肿瘤排斥 | 56 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Budhu肝癌转移 | 10 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim所有疾病少突胶质细胞编号cor dn | 36 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
金双相情感障碍少突胶质细胞密度cor dn | 88 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BOSCO过敏原诱导TH2相关模块 | 151 | 86 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA分泌因素 | 344 | 197 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA女性相关 | 753 | 411 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA矩阵 | 1028 | 559 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |