Summary
基因 3570
象征 IL6R
同义词 CD126 | IL-6R-1 | IL-6RA | IL6Q | IL6RA | IL6RQ | GP80
Description 白介素6受体
Reference MIM:147880|HGNC:HGNC:6019|ENSEMBL:ENSG00000160712|HPRD:01000|Vega:Otthumg0000000036073
基因类型 蛋白质编码
地图位置 1q21
胎儿β -0.382

基因in Data Sources
基因集名称 基因组方法 Description 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur High-throughput literature-search PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
GSMA_I Genome scan meta-analysis PSR:0.0235
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析(所有样品) PSR:0.00814
literature High-throughput literature-search Co-occurance with Schizophrenia keywords: schizophrenia,schizophrenias 点击显示详细信息

Section I. Genetics and epigenetics annotation


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

Footnote:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

Footnote:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AC012652.1 0.77 0.81
Arhgef3 0.76 0.80
LRRC2 0.74 0.82
FAM19A1 0.74 0.81
RIMBP2 0.73 0.76
Rapgefl1 0.73 0.81
RP4-788L13.1 0.72 0.70
P4HA2 0.72 0.78
DLG2 0.72 0.68
Garnl4 0.72 0.73
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
Impa2 -0.41 -0.47
Sorbs3 -0.38 -0.41
FAM181B -0.37 -0.44
MAPKAPK3 -0.36 -0.34
Rab13 -0.36 -0.50
AF347015.18 -0.35 -0.24
peci -0.35 -0.38
ACSF2 -0.35 -0.32
AF347015.26 -0.35 -0.21
AF347015.21 -0.34 -0.19

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0004872 受体活性 IEA -
去:0004896 细胞因子受体活性 IEA -
GO:0004915 白介素6受体活性 TAS 2261637
GO:0019899 酶结合 IPI 12748171
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0007166 细胞表面受体信号转导有关 TAS 3136546
GO:0008283 cell proliferation TAS 3136546
去:0006955 免疫反应 TAS 3136546
去:0007275 多细胞生物发育 TAS 3136546
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005576 细胞外区域 艾达 12748171
去:0005896 白介素6受体复合物 TAS 3136546
去:0005886 质膜 IEA -
GO:0016323 基底外侧质膜 IEA -

Section V. Pathway annotation

路径名 路径大小 # SZGR 2.0 genes in pathway 信息
KEGG细胞因子细胞因子受体相互作用 267 161 All SZGR 2.0 genes in this pathway
kegg jak stat信号通路 155 105 All SZGR 2.0 genes in this pathway
KEGG造血细胞谱系 88 60 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Biocarta IL6途径 22 16 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Biocarta Her2途径 22 17 All SZGR 2.0 genes in this pathway
ST Stat3途径 11 10 All SZGR 2.0 genes in this pathway
SA MMP细胞因子连接 15 9 All SZGR 2.0 genes in this pathway
PID SHP2 PATHWAY 58 46 All SZGR 2.0 genes in this pathway
PID IL6 7途径 47 40 All SZGR 2.0 genes in this pathway
ILS的Reactome信号传导 107 86 All SZGR 2.0 genes in this pathway
REACTOME IL 6 SIGNALING 11 9 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome免疫系统 933 616 All SZGR 2.0 genes in this pathway
REACTOME CYTOKINE SIGNALING IN IMMUNE SYSTEM 270 204 All SZGR 2.0 genes in this pathway
lIU SOX4 TARGETS UP 137 94 All SZGR 2.0 genes in this pathway
HUTTMANN B CLL POOR SURVIVAL UP 276 187 All SZGR 2.0 genes in this pathway
VECCHI GASTRIC CANCER EARLY DN 367 220 All SZGR 2.0 genes in this pathway
NUP98 HOXA9 Fusion 6hr DN的Takeda目标 41 29 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mullighan mll签名1 380 236 All SZGR 2.0 genes in this pathway
MULLIGHAN MLL SIGNATURE 2 UP 418 263 All SZGR 2.0 genes in this pathway
runx1 runx1t1融合HSC DN的TONKS目标 187 115 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Senese HDAC1靶向 457 269 All SZGR 2.0 genes in this pathway
SENESE HDAC1 AND HDAC2 TARGETS UP 238 144 All SZGR 2.0 genes in this pathway
剑麻结肠直肠腺瘤DN 291 176 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Nagashima NRG1信号向上发出 176 123 All SZGR 2.0 genes in this pathway
ENK UV响应表皮DN 508 354 All SZGR 2.0 genes in this pathway
环氧化物素的浓凋亡 239 157 All SZGR 2.0 genes in this pathway
阿霉素的Graessmann凋亡 1142 669 All SZGR 2.0 genes in this pathway
GRAESSMANN RESPONSE TO MC AND DOXORUBICIN UP 612 367 All SZGR 2.0 genes in this pathway
McBryan Pubertal乳房5 6WK DN 137 97 All SZGR 2.0 genes in this pathway
McBryan Pubertal乳房6 7WK UP 197 135 All SZGR 2.0 genes in this pathway
DUNNE TARGETS OF AML1 MTG8 FUSION UP 52 32 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mattioli多发性骨髓瘤,有14q32易位 36 25 All SZGR 2.0 genes in this pathway
PATIL LIVER CANCER 747 453 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Nuytten Nipp1靶向DN 848 527 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Nuytten EZH2靶向 1037 673 All SZGR 2.0 genes in this pathway
buytaert光动力疗法压力 811 508 All SZGR 2.0 genes in this pathway
TARTE PLASMA CELL VS B LYMPHOCYTE UP 78 51 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Tenedini Megakaryocyte标记 66 48 All SZGR 2.0 genes in this pathway
ZHAN MULTIPLE MYELOMA CD1 AND CD2 DN 51 32 All SZGR 2.0 genes in this pathway
HOFMANN CELL LYMPHOMA DN 39 29 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Lenaour树突状细胞成熟DN 128 90 All SZGR 2.0 genes in this pathway
HADDAD T淋巴细胞和NK祖细胞DN 63 41 All SZGR 2.0 genes in this pathway
阿尔茨海默氏症疾病初期 390 242 All SZGR 2.0 genes in this pathway
阿尔茨海默氏症疾病 1691 1088 All SZGR 2.0 genes in this pathway
KRASNOSELSKAYA ILF3 TARGETS DN 46 38 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Krige对Tosedostat 6小时DN的响应 911 527 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Krige对Tosedostat 24小时DN的反应 1011 592 All SZGR 2.0 genes in this pathway
霍林引用1个目标1 35 25 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Kondo EZH2目标 245 148 All SZGR 2.0 genes in this pathway
海勒被甲基化沉默 282 183 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Heller HDAC靶向DN 292 189 All SZGR 2.0 genes in this pathway
HELLER HDAC TARGETS SILENCED BY METHYLATION DN 281 179 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Smid乳腺癌正常 476 285 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Boquest干细胞培养与新鲜 425 298 All SZGR 2.0 genes in this pathway
李肝癌的生存 185 112 All SZGR 2.0 genes in this pathway
lEE EARLY T LYMPHOCYTE DN 57 36 All SZGR 2.0 genes in this pathway
李幼稚T淋巴细胞 19 10 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Shedden肺癌良好生存A4 196 124 All SZGR 2.0 genes in this pathway
YAGI AML WITH 11Q23 REARRANGED 351 238 All SZGR 2.0 genes in this pathway
黑元对癌细胞病毒的反应 44 30 All SZGR 2.0 genes in this pathway
lOPEZ MESOTHELIOMA SURVIVAL OVERALL UP 7 5 All SZGR 2.0 genes in this pathway
洛佩兹间皮瘤生存 11 9 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Hoshida肝癌亚类S3 266 180 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 All SZGR 2.0 genes in this pathway
DUAN PRDM5 TARGETS 79 52 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Gobert核心少突胶质细胞分化 40 28 All SZGR 2.0 genes in this pathway
wakabayashi脂肪形成PPARG绑定8D 658 397 All SZGR 2.0 genes in this pathway
杨Bcl3靶向 364 236 All SZGR 2.0 genes in this pathway
IRS1和IRS2的GUO目标 98 67 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Zwang 1类由EGF瞬时诱导 516 308 All SZGR 2.0 genes in this pathway

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 miRNA ID mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-208 1550 1556 1a hsa-miR-208 auaagacgaaaaaagcuugu
mir-23 680 687 1A,M8 HSA-MIR-23Abrain AUCACAUUGCCAGGGAUUUCC
HSA-MIR-23Bbrain aucacauugccagggauuacc
mir-323 680 686 1a hsa-miR-323brain gcacauuacggucgaccucu
miR-499 1550 1556 1a HSA-MIR-499 UUAAGACUUGCAGUGAUGUUUAA