基因页:AQP1
Summary?
基因ID | 358 |
象征 | AQP1 |
同义词 | AQP-CHIP | CHIP28 | CO |
描述 | Aquaporin 1(Colton Blood群) |
参考 | MIM:107776|HGNC:HGNC:633|ENSEMBL:ENSG00000240583|HPRD:00140|Vega:Otthumg0000000023944 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 7p14 |
Pascal P值 | 0.859 |
Sherlock P值 | 0.331 |
胎儿β | -2.317 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
基因in Data Sources
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
CV:GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
表达 | 基因表达的荟萃分析 | pvalue: 1.625 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG18080604 | 7 | 30951492 | AQP1 | 4.926E-4 | -0.318 | 0.047 | DMG:Wockner_2014 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS6736648 | CHR2 | 219504142 | AQP1 | 358 | 0.16 | 反式 | ||
RS10484269 | CHR6 | 13201962 | AQP1 | 358 | 0.09 | 反式 | ||
RS10949749 | CHR7 | 158755256 | AQP1 | 358 | 0.18 | 反式 | ||
RS2701519 | CHR15 | 37408650 | AQP1 | 358 | 0.05 | 反式 | ||
rs4789921 | CHR17 | 76939618 | AQP1 | 358 | 0.09 | 反式 | ||
RS16979927 | CHR20 | 55019249 | AQP1 | 358 | 0.02 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/AQP1_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
PLSCR4 | 0.91 | 0.90 |
SSPN | 0.88 | 0.87 |
add3 | 0.87 | 0.84 |
PDLIM5 | 0.87 | 0.76 |
EDNRB | 0.84 | 0.89 |
SLC15A2 | 0.84 | 0.87 |
GJA1 | 0.84 | 0.85 |
PPAP2B | 0.84 | 0.80 |
glud1 | 0.84 | 0.86 |
BMPR1B | 0.83 | 0.77 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
BZW2 | -0.41 | -0.63 |
mpp3 | -0.41 | -0.58 |
KIAA1949 | -0.41 | -0.48 |
mycn | -0.40 | -0.54 |
ZNF124 | -0.40 | -0.61 |
ZNF821 | -0.40 | -0.59 |
NFIL3 | -0.40 | -0.57 |
ISLR2 | -0.40 | -0.56 |
DPF1 | -0.40 | -0.56 |
ZNF48 | -0.39 | -0.57 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005372 | 水运蛋白活性 | 塔斯 | 7521540 | |
去:0005215 | 转运蛋白活性 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0007588 | 排泄 | 塔斯 | 1722319 | |
去:0006833 | 水运 | 塔斯 | 7521540 | |
去:0006810 | 反式port | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
GO:0016020 | 膜 | IEA | - | |
GO:0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - | |
去:0005887 | 质膜的积分 | 塔斯 | 1722319 |