Summary
基因ID 358
象征 AQP1
同义词 AQP-CHIP | CHIP28 | CO
描述 Aquaporin 1(Colton Blood群)
参考 MIM:107776|HGNC:HGNC:633|ENSEMBL:ENSG00000240583|HPRD:00140|Vega:Otthumg0000000023944
基因类型 蛋白质编码
地图位置 7p14
Pascal P值 0.859
Sherlock P值 0.331
胎儿β -2.317
DMG 1(#研究)
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

基因in Data Sources
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 1
表达 基因表达的荟萃分析 pvalue: 1.625

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG18080604 7 30951492 AQP1 4.926E-4 -0.318 0.047 DMG:Wockner_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS6736648 CHR2 219504142 AQP1 358 0.16 反式
RS10484269 CHR6 13201962 AQP1 358 0.09 反式
RS10949749 CHR7 158755256 AQP1 358 0.18 反式
RS2701519 CHR15 37408650 AQP1 358 0.05 反式
rs4789921 CHR17 76939618 AQP1 358 0.09 反式
RS16979927 CHR20 55019249 AQP1 358 0.02 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
PLSCR4 0.91 0.90
SSPN 0.88 0.87
add3 0.87 0.84
PDLIM5 0.87 0.76
EDNRB 0.84 0.89
SLC15A2 0.84 0.87
GJA1 0.84 0.85
PPAP2B 0.84 0.80
glud1 0.84 0.86
BMPR1B 0.83 0.77
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
BZW2 -0.41 -0.63
mpp3 -0.41 -0.58
KIAA1949 -0.41 -0.48
mycn -0.40 -0.54
ZNF124 -0.40 -0.61
ZNF821 -0.40 -0.59
NFIL3 -0.40 -0.57
ISLR2 -0.40 -0.56
DPF1 -0.40 -0.56
ZNF48 -0.39 -0.57

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005372 水运蛋白活性 塔斯 7521540
去:0005215 转运蛋白活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0007588 排泄 塔斯 1722319
去:0006833 水运 塔斯 7521540
去:0006810 反式port IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0016020 IEA -
GO:0016021 膜不可或缺 IEA -
去:0005887 质膜的积分 塔斯 1722319

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KEGG近端小管碳酸氢盐开垦 23 16 All SZGR 2.0 genes in this pathway
小分子的反应组跨膜转运 413 270 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Aquaporins的Reactome被动运输 11 7 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome Aquaporin介导的运输 51 34 All SZGR 2.0 genes in this pathway
肾水通道蛋白对水平衡的反应组调节 44 30 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Bertucci髓质与导管乳腺癌DN 169 118 All SZGR 2.0 genes in this pathway
NUP98 HOXA9 Fusion 6hr DN的Takeda目标 41 29 All SZGR 2.0 genes in this pathway
runx1 runx1t1融合单核细胞的TONKS目标 204 140 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Senese HDAC1和HDAC2靶向DN 232 139 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Senese HDAC2靶向DN 133 77 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Kim WT1靶向12小时 162 116 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Bidus转移DN 161 93 All SZGR 2.0 genes in this pathway
chiaradonna肿瘤转化Kras DN 142 95 All SZGR 2.0 genes in this pathway
chiaradonna肿瘤转化CDC25 DN 153 100 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Markey RB1慢性洛夫 115 78 All SZGR 2.0 genes in this pathway
血清剥夺的Graessmann凋亡 552 347 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Graessmann对MC和血清剥夺的反应 211 136 All SZGR 2.0 genes in this pathway
阿霉素的Graessmann凋亡 1142 669 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Berenjeno由Rhoa永远转变 19 13 All SZGR 2.0 genes in this pathway
berenjeno由Rhoa Up Troment 536 340 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Lindgren膀胱癌簇2B 392 251 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Schaeffer前列腺开发48小时DN 428 306 All SZGR 2.0 genes in this pathway
CERVERA SDHB靶向1个 118 66 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Shepard BMYB Morpholino DN 200 112 All SZGR 2.0 genes in this pathway
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans 882 572 All SZGR 2.0 genes in this pathway
弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok dn 546 351 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Yao Hoxa10通过孕酮靶向 79 58 All SZGR 2.0 genes in this pathway
HOEGERKORP CD44 TARGETS DIRECT UP 27 21 All SZGR 2.0 genes in this pathway
约瑟夫对丁酸钠DN的反应 64 45 All SZGR 2.0 genes in this pathway
糖尿病性肾病 86 48 All SZGR 2.0 genes in this pathway
阿尔茨海默氏症疾病 1691 1088 All SZGR 2.0 genes in this pathway
伯顿成生成3 101 64 All SZGR 2.0 genes in this pathway
伯顿成年时期24小时 43 30 All SZGR 2.0 genes in this pathway
liang被甲基化沉默 32 18 All SZGR 2.0 genes in this pathway
马丁内斯RB1靶向 673 430 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Martinez TP53靶向 602 364 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Martinez RB1和TP53靶向 601 369 All SZGR 2.0 genes in this pathway
SMID乳腺癌腔B DN 564 326 All SZGR 2.0 genes in this pathway
萧述三乳腺癌正常UP 476 285 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Boquest干细胞DN 216 143 All SZGR 2.0 genes in this pathway
甜肺癌Kras DN 435 289 All SZGR 2.0 genes in this pathway
MILI假足趋化性DN 457 302 All SZGR 2.0 genes in this pathway
米利假足型haptotaxis dn 668 419 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Hoshida肝癌亚类S1 237 159 All SZGR 2.0 genes in this pathway
开罗肝脏发展DN 222 141 All SZGR 2.0 genes in this pathway
由MYC DN监管 253 192 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Lee BMP2目标 745 475 All SZGR 2.0 genes in this pathway
双龙血清敏感基因 90 54 All SZGR 2.0 genes in this pathway
FEVR CTNNB1靶向DN 553 343 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Vanloo SP3靶向DN 89 47 All SZGR 2.0 genes in this pathway
pLASARI TGFB1 TARGETS 10HR DN 244 157 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Fortschegger PHF8靶向DN 784 464 All SZGR 2.0 genes in this pathway