基因页：IL10

概括?
基因ID 3586
Symbol IL10
同义词 CSIF|GVHDS|IL-10|IL10A|TGIF
描述 白介素10
参考 MIM：124092|HGNC：HGNC：5962|Ensembl:ENSG00000136634|HPRD:00495|Vega：Otthumg0000000036386
基因type protein-coding
地图位置 1q31-q32
Fetal beta -0.241

数据源中的基因
基因set name 基因组方法 描述 Info
简历：PGCNP Genome-wide Association Study GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 系统的海rch in PubMed for genes co-occurring with SCZ keywords. A total of 3027 genes were included.
Association 组合的优势比方法（Sun et al. 2008），协会研究 3 链接到Szgene
文学 高通量文献搜索 Co-occurance with Schizophrenia keywords: schizophrenia,schizophrenic,schizophrenics,schizophrenias Click to show details
GO_Annotation Mapping neuro-related keywords to Gene Ontology annotations Hits with neuro-related keywords: 2

第一节遗传学和表观遗传学注释


Section II. Transcriptome annotation

基因ral gene expression (GTEx)

Not available

基因expression during devlopment (BrainCloud)

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

基因expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注：
SC: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

Top co-expressed genes in brain regions

Top 10 positively co-expressed genes
基因 Pearson's Correlation Spearman's Correlation
MRPL11 0.81 0.73
MPDU1 0.79 0.78
hadh 0.79 0.73
SNAPIN 0.78 0.75
C17orf81 0.78 0.78
Stoml2 0.76 0.70
ADSL 0.76 0.70
VKORC1 0.75 0.78
mtx1 0.75 0.74
GABARAP 0.75 0.68
前10个负共表达基因
基因 Pearson's Correlation Spearman's Correlation
AF347015.27 -0.46 -0.49
AF347015.18 -0.45 -0.54
AF347015.8 -0.45 -0.48
MT-ATP8 -0.45 -0.53
AF347015.26 -0.45 -0.50
MT-CYB -0.44 -0.47
AF347015.15 -0.42 -0.47
MT-CO2 -0.42 -0.44
AF347015.33 -0.41 -0.45
AF347015.2 -0.41 -0.45

Section III. Gene Ontology annotation

Molecular function 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0005141 interleukin-10 receptor binding NAS 1847510
GO:0005125 cytokine activity IEA -
GO:0005515 protein binding 新闻学会 11485736
Biological process 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0032800 receptor biosynthetic process IDA Neurotransmitter (GO term level: 5) 10443688
GO:0030886 negative regulation of myeloid dendritic cell activation IEA dendrite (GO term level: 8) -
去：0002740 negative regulation of cytokine secretion during immune response IDA 10443688
GO:0002237 response to molecule of bacterial origin IDA 17449476
GO:0007267 cell-cell signaling IC 1847510
GO:0007253 cytoplasmic sequestering of NF-kappaB NAS 10975994
GO:0006955 immune response IEA -
GO:0006954 inflammatory response NAS 9463379
去：0006916 anti-apoptosis NAS 8312229
GO:0010468 基因表达的调节 IDA 9184696
GO:0042100 B cell proliferation NAS 8228801
GO:0030595 leukocyte chemotaxis 塔斯 9405662
去：0042130 T细胞增殖的负调控 NAS 8499633
GO:0042742 对细菌的防御反应 IEA -
GO：0032695 白介素12的负调节 IEA -
去：0042092 T-Helper 2型免疫反应 塔斯 11244051
GO:0032715 negative regulation of interleukin-6 production IDA 10443688
去：0030097 hemopoiesis 塔斯 11244051
GO:0030183 B cell differentiation NAS 8228801
GO:0045191 regulation of isotype switching NAS 8228801
GO：0050715 positive regulation of cytokine secretion IDA 10443688
GO：0045347 negative regulation of MHC class II biosynthetic process 塔斯 11244051
GO：0045348 MHC II类生物合成过程的积极调节 IEA -
GO：0045355 negative regulation of interferon-alpha biosynthetic process NAS 9637497
GO:0051384 response to glucocorticoid stimulus IDA 10443688
细胞分量 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0005576 extracellular region NAS 1847510
GO:0005615 extracellular space IEA -

V.途径注释

Pathway name Pathway size ＃szgr 2.0基因 Info
KEGG CYTOKINE CYTOKINE RECEPTOR INTERACTION 267 161 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG JAK STAT SIGNALING PATHWAY 155 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG T CELL RECEPTOR SIGNALING PATHWAY 108 89 该途径中的所有SZGR 2.0基因
IGA生产的KEGG肠道免疫网络 48 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kegg Leishmania感染 72 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG ASTHMA 30 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG自身免疫性甲状腺疾病 53 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG SYSTEMIC LUPUS ERYTHEMATOSUS 140 100 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG ALLOGRAFT REJECTION 38 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta Asbcell途径 12 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA CYTOKINE PATHWAY 22 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA INFLAM通路 29 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA DC PATHWAY 22 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA IL10 PATHWAY 17 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID SMAD2 3NUCLEAR PATHWAY 82 63 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID IL4 2 Pathway 65 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID AP1 PATHWAY 70 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FULCHER INFLAMMATORY RESPONSE LECTIN VS LPS DN 463 290 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GARY CD5 TARGETS UP 473 314 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHOU INFLAMMATORY RESPONSE LIVE UP 485 293 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TAKEDA TARGETS OF NUP98 HOXA9 FUSION 8D DN 205 127 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA2 PCC NETWORK 423 265 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mantovani NFKB目标 43 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MANTOVANI VIRAL GPCR SIGNALING UP 86 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SHIN B CELL LYMPHOMA CLUSTER 1 13 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NIKOLSKY BREAST CANCER 1Q32 AMPLICON 13 5 该途径中的所有SZGR 2.0基因
克莱因原发性积液淋巴瘤 51 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SU PANCREAS 54 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gavin Foxp3目标集群P7 90 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GAVIN PDE3B TARGETS 22 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
促进耐受巨噬细胞DN 409 268 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Marzec IL2发出信号 115 80 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gaurnier PSMD4目标 73 55 该途径中的所有SZGR 2.0基因
VART KSHV INFECTION ANGIOGENIC MARKERS UP 165 118 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura mapk8靶向 1305 895 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RUTELLA RESPONSE TO CSF2RB AND IL4 UP 338 225 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RUTELLA RESPONSE TO HGF UP 418 282 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RUTELLA RESPONSE TO HGF VS CSF2RB AND IL4 UP 408 276 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Budhu肝癌转移 10 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ONO AML1 TARGETS DN 41 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ono foxp3目标 23 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SEIKE LUNG CANCER POOR SURVIVAL 11 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KUROZUMI RESPONSE TO ONCOCYTIC VIRUS AND CYCLIC RGD 21 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WORSCHECH TUMOR EVASION AND TOLEROGENICITY DN 14 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LU EZH2 TARGETS DN 414 237 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BOSCO TH1细胞毒性模块 114 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA SECRETED FACTORS 344 197 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA女性相关 753 411 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA矩阵 1028 559 该途径中的所有SZGR 2.0基因

Section VI. microRNA annotation

miRNA family Target position mirna id miRNA seq
UTR start UTR end Match method
let-7/98 140 146 1A HSA-LET-7A脑 UGAGGUAGUAGGUUGUAUAGUU
HSA-LET-7B脑 UGAGGUAGUAGGUUGUGUGGUU
HSA-LET-7C脑 UGAGGUAGUAGGUUGUAUGGUU
HSA-LET-7D脑 agagguaguagguugcauagu
HSA-LET-7E脑 UGAGGUAGGAGGUUGUAUAGU
HSA-LET-7F脑 ugagguagauuguauauaguu
hsa-miR-98脑 UGAGGUAGUAAGUUGUAUUGUU
HSA-LET-7GSZ UGAGGUAGUAGUUUGUACAGU
HSA-LET-7I脑 UGAGGUAGUAGUUUGUGCUGU
mir-27 178 184 1A hsa-miR-27a脑 UUCACAGUGGCUAAGUUCCGC
hsa-miR-27b脑 UUCACAGUGGCUAAGUUCUGC
mir-361 135 141 m8 hsa-miR-361脑 UUAUCAGAAUCUCCAGGGGUAC
miR-369-3p 205 211 1A HSA-MIR-369-3P AAUAAUACAUGGUUGAUCUUU
mir-374 205 212 1A,m8 hsa-miR-374 UUAUAAUACAACCUGAUAAGUG