基因页:IL10RA
Summary?
基因ID | 3587 |
象征 | IL10RA |
同义词 | CD210 | CD210A | CDW210A | HIL-10R | IL-10R1 | IL10R |
描述 | 白介素10受体亚基α |
参考 | MIM:146933|HGNC: HGNC: 5964|ENSEMBL:ENSG00000110324|HPRD:00911|Vega:Otthumg00000166523 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 11Q23 |
Pascal P值 | 0.399 |
胎儿β | -0.443 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Vaneijk_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括432个差异甲基化的CpG位点,对应于精神分裂症患者(n = 260)和未受影响的对照(n = 250)之间的391个独特的转录本。 | 1 |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
协会 | 组合的优势比方法(Sun等。2008),协会研究 | 1 | |
GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | Psr: 0.006 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG25894551 | 11 | 117699851 | IL10RA | 8.436E-4 | -5.742 | DMG:Vaneijk_2014 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS10994209 | Chr10 | 61877705 | IL10RA | 3587 | 0.04 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/IL10RA_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
SUCLA2 | 0.90 | 0.92 |
IDH3A | 0.89 | 0.91 |
SLC25A40 | 0.88 | 0.90 |
EFHA2 | 0.88 | 0.92 |
C2orf30 | 0.88 | 0.89 |
ATL1 | 0.88 | 0.90 |
猪 | 0.88 | 0.90 |
GHITM | 0.88 | 0.91 |
arl1 | 0.88 | 0.91 |
tsnax | 0.87 | 0.91 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AL022328.1 | -0.44 | -0.49 |
WDR86 | -0.43 | -0.40 |
SMTN | -0.42 | -0.45 |
NME4 | -0.41 | -0.53 |
ZNF814 | -0.40 | -0.47 |
AC010300.1 | -0.39 | -0.38 |
sigirr | -0.39 | -0.47 |
SH3BP2 | -0.39 | -0.41 |
AF347015.18 | -0.39 | -0.23 |
mylk2 | -0.38 | -0.41 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0004872 | 受体活性 | 塔斯 | 8407942 | |
去:0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 11485736|15837194 | |
去:0004920 | 白介素10受体活性 | 塔斯 | 8120391 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
GO:0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - | |
去:0005886 | 质膜 | 塔斯 | 8407942 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG细胞因子细胞因子受体相互作用 | 267 | 161 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg jak stat信号通路 | 155 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta IL10途径 | 17 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta IL22BP途径 | 16 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
迪亚兹慢性巨型性白血病DN | 116 | 79 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Runx1 Runx1T1融合的tonks靶标在粒细胞DN中维持 | 7 | 6 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
runx1 runx1t1融合HSC DN的TONKS目标 | 187 | 115 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
runx1 runx1t1融合粒细胞DN的TONKS目标 | 17 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
斋丁嫩造血干细胞DN | 226 | 132 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甲状腺癌 | 443 | 294 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Perez TP53目标 | 1174 | 695 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lindgren膀胱癌簇2B | 392 | 251 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
农民乳腺癌簇1 | 44 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Amundson对砷的回应 | 217 | 143 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲DN | 584 | 395 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pujana ATM PCC网络 | 1442 | 892 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
与H3K27me3的Benporath ES | 1118 | 744 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mori前BI淋巴细胞DN | 77 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mori大型BII淋巴细胞DN | 58 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mori未成熟B淋巴细胞向上 | 53 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mori成熟B淋巴细胞向上 | 90 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ross AML与CBFB MYH11融合 | 52 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok up | 87 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HBV感染的Wieland | 101 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Goldrath免疫记忆 | 65 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Haslinger B Cll具有突变的VH基因 | 18 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zhan多发性骨髓瘤CD1和CD2 UP | 89 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yu Myc针对DN | 55 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏症疾病初期 | 390 | 242 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nielsen Gist和滑膜肉瘤DN | 20 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
罗德韦尔老化的肾脏 | 487 | 303 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
麦克拉克兰牙科龋齿 | 253 | 147 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gavin Foxp3目标集群P3 | 160 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gavin IL2响应foxp3靶向 | 19 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由FOXP3绑定的Marson刺激 | 1022 | 619 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由Foxp3绑定的Marson未刺激 | 1229 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
华莱士前列腺癌竞赛 | 299 | 167 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Marzec IL2发出信号 | 115 | 80 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Vilimas Notch1靶向 | 52 | 41 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
陈代谢综合征网络 | 1210 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boyault肝癌子类G5 DN | 27 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen IPS带有HCP H3K27Me3 | 102 | 76 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
黑元对癌细胞病毒的反应 | 44 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
黑元对癌细胞病毒和环状RGD的反应 | 21 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3 | 590 | 403 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马顿人维甲酸的反应 | 857 | 456 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wang对GSK3抑制剂SB216763的响应向上 | 397 | 206 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |