概括
基因 3588
象征 IL10RB
同义词 CDW210B | CRF2-4 | CRFB4 | D21S58 | D21S66 | IL-10R2
描述 白介素10受体亚基beta
参考 MIM:123889|HGNC:HGNC:5965|ENSEMBL:ENSG00000243646|HPRD:00473|Vega:Otthumg0000000065128
基因类型 蛋白质编码
地图位置 21q22.11
Pascal P值 0.093
Sherlock P值 0.085
DMG 2(#研究)
主持人 尾状基底神经节
小脑半球
小脑
皮质
额叶皮质BA9
迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Vaneijk_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括432个差异甲基化的CpG位点,对应于精神分裂症患者(n = 260)和未受影响的对照(n = 250)之间的391个独特的转录本。 2
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 2
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG12829325 21 34638188 IL10RB 2.14e-4 -0.597 0.036 DMG:Wockner_2014
CG17356733 21 34774627 IL10RB 0.002 -2.793 DMG:Vaneijk_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS11088247 CHR21 34603248 IL10RB 3588 0.16 顺式
RS11911133 CHR21 34629174 IL10RB 3588 0.15 顺式
RS2250226 CHR21 34632315 IL10RB 3588 0.1 顺式
RS7874957 Chr9 111970045 IL10RB 3588 0.15 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
TP53I13 0.72 0.72
ACAA2 0.71 0.75
ACSF2 0.68 0.64
MAPKAPK3 0.66 0.68
SLC25A20 0.64 0.67
CDKN2C 0.63 0.65
GNG5 0.63 0.69
NR2E1 0.62 0.53
tnfrsf1a 0.61 0.56
Trip6 0.61 0.68
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
SCN2A -0.51 -0.63
FAM134B -0.50 -0.55
LRFN5 -0.50 -0.61
DNAJC6 -0.50 -0.57
STXBP5 -0.50 -0.58
PCDHAC2 -0.50 -0.58
FRMPD4 -0.49 -0.55
AL031003.1 -0.48 -0.52
FBXW7 -0.48 -0.53
jazf1 -0.48 -0.56

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KEGG细胞因子细胞因子受体相互作用 267 161 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg jak stat信号通路 155 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta IL10途径 17 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
刘sox4靶向 137 94 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GAZDA钻石黑芬贫血红斑dn 493 298 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gary CD5目标 473 314 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan mll签名1 380 236 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan MLL签名2 UP 418 263 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim WT1靶向12小时 162 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
hahtola sezary综合征 98 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV响应角质形成细胞DN 485 334 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC网络 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pujana ATM PCC网络 1442 892 该途径中的所有SZGR 2.0基因
洛佩兹MBD目标 957 597 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mori成熟B淋巴细胞向上 90 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
戈德拉斯体内平衡增殖 171 102 该途径中的所有SZGR 2.0基因
史密斯·泰特(Smith Tert) 145 91 该途径中的所有SZGR 2.0基因
弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok up 87 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Goldrath免疫记忆 65 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Li Wilms肿瘤与胎儿肾脏1 182 119 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yagi AML Fab标记 191 131 该途径中的所有SZGR 2.0基因
牙肺纹状横纹肌肉瘤DN 408 274 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病初期 390 242 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI TCF21目标2 DN 830 547 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
布朗HCMV感染48小时 180 125 该途径中的所有SZGR 2.0基因
杰克逊DNMT1靶向 77 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
敏锐的回应罗格列酮DN 106 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
JI对FSH的响应 74 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Tracey对IFNA2 DN的抗性 32 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kyng对H2O2的响应 71 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因
道格拉斯BMI1靶向 566 371 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zheng由Foxp3绑定 491 310 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伽马和紫外线辐射受kyng DNA损伤 88 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kyng DNA损伤DN 195 135 该途径中的所有SZGR 2.0基因
iwanaga癌变由Kras Pten Up 181 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝肿瘤与正常的相邻组织向上 863 514 该途径中的所有SZGR 2.0基因
陈代谢综合征网络 1210 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yagi AML与11q23重新排列 351 238 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner NPC HCP带有H3K4ME2 491 319 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Worschech肿瘤逃避和耐受性DN 14 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
黄成人组织茎模块 721 492 该途径中的所有SZGR 2.0基因
布朗HCMV感染30分钟 56 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang对GSK3抑制剂SB216763的响应向上 397 206 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bruins通过TP53组B响应UVC响应 549 316 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FEVR CTNNB1靶向 682 433 该途径中的所有SZGR 2.0基因
前列腺癌模型中的Acevedo FGFR1靶标 289 184 该途径中的所有SZGR 2.0基因