基因页:IL12A
Summary?
基因ID | 3592 |
象征 | IL12A |
同义词 | clmf | il-12a | nfsk | nksf1 | p35 |
描述 | 白介素12a |
参考 | MIM:161560|HGNC:HGNC:5969|Ensembl:ENSG00000168811|HPRD:01193|Vega:Otthumg00000158942 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 3Q25.33 |
Pascal P值 | 0.698 |
胎儿β | -0.133 |
基因in Data Sources
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/IL12A_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
Footnote:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
Footnote:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
tesc | 0.78 | 0.65 |
AC005512.1 | 0.70 | 0.57 |
TPD52L1 | 0.69 | 0.54 |
HPCA | 0.69 | 0.57 |
C20orf103 | 0.68 | 0.60 |
pde1b | 0.67 | 0.67 |
LRPAP1 | 0.67 | 0.57 |
TMEM90A | 0.66 | 0.30 |
ppp1r1b | 0.66 | 0.18 |
GSTO2 | 0.65 | 0.51 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
SH2B2 | -0.29 | -0.50 |
FADS2 | -0.29 | -0.40 |
KIAA1949 | -0.29 | -0.41 |
tubb2b | -0.28 | -0.46 |
塔布 | -0.28 | -0.26 |
tubb3 | -0.28 | -0.26 |
MARCKSL1 | -0.28 | -0.34 |
KIAA1211 | -0.28 | -0.29 |
SH3BP2 | -0.28 | -0.45 |
ZNF311 | -0.28 | -0.32 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005125 | 细胞因子活性 | 艾达 | 1674604 | |
去:0005125 | 细胞因子活性 | IEA | - | |
去:0005125 | 细胞因子活性 | 塔斯 | 1673147 | |
GO:0005143 | 白介素12受体结合 | nas | 1674604 | |
去:0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 10899108 | |
GO:0042163 | 白介素12β亚基结合 | IEA | - | |
GO:0046982 | 蛋白质异二聚化活性 | IPI | 1674604 | |
GO:0045513 | interleukin-27绑定 | IPI | 9342359 | |
Biological process | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0002860 | 针对肿瘤细胞靶标的天然杀伤细胞介导的细胞毒性的阳性调节 | 艾达 | 7903063 | |
去:0001916 | T细胞介导的细胞毒性的阳性调节 | 艾达 | 1674604|2204066 | |
去:0007050 | 细胞周期停滞 | 艾达 | 16942485 | |
GO:0010224 | 对UV-B的响应 | 艾达 | 8992506 | |
去:0006955 | 免疫反应 | 塔斯 | 9789052 | |
GO:0032816 | 天然杀伤细胞激活的正调控 | 艾达 | 1674604 | |
GO:0016477 | 细胞迁移 | 艾达 | 7903063 | |
GO:0042102 | T细胞增殖的阳性调节 | IEA | - | |
GO:0032729 | 干扰素生产的积极调节 | 艾达 | 1674604 | |
GO:0032496 | response to lipopolysaccharide | 艾达 | 7605994|8557999 | |
GO:0034393 | 平滑肌细胞凋亡的正调控 | 艾达 | 16942485 | |
GO:0042520 | STAT4蛋白的酪氨酸磷酸化的阳性调节 | 艾达 | 12372421 | |
GO:0045785 | 细胞粘附的阳性调节 | 艾达 | 7903063 | |
GO:0050830 | 对革兰氏阳性细菌的防御反应 | IEP | 1357073 | |
GO:0048662 | 平滑肌细胞增殖的负调节 | 艾达 | 16942485 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005576 | 细胞外区域 | IEA | - | |
GO:0043514 | 白介素12复合物 | 艾达 | 2204066 | |
GO:0043514 | 白介素12复合物 | IEA | - | |
GO:0043514 | 白介素12复合物 | nas | 1674604|14718574 |
V.途径注释
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-21 | 256 | 263 | 1A,M8 | HSA-MIR-21脑 | uagcuuaucagacugauguuga |
hsa-miR-590 | gagcuuauucauaaaaagugcag |