Summary
基因ID 361
象征 AQP4
同义词 miwc | wch4
描述 水通道4
参考 MIM:600308|HGNC:HGNC:637|ENSEMBL:ENSG00000171885|HPRD:02631|Vega:Otthumg00000131955
基因类型 蛋白质编码
地图位置 18Q11.2-Q12.1
Pascal P值 0.127
Sherlock P值 0.011
胎儿β -5.934
主持人 尾状基底神经节
支持 离子平衡
COMPOSITESET

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
表达 基因表达的荟萃分析 p价值:1.548
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关的关键字的命中:1

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AC134312.1 0.67 0.50
mlxipl 0.66 0.58
C6orf27 0.66 0.51
SIRPB1 0.66 0.22
HIPK4 0.65 0.57
Glis1 0.63 0.44
KCNAB2 0.63 0.48
sohlh1 0.63 0.57
KCNT1 0.63 0.48
lynx1 0.62 0.55
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
rps19p3 -0.38 -0.56
RPL12 -0.37 -0.54
C17orf45 -0.37 -0.54
RPL14 -0.37 -0.52
RPL18 -0.37 -0.56
FAM36A -0.37 -0.36
CD24 -0.37 -0.43
rps3p3 -0.37 -0.54
C9orf46 -0.37 -0.51
GTF3C6 -0.37 -0.40

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005372 水运蛋白活性 nas 8855281
去:0005372 水运蛋白活性 塔斯 7559426
去:0005215 转运蛋白活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0007399 神经系统的发展 塔斯 神经突(GO期限:5) 7528931
去:0007588 排泄 塔斯 7528931
去:0006833 水运 nas 8855281
去:0006810 运输 IEA -
去:0006810 运输 塔斯 7559426
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0016020 IEA -
GO:0016020 nas 8855281
GO:0016021 膜不可或缺 IEA -
去:0005887 质膜的积分 塔斯 7528931

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KEGG加压素调节的水重吸收 44 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
小分子的反应组跨膜转运 413 270 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Aquaporins的Reactome被动运输 11 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Aquaporin介导的运输 51 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肾水通道蛋白对水平衡的反应组调节 44 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
vecchi胃癌早期DN 367 220 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan MLL签名1 DN 242 165 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan NPM1签名3 DN 162 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
周炎性反应lps up 431 237 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌 1821年 933 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肺癌吸烟者 80 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ropero HDAC2目标 114 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sansom APC目标 126 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee Calorie限制性新皮层 83 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血干细胞长期 302 191 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染14小时DN 298 200 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McClung Creb1靶向 One hundred. 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lein星形胶质细胞标记 42 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sansom APC目标 212 121 该途径中的所有SZGR 2.0基因
H3K27me3 196 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张GATA6靶向 15 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TGFB1和WNT3A的LABBE目标 111 70 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nutt GBM与AO胶质瘤 46 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YOSHIMURA MAPK8 TARGETS DN 366 257 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hoffmann小型BII至未成熟B淋巴细胞DN 50 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shedden肺癌良好生存A4 196 124 该途径中的所有SZGR 2.0基因
fontaine甲状腺肿瘤不确定恶性肿瘤 36 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO对孕酮簇的时间反应16 79 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO对孕酮簇的时间反应17 181 101 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BAE BRCA1靶向DN 32 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FEVR CTNNB1靶向DN 553 343 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-148/152 11 17 1a HSA-MIR-148A ucagugcacuacaacuuugu
HSA-MIR-152 UCAGUGCAUGACACUUGGG
HSA-MIR-148B ucagugcaucacacaacuuugu
mir-196 501 507 M8 HSA-MIR-196A uagguaguucauguugugug
HSA-MIR-196B uagguaguucuuguugg
mir-29 1622 1628年 1a HSA-MIR-29ASZ uagcaccaucugaaaucgguu
HSA-MIR-29BSZ uagcaccauuugaaaucaguguu
HSA-MIR-29CSZ uagcaccauuugaaaucggu
miR-370 2480 2486 M8 HSA-MIR-370 gccugggggguggaaccugg
mir-384 1626年 1633年 1A,M8 HSA-MIR-384 auuccuagaaauuguucaua
miR-495 78 84 1a HSA-MIR-495 Aaacaaacauggugcacuuuuu