基因页:AQP4
Summary?
基因ID | 361 |
象征 | AQP4 |
同义词 | miwc | wch4 |
描述 | 水通道4 |
参考 | MIM:600308|HGNC:HGNC:637|ENSEMBL:ENSG00000171885|HPRD:02631|Vega:Otthumg00000131955 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 18Q11.2-Q12.1 |
Pascal P值 | 0.127 |
Sherlock P值 | 0.011 |
胎儿β | -5.934 |
主持人 | 尾状基底神经节 |
支持 | 离子平衡 COMPOSITESET |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
表达 | 基因表达的荟萃分析 | p价值:1.548 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关的关键字的命中:1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/AQP4_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AC134312.1 | 0.67 | 0.50 |
mlxipl | 0.66 | 0.58 |
C6orf27 | 0.66 | 0.51 |
SIRPB1 | 0.66 | 0.22 |
HIPK4 | 0.65 | 0.57 |
Glis1 | 0.63 | 0.44 |
KCNAB2 | 0.63 | 0.48 |
sohlh1 | 0.63 | 0.57 |
KCNT1 | 0.63 | 0.48 |
lynx1 | 0.62 | 0.55 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
rps19p3 | -0.38 | -0.56 |
RPL12 | -0.37 | -0.54 |
C17orf45 | -0.37 | -0.54 |
RPL14 | -0.37 | -0.52 |
RPL18 | -0.37 | -0.56 |
FAM36A | -0.37 | -0.36 |
CD24 | -0.37 | -0.43 |
rps3p3 | -0.37 | -0.54 |
C9orf46 | -0.37 | -0.51 |
GTF3C6 | -0.37 | -0.40 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005372 | 水运蛋白活性 | nas | 8855281 | |
去:0005372 | 水运蛋白活性 | 塔斯 | 7559426 | |
去:0005215 | 转运蛋白活性 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0007399 | 神经系统的发展 | 塔斯 | 神经突(GO期限:5) | 7528931 |
去:0007588 | 排泄 | 塔斯 | 7528931 | |
去:0006833 | 水运 | nas | 8855281 | |
去:0006810 | 运输 | IEA | - | |
去:0006810 | 运输 | 塔斯 | 7559426 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
GO:0016020 | 膜 | IEA | - | |
GO:0016020 | 膜 | nas | 8855281 | |
GO:0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - | |
去:0005887 | 质膜的积分 | 塔斯 | 7528931 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG加压素调节的水重吸收 | 44 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
小分子的反应组跨膜转运 | 413 | 270 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Aquaporins的Reactome被动运输 | 11 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome Aquaporin介导的运输 | 51 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
肾水通道蛋白对水平衡的反应组调节 | 44 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
vecchi胃癌早期DN | 367 | 220 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mullighan MLL签名1 DN | 242 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mullighan NPM1签名3 DN | 162 | 116 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
周炎性反应lps up | 431 | 237 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌 | 1821年 | 933 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
肺癌吸烟者 | 80 | 52 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ropero HDAC2目标 | 114 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sansom APC目标 | 126 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee Calorie限制性新皮层 | 83 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伊万诺娃造血干细胞长期 | 302 | 191 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染14小时DN | 298 | 200 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
McClung Creb1靶向 | One hundred. | 72 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lein星形胶质细胞标记 | 42 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sansom APC目标 | 212 | 121 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
H3K27me3 | 196 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
张GATA6靶向 | 15 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
TGFB1和WNT3A的LABBE目标 | 111 | 70 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nutt GBM与AO胶质瘤 | 46 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
YOSHIMURA MAPK8 TARGETS DN | 366 | 257 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hoffmann小型BII至未成熟B淋巴细胞DN | 50 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shedden肺癌良好生存A4 | 196 | 124 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
fontaine甲状腺肿瘤不确定恶性肿瘤 | 36 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
YAO对孕酮簇的时间反应16 | 79 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
YAO对孕酮簇的时间反应17 | 181 | 101 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BAE BRCA1靶向DN | 32 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FEVR CTNNB1靶向DN | 553 | 343 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-148/152 | 11 | 17 | 1a | HSA-MIR-148A | ucagugcacuacaacuuugu |
HSA-MIR-152脑 | UCAGUGCAUGACACUUGGG | ||||
HSA-MIR-148B | ucagugcaucacacaacuuugu | ||||
mir-196 | 501 | 507 | M8 | HSA-MIR-196A | uagguaguucauguugugug |
HSA-MIR-196B | uagguaguucuuguugg | ||||
mir-29 | 1622 | 1628年 | 1a | HSA-MIR-29ASZ | uagcaccaucugaaaucgguu |
HSA-MIR-29BSZ | uagcaccauuugaaaucaguguu | ||||
HSA-MIR-29CSZ | uagcaccauuugaaaucggu | ||||
miR-370 | 2480 | 2486 | M8 | HSA-MIR-370脑 | gccugggggguggaaccugg |
mir-384 | 1626年 | 1633年 | 1A,M8 | HSA-MIR-384 | auuccuagaaauuguucaua |
miR-495 | 78 | 84 | 1a | HSA-MIR-495脑 | Aaacaaacauggugcacuuuuu |