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概括?

基因ID	3611
Symbol	伊尔克
同义词	HEL-S-28\|ILK-1\|ILK-2\|P59\|p59ILK
描述	integrin linked kinase
参考	MIM:602366\|HGNC:HGNC:6040\|ENSEMBL：ENSG00000166333\|HPRD：03842\|Vega:OTTHUMG00000133407
基因type	protein-coding
地图位置	11p15.4
Pascal P值	0.014
Sherlock P值	0.298
eGene	Meta

数据源中的基因

基因set name	基因组方法	描述	Info
简历：PGCNP	全基因组协会研究	GWAS
网络	人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离	Contribution to shortest path in PPI network: 0.2113

第一节遗传学和表观遗传学注释

Section II. Transcriptome annotation

基因ral gene expression (GTEx)

基因expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

Top co-expressed genes in brain regions

Top 10 positively co-expressed genes
基因	皮尔逊的相关性	Spearman's Correlation
NOTCH3	0.86	0.84
LRIG1	0.84	0.86
BMP7	0.81	0.82
ASAP3	0.80	0.77
Syde1	0.79	0.80
羊羔2	0.79	0.85
NRARP	0.79	0.75
CTDSP1	0.79	0.79
LTBP3	0.78	0.79
ZFP36L2	0.77	0.79

前10个负共表达基因
基因	皮尔逊的相关性	Spearman's Correlation
NDUFAF2	-0.46	-0.58
VPS29	-0.45	-0.52
PFDN4	-0.45	-0.60
C20ORF7	-0.44	-0.52
PSMA6	-0.43	-0.57
GPR22	-0.42	-0.45
MRPL1	-0.41	-0.52
PPP2R3C	-0.41	-0.54
FAM92A1	-0.41	-0.50
TAF9	-0.41	-0.50

Section III. Gene Ontology annotation

Molecular function	去的术语	Evidence	Neuro keywords	PubMed ID
GO:0000166	核苷酸结合	IEA		-
GO:0005515	protein binding	新闻学会		16936772\|17353931\|18339839
GO:0005524	ATP结合	NAS		-
GO:0004674	蛋白质丝氨酸/苏氨酸激酶活性	艾达		10871859
去：0004713	protein tyrosine kinase activity	IEA		-
GO:0016740	transferase activity	IEA		-
GO:0016301	kinase activity	IEA		-
Biological process	去的术语	Evidence	Neuro keywords	PubMed ID
去：0001658	ureteric bud branching	IEA		-
去：0007160	细胞 - 矩阵粘附	NAS		-
GO:0006468	蛋白氨基酸磷酸化	艾达		10871859
去：0007229	integrin-mediated signaling pathway	IEA		-
去：0007229	integrin-mediated signaling pathway	NAS		-
去：0008284	细胞增殖的阳性调节	IEA		-
GO:0045197	上皮细胞顶/基础极性的建立或维护	IEA		-
细胞分量	去的术语	Evidence	Neuro keywords	PubMed ID
GO:0005737	细胞质	NAS		-
去：0005925	focal adhesion	IEA		-
GO:0005886	质膜	IEA		-
GO：0030054	细胞连接	IEA		-

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

Interactors	Aliases B	Official full name B	Experimental	资源	PubMed ID
ACP6	ACPL1 \| LPAP \| PACPL1	酸性磷酸酶6，溶物磷酸化	亲和力捕获ms	BioGRID	17353931
AKT1	AKT \| MGC99656 \| PKB \| PKB-ALPHA \| PRKBA \| RAC \| RAC-ALPHA	v-akt murine thymoma viral oncogene homolog 1	-	HPRD，Biogrid	9736715
AUP1	-	ancient ubiquitous protein 1	亲和力捕获ms	BioGRID	17353931
CAV1	CAV \| MSTP085 \| VIP21	caveolin 1, caveolae protein, 22kDa	ILK1与小窝蛋白-1相互作用。	BIND	15722199
COPB2	beta'-COP	coatomer protein complex, subunit beta 2 (beta prime)	亲和力捕获ms	BioGRID	17353931
COPG	COPG1 \| FLJ21068	coatomer protein complex, subunit gamma	亲和力捕获ms	BioGRID	17353931
ddx3x	DBX \| DDX14 \| DDX3 \| HLP2	DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 3, X-linked	亲和力捕获ms	BioGRID	17353931
DHX36	DDX36 \|G4R1 \|KIAA1488 \|MLEL1 \|Rhau	DEAH (Asp-Glu-Ala-His) box polypeptide 36	亲和力捕获ms	BioGRID	17353931
ERH	DROER \| FLJ27340	基本同源物（果蝇）的增强子	亲和力捕获ms	BioGRID	17353931
EWSR1	EWS	尤因肉瘤断裂点区域1	亲和力捕获ms	BioGRID	17353931
FANCI	FLJ10719 \|KIAA1794	Fanconi anemia, complementation group I	亲和力捕获ms	BioGRID	17353931
双子座4	DKFZp434B131 \| DKFZp434D174 \| HC56 \| HCAP1 \| HHRF-1 \| p97	宝石（核管细胞器）相关蛋白4	亲和力捕获ms	BioGRID	17353931
GSK3B	-	glycogen synthase kinase 3 beta	-	HPRD	9736715
heatr1	BAP28 \|FLJ10359 \|MGC72083	HEAT repeat containing 1	亲和力捕获ms	BioGRID	17353931
HeaTr2	FLJ20397 \|FLJ25564 \|FLJ31671 \|FLJ39381	HEAT repeat containing 2	亲和力捕获ms	BioGRID	17353931
HSPB1	CMT2F \| DKFZp586P1322 \| HMN2B \| HS.76067 \| HSP27 \| HSP28 \| Hsp25 \| SRP27	heat shock 27kDa protein 1	亲和力捕获ms	BioGRID	17353931
IGF2BP1	CRD-BP \|CRDBP \|imp-1 \|imp1 \|Vickz1 \|ZBP1	insulin-like growth factor 2 mRNA binding protein 1	亲和力捕获ms	BioGRID	17353931
伊尔克	DKFZp686F1765 \| P59	integrin-linked kinase	Biochemical Activity	BioGRID	8538749
伊尔克AP	DKFZp434J2031 \| FLJ10181 \| MGC4846 \| PP2C-DELTA	整合素连接激酶相关的丝氨酸/苏氨酸磷酸酶2C	-	HPRD，Biogrid	11331582
ITGA5	CD49e \| FNRA \| VLA5A	整合素，α5（纤连蛋白受体，α多肽）	Affinity Capture-Western	BioGRID	8538749
ITGB1	CD29 \| FNRB \| GPIIA \| MDF2 \| MSK12 \| VLA-BETA \| VLAB	整合素，β1（纤连蛋白受体，β多肽，抗原CD29包括MDF2，MSK12）	Integrin-beta-1 interacts with ILK.	BIND	8538749
ITGB1	CD29 \| FNRB \| GPIIA \| MDF2 \| MSK12 \| VLA-BETA \| VLAB	整合素，β1（纤连蛋白受体，β多肽，抗原CD29包括MDF2，MSK12）	-	HPRD，Biogrid	8538749\|9736715
ITGB2	CD18 \| LAD \| LCAMB \| LFA-1 \| MAC-1 \| MF17 \| MFI7	integrin, beta 2 (complement component 3 receptor 3 and 4 subunit)	-	HPRD	9736715
ITGB3	CD61 \|gp3a \|GPIIIA	integrin, beta 3 (platelet glycoprotein IIIa, antigen CD61)	-	HPRD，Biogrid	12372433
ITGB3	CD61 \|gp3a \|GPIIIA	integrin, beta 3 (platelet glycoprotein IIIa, antigen CD61)	Integrin-beta-3 interacts with ILK.	BIND	12372433
LIMS1	捏\|Pinch1	LIM和衰老细胞抗原样结构域1	PINCH interacts with ILK.	BIND	15565145
LIMS1	捏\|Pinch1	LIM和衰老细胞抗原样结构域1	-	HPRD，Biogrid	10022929
LIMS2	FLJ10044 \|捏-2	LIM和衰老细胞抗原样结构域2	-	HPRD，Biogrid	12167643
火星	FLJ35667 \| METRS \| MTRNS	甲二烯基-TRNA合成酶	亲和力捕获ms	BioGRID	17353931
MMS19	FLJ34167 \| FLJ95146 \| MET18 \| MGC99604 \| MMS19L \| hMMS19	MMS19 nucleotide excision repair homolog (S. cerevisiae)	亲和力捕获ms	BioGRID	17353931
MYO1D	KIAA0727 \|mor4	肌球蛋白ID	亲和力捕获ms	BioGRID	17353931
NCK2	GRB4 \| NCKbeta	NCK适配器蛋白2	-	HPRD，Biogrid	10022929
NOC2L	DKFZp564C186 \| FLJ35172 \| NIR	nucleolar complex associated 2 homolog (S. cerevisiae)	亲和力捕获ms	BioGRID	17353931
Otud4	DKFZp434I0721 \| DUBA6 \| HIN1 \| HSHIN1 \| KIAA1046	OTU domain containing 4	亲和力捕获ms	BioGRID	17353931
帕尔瓦	FLJ10793 \|FLJ12254 \|MXRA2	帕尔文，阿尔法	两个杂交	BioGRID	16189514
帕尔瓦	FLJ10793 \|FLJ12254 \|MXRA2	帕尔文，阿尔法	-	HPRD	11331308\|15284246
帕尔瓦	FLJ10793 \|FLJ12254 \|MXRA2	帕尔文，阿尔法	-	HPRD	11331308
帕尔瓦	FLJ10793 \|FLJ12254 \|MXRA2	帕尔文，阿尔法	-	HPRD	11694518
PARVB	CGI-56	帕尔文，beta	亲和力捕获ms	BioGRID	17353931
PARVB	CGI-56	帕尔文，beta	-	HPRD	15467740
PARVB	CGI-56	帕尔文，beta	-	HPRD	11402068
PARVB	CGI-56	帕尔文，beta	An unspecified isoform of affixin interacts with ILK.	BIND	12372433
PDK1	-	丙酮酸脱氢酶激酶，同工酶1	-	HPRD，Biogrid	11313365
PRPSAP1	Pap39	phosphoribosyl pyrophosphate synthetase-associated protein 1	亲和力捕获ms	BioGRID	17353931
PUF60	fir \|FLJ31379 \|robpi \|siahbp1	poly-U binding splicing factor 60KDa	亲和力捕获ms	BioGRID	17353931
PXN	FLJ16691	paxillin	-	HPRD，Biogrid	11304546\|11694518
RSU1	FLJ31034 \| RSP-1	Ras suppressor protein 1	亲和力捕获ms	BioGRID	17353931
S100A9	60B8AG \| CAGB \| CFAG \| CGLB \| L1AG \| LIAG \| MAC387 \| MIF \| MRP14 \| NIF \| P14	S100 calcium binding protein A9	亲和力捕获ms	BioGRID	17353931
TMSB4X	FX \| PTMB4 \| TB4X \| TMSB4	thymosin beta 4, X-linked	伊尔克interacts with Thymosin Beta-4.	BIND	15565145
VTNR	-	vitronectin receptor	Affinity Capture-Western	BioGRID	8538749

V.途径注释

Pathway name	Pathway size	＃szgr 2.0基因	Info
KEGG PPAR SIGNALING PATHWAY	69	47	该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG FOCAL ADHESION	201	138	该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG子宫内膜癌	52	45	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA PTEN PATHWAY	18	14	该途径中的所有SZGR 2.0基因
ST INTEGRIN SIGNALING PATHWAY	82	62	该途径中的所有SZGR 2.0基因
SA PTEN途径	17	14	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID AVB3 OPN途径	31	29	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID ILK PATHWAY	45	32	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID AVB3整合素途径	75	53	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome细胞通信	120	77	该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME CELL EXTRACELLULAR MATRIX INTERACTIONS	14	10	该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME CELL JUNCTION ORGANIZATION	78	43	该途径中的所有SZGR 2.0基因
DIAZ CHRONIC MEYLOGENOUS LEUKEMIA UP	1382	904	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hwang前列腺癌标记	28	19	该途径中的所有SZGR 2.0基因
HUMMERICH SKIN CANCER PROGRESSION DN	100	64	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲DN	584	395	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BENPORATH MYC MAX TARGETS	775	494	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PENG GLUCOSE DEPRIVATION DN	169	112	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Verrecchia对TGFB1 C5的反应	21	11	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Verrecchia延迟对TGFB1的响应	39	26	该途径中的所有SZGR 2.0基因
H3K27me3	97	72	该途径中的所有SZGR 2.0基因
TOOKER GEMCITABINE RESISTANCE UP	79	40	该途径中的所有SZGR 2.0基因
HSIAO HOUSEKEEPING GENES	389	245	该途径中的所有SZGR 2.0基因
DANG REGULATED BY MYC DN	253	192	该途径中的所有SZGR 2.0基因
DANG MYC TARGETS DN	31	25	该途径中的所有SZGR 2.0基因
DANG BOUND BY MYC	1103	714	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sasson对促性腺营养蛋白DN的反应	87	66	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sasson对Forskolin DN的反应	88	68	该途径中的所有SZGR 2.0基因
金所有障碍OLIGODENDROCYTE NUMBER CORR UP	756	494	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Verhaak胶质母细胞瘤经典	162	122	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wierenga Stat5a靶向DN	213	127	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PASINI SUZ12 TARGETS DN	315	215	该途径中的所有SZGR 2.0基因
FORTSCHEGGER PHF8 TARGETS DN	784	464	该途径中的所有SZGR 2.0基因

Section VI. microRNA annotation

miRNA family	目标位置			mirna id	miRNA seq
miRNA family	UTR start	UTR end	Match method	mirna id	miRNA seq
mir-31	190	196	1A	HSA-MIR-31	AGGCAAGAUGCUGGCAUAGCUG
mir-542-3p	233	240	1A,m8	HSA-MIR-542-3P	ugugacauugauaacugaaa

SZ: miRNAs which differentially expressed in brain cortex of schizophrenia patients comparing with control samples using microarray. Click这里查看与SZ相关的miRNA列表。
Brain: miRNAs which are expressed in brain based on miRNA microarray expression studies. Click这里to see the list of brain related miRNAs.

基因页：伊尔克