概括
基因 3613
象征 Impa2
同义词 -
描述 肌醇(myo)-1(或4) - 二磷酸酶2
参考 MIM:605922|HGNC:HGNC:6051|ENSEMBL:ENSG00000141401|HPRD:09329|Vega:Otthumg00000131693
基因类型 蛋白质编码
地图位置 18p11.2
Pascal P值 0.365
Sherlock P值 0.356
胎儿β 0.409
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
简历:Phewas 全球整个关联研究(PHEWAS) 157个与精神分裂症相关的SNP 1
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
协会 组合的优势比方法(Sun等。2008),协会研究 1 链接到Szgene
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@简历:Phewas

SNP ID 染色体 位置 等位基因 p 功能 基因 向上/向下距离
RS7506045 18 11987272 无效的 2.268 Impa2 无效的

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS16999761 CHR4 107454800 Impa2 3613 0.18 反式
RS6648110 Chrx 75871494 Impa2 3613 0.05 反式
RS6648142 Chrx 75928565 Impa2 3613 0.1 反式
RS192069 Chrx 76053555 Impa2 3613 0.17 反式
RS5982340 Chrx 76230686 Impa2 3613 0.1 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
CYP51A1 0.84 0.85
DHCR7 0.83 0.81
FDFT1 0.83 0.82
DPYSL2 0.83 0.86
trpc4ap 0.82 0.83
PPP1R8 0.81 0.80
SEC31A 0.81 0.82
lonrf1 0.81 0.83
RNF145 0.81 0.81
Stard7 0.81 0.82
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
MT-CO2 -0.68 -0.72
AF347015.21 -0.66 -0.76
AF347015.31 -0.65 -0.70
AF347015.8 -0.64 -0.70
ifi27 -0.64 -0.69
FXYD1 -0.64 -0.69
AF347015.33 -0.64 -0.67
mt-cyb -0.63 -0.68
AF347015.27 -0.62 -0.67
AC098691.2 -0.62 -0.73

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0000287 镁离子结合 IEA -
去:0004437 肌醇或磷脂酰肌醇磷酸酶活性 IEA -
GO:0016787 水解酶活性 IEA -
去:0008934 肌醇-1(或4) - 二磷酸酶活性 塔斯 9322233
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0007165 信号转导 塔斯 9322233
去:0006796 磷酸盐代谢过程 塔斯 9322233

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KEGG肌醇磷酸代谢 54 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG磷脂酰肌醇信号传导系统 76 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
渡边直肠癌放疗反应能力 108 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sengupta鼻咽癌DN 349 157 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Corre多发性骨髓瘤DN 62 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
刘cmyb靶向 165 106 该途径中的所有SZGR 2.0基因
刘vmyb的目标 127 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Jaeger转移DN 258 141 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC1靶向DN 260 143 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC1和HDAC2靶向DN 232 139 该途径中的所有SZGR 2.0基因
tien肠益生菌24小时 557 331 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 1278 748 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wamunyokoli卵巢癌LMP 265 158 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌 1821年 933 该途径中的所有SZGR 2.0基因
hahtola sezary综合征 98 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV响应表皮DN 508 354 该途径中的所有SZGR 2.0基因
林格伦膀胱癌群集3 329 196 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rashi对电离辐射3的响应3 48 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten Nipp1靶向DN 848 527 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten EZH2靶向DN 1024 594 该途径中的所有SZGR 2.0基因
里克曼肿瘤分化了井与中度DN 110 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Koyama Sema3b靶向DN 411 249 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath MYC带Ebox的目标 230 156 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Iizuka肝癌进展G1 G2 DN 25 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
戈德拉斯体内平衡增殖 171 102 该途径中的所有SZGR 2.0基因
史密斯肝癌 45 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
费尔南德斯(Fernandez)由迈克(Myc)约束 182 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans 882 572 该途径中的所有SZGR 2.0基因
弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok dn 546 351 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sansom APC目标 126 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Li Wilms肿瘤与胎儿肾脏1 182 119 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Cromer转移DN 81 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血早期祖先 532 309 该途径中的所有SZGR 2.0基因
糖尿病性肾病 86 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kaab心脏中心与心室DN 261 183 该途径中的所有SZGR 2.0基因
葡萄病毒感染DN的Debiasi凋亡DN 287 208 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lein Pons标记 89 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
斯坦因·埃斯拉(Stein Esrra)瞄准 388 234 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mitsiades对aplidin DN的反应 249 165 该途径中的所有SZGR 2.0基因
大脑中的Smid乳腺癌复发 39 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
骨骼DN中的Smid乳腺癌复发 315 197 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SMID乳腺癌腔B DN 564 326 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌基础 648 398 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ruiz TNC目标 153 107 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对CSF2RB和IL4 DN的响应 315 201 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对HGF DN的响应 235 144 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对HGF与CSF2RB和IL4的反应 408 276 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Vantveer乳腺癌ESR1 DN 240 153 该途径中的所有SZGR 2.0基因
清肝癌亚类未注释的DN 193 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stein Esrra目标 535 325 该途径中的所有SZGR 2.0基因
dang myc的目标 143 100 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由MYC约束 1103 714 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chicas RB1目标增长 243 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dutertre雌二醇反应24小时 324 193 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
棕熊UVC响应迟到 1137 655 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 ETS融合的Miyagawa目标 259 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
pasini suz12靶向 112 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FEVR CTNNB1靶向DN 553 343 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gobert少突胶质细胞分化 570 339 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gobert少突胶质细胞分化DN 1080 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Servitja肝HNF1A靶向 135 96 该途径中的所有SZGR 2.0基因