基因页：inpp4a
概括？
| 基因 | 3631 |
| 象征 | inpp4a |
| 同义词 | inpp4 | tvas1 |
| 描述 | I型肌醇聚磷酸-4-磷酸酶A型A型 |
| 参考 | MIM：600916|HGNC：HGNC：6074|ENSEMBL：ENSG00000040933|HPRD：02949|Vega：Otthumg00000153106 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 2q11.2 |
| Pascal P值 | 0.034 |
| 胎儿β | -0.656 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 小脑半球 |
| 支持 | 细胞内信号转导 g2cdb.humanpsd G2CDB.HUMANPSP COMPOSITESET Darnell FMRP目标 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| CV：GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 1 |
| GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR：0.0004 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
DNM表
DNM表| 基因 | 染色体 | 位置 | 参考 | alt | 成绩单 | AA更改 | 突变类型 | 筛 | CG46 | 特征 | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| inpp4a | CHR2 | 99163059 | C | t | NM_001134224 NM_001134225 NM_001566 NM_004027 |
。 。 。 。 |
沉默的 沉默的 沉默的 沉默的 |
精神分裂症 | DNM：Fromer_2014 |
差异甲基化基因
| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG04135372 | 2 | 99061383 | inpp4a | 4.73E-5 | -0.253 | 0.021 | DMG：Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23岁）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| C9orf125 | 0.80 | 0.81 |
| KCTD2 | 0.74 | 0.77 |
| DNAJC6 | 0.74 | 0.80 |
| TNFRSF21 | 0.74 | 0.80 |
| TBC1D9 | 0.73 | 0.74 |
| CLCN6 | 0.73 | 0.78 |
| CD83 | 0.73 | 0.71 |
| mpp2 | 0.72 | 0.77 |
| SLC9A6 | 0.72 | 0.75 |
| snap91 | 0.72 | 0.78 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.21 | -0.54 | -0.56 |
| AF347015.31 | -0.50 | -0.51 |
| C1orf61 | -0.50 | -0.64 |
| MT-CO2 | -0.50 | -0.52 |
| C1orf54 | -0.50 | -0.59 |
| ACSF2 | -0.50 | -0.57 |
| GNG11 | -0.50 | -0.57 |
| SAT1 | -0.49 | -0.57 |
| AF347015.8 | -0.48 | -0.49 |
| AP002478.3 | -0.48 | -0.53 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| GO：0016787 | 水解酶活性 | IEA | - | |
| GO：0016316 | 磷脂酰肌醇-3,4-双磷酸4-磷酸酶活性 | IEA | - | |
| GO：0034597 | 磷脂酰肌醇-4,5-双磷酸4-磷酸酶活性 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0007165 | 信号转导 | 塔斯 | 7608176 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| KEGG肌醇磷酸代谢 | 54 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KEGG磷脂酰肌醇信号传导系统 | 76 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sengupta鼻咽癌 | 294 | 178 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 多德鼻咽癌DN | 1375 | 806 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| hahtola兄弟姐妹fungoides CD4 DN | 116 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Perez TP53目标 | 1174 | 695 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pujana ATM PCC网络 | 1442 | 892 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath Nanog目标 | 988 | 594 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath EED目标 | 1062 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Shepard BMYB Morpholino DN | 200 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| lu衰老的脑dn | 153 | 120 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CUI TCF21目标2 DN | 830 | 547 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Ehrlich ICF综合症DN | 15 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Creighton内分泌疗法抗性5 | 482 | 296 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Firestein增殖 | 175 | 125 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lee区分T淋巴细胞 | 200 | 115 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-205 | 81 | 87 | 1a | HSA-MIR-205 | uccuucauucccggagucug |