基因页面:EIF3E
总结吗?
| GeneID | 3646年 |
| 象征 | EIF3E |
| 同义词 | EIF3-P48 | EIF3S6 | INT6 | eIF3-p46 |
| 描述 | 真核翻译起始因子3单元E |
| 参考 | MIM: 602210|HGNC: HGNC: 3277|运用:ENSG00000104408|HPRD: 03734|织女:OTTHUMG00000164858 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 8 q22-q23 |
| 帕斯卡假定值 | 0.003 |
| 夏洛克假定值 | 0.105 |
| 胎儿β | 2.122 |
| DMG | 1(#研究) |
| eGene | 迈尔斯的顺式和反式 元 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| DMG: Jaffe_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括2104探针/论文认定与深圳病人(n = 108)比136年控制在Bonferroni-adjusted P < 0.05。 | 2 |
| 网络 | 最短路径距离核心基因在人类蛋白质相互作用网络 | 贡献在PPI网络最短路径:0.0018 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
不同甲基化基因| 探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| cg07168148 | 8 | 109260989 | EIF3E | 1.97 e-9 | -0.014 | 1.63 e-6 | DMG: Jaffe_2016 |
| cg18044723 | 8 | 109261011 | EIF3E | 3.27 e-8 | -0.011 | 9.82 e-6 | DMG: Jaffe_2016 |
eQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs7911247 | chr10 | 49724799 | EIF3E | 3646年 | 0.11 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
| 前10名中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| COL3A1 | 0.78 | 0.27 |
| 亮度 | 0.78 | 0.69 |
| C7 | 0.76 | 0.83 |
| ITIH2 | 0.76 | 0.71 |
| OGN | 0.75 | 0.83 |
| OSR1 | 0.75 | 0.66 |
| COL1A1 | 0.74 | 0.50 |
| OLFML3 | 0.74 | 0.54 |
| CYP1B1 | 0.74 | 0.81 |
| COL6A3 | 0.73 | 0.80 |
| 十大负面中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AC007216.4 | -0.24 | -0.20 |
| AF347015.21 | -0.24 | 0.05 |
| SNHG12 | -0.24 | -0.47 |
| CHMP4A | -0.23 | -0.33 |
| AC098691.2 | -0.22 | -0.04 |
| AC010300.1 | -0.22 | -0.27 |
| AF347015.18 | -0.22 | -0.03 |
| AC005921.3 | -0.21 | -0.45 |
| MT-CO2 | -0.21 | 0.06 |
| AF347015.26 | -0.21 | 0.09 |
第三部分。基因本体论注释
| 分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0003743 | 翻译起始因子的活动 | 助教 | 9295280 | |
| 去:0005515 | 蛋白结合 | 新闻学会 | 14667819|17220478|17324924 |17353931 |
|
| 生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0006446 | 调节转化起始 | 助教 | 9295280 | |
| 去:0006412 | 翻译 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0005829 | 胞质 | 经验值 | 12588972 | |
| 去:0005852 | 真核翻译起始因子3复杂 | 助教 | 9295280 | |
| 去:0005737 | 细胞质 | 国际能源机构 | - - - - - - |
第四部分,注释蛋白质间交互作用
| 扶少团团员 | 别名B | 官方全名B | 实验 | 源 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| BAT2 | D6S51 | D6S51E | DKFZp686D09175 | G2 | HLA-B相关记录2 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 14667819 |
| 据 | HCNTF | 睫状神经营养因子 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
| COPS6 | CSN6 | MOV34-34KD | COP9本构photomorphogenic同族体亚基6(拟南芥) | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 12220626 |
| COPS7A | MGC110877 | COP9本构photomorphogenic同族体亚基7(拟南芥) | - - - - - - | HPRD | 12220626 |
| COPS7B | FLJ12612 | MGC111077 | COP9本构photomorphogenic同族体亚基7 b(拟南芥) | - - - - - - | HPRD | 12220626 |
| COPS8 | COP9 | CSN8 | MGC1297 | MGC43256 | SGN8 | COP9本构photomorphogenic同族体亚基8(拟南芥) | - - - - - - | HPRD | 12220626 |
| CSN3 | CSN10 | CSNK |王者文化 | 酪蛋白卡巴 | 亲和力Capture-Western 2台混合动力 |
BioGRID | 12220626 |
| DDX24 | - - - - - - | 死(Asp-Glu-Ala-Asp)框多肽24 | 2台混合动力 | BioGRID | 16169070 |
| EIF1B | GC20 | 真核翻译起始因子1 b | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
| EIF3A | EIF3 | EIF3S10 | KIAA0139 | P167 | TIF32 | eIF3-p170 | eIF3-theta | p180 | p185 | 真核翻译起始因子3,亚基 | 亲和力Capture-MS 亲和力Capture-Western Co-purification |
BioGRID | 11590142|14519125 |17353931 |
| EIF3C | EIF3S8 | FLJ78287 | MGC189744 | eIF3-p110 | 真核翻译起始因子3,亚基C | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 10504338 |
| EIF3EIP | EIF3S11 | EIF3S6IP | HSPC021 | HSPC025 | MSTP005 | 真核翻译起始因子3 E亚基相互作用的蛋白质 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 11590142 |
| GPAA1 | GAA1 | hGAA1 | glycosylphosphatidylinositol锚连接蛋白1同族体(酵母) | 2台混合动力 | BioGRID | 16169070 |
| GPBP1L1 | rp11 - 767 n6.1 | SP192 | GC-rich启动子结合蛋白1 1 | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
| HAP1 | HAP2 | HIP5 | HLP | hHLP1 | huntingtin-associated蛋白1 | 2台混合动力 | BioGRID | 16169070 |
| IFIT1 | G10P1 | GARG-16 | IFI-56 | IFI56 | IFNAI1 | ISG56 | RNM561 | 干扰素诱导蛋白与tetratricopeptide重复1 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 10644362 |
| MAGED1 | DLXIN-1 | NRAGE | 黑色素瘤抗原家族D, 1 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
| NSF | SKD2 | N-ethylmaleimide-sensitive因素 | 2台混合动力 | BioGRID | 16169070 |
| RGS2 | G0S8 | 蛋白信号2的监管机构,24 kda | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
| RUNDC3A | RAP2IP | RPIP8 | 运行域包含3 | 2台混合动力 | BioGRID | 16189514 |
| SAP18 | 2 hor0202 | MGC27131 | SAP18p | Sin3A-associated蛋白质,18 kda | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
| TRIM27 | RFP | RNF76 | 三方motif-containing 27 | - - - - - - | HPRD | 10504338 |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| PID HIF2PATHWAY | 34 | 29日 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME翻译 | 222年 | 75年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME形成三元复杂和随后的43个年代复杂 | 74年 | 24 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME激活的MRNA在绑定的帽绑定复杂和43 s型和随后的绑定 | 84年 | 30. | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME代谢的蛋白质 | 518年 | 242年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME 3 UTR介导转化的监管 | 176年 | 51 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 林格伦膀胱癌集群3 DN | 229年 | 142年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 通过小道HAMAI细胞凋亡 | 584年 | 356年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 帕蒂尔肝癌 | 747年 | 453年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652年 | 1023年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| PUJANA ATM PCC网络 | 1442年 | 892年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 洛佩兹MBD的目标 | 957年 | 597年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DER干扰素γ响应DN | 11 | 9 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KUMAR MLL AF9融合的目标 | 405年 | 264年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN WELCSH BRCA1目标 | 141年 | 92年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 金正日LRRC3B目标 | 30. | 24 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 马丁内斯RB1 DN的目标 | 543年 | 317年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 马丁内斯DN TP53的目标 | 593年 | 372年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 马丁内斯RB1和TP53目标DN | 591年 | 366年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| RIZKI肿瘤侵袭性的3 d DN | 270年 | 181年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 结肠癌年级了 | 871年 | 505年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 年级结肠癌和直肠癌 | 285年 | 167年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 纳特GBM VS AO神经胶质瘤DN | 45 | 22 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 甜蜜的肺癌喀斯特 | 491年 | 316年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 甜蜜的喀斯特致癌签名 | 89年 | 56 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 萧管家基因 | 389年 | 245年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 米利伪足 | 43 | 27 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 米利伪足趋化性了 | 74年 | 45 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 米利伪足趋触性了 | 518年 | 299年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 罗马胰岛素在肌肉的目标 | 442年 | 263年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| JISON镰状细胞病DN | 181年 | 97年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 开罗肝母细胞癌类了 | 605年 | 377年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 么时间响应黄体酮集群9 | 76年 | 45 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 金双相情感障碍少突细胞密度相关系数 | 682年 | 440年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BILANGES血清敏感基因 | 90年 | 54 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 通过TSC1和TSC2 BILANGES雷帕霉素敏感 | 73年 | 37 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN FEVR CTNNB1目标 | 553年 | 343年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |