SZGR2 - Beplay体育中心

Summary？

基因	3654
象征	irak1
同义词	irak \|佩尔
描述	白介素1受体相关激酶1
参考	MIM：300283\|HGNC：HGNC：6112\|ENSEMBL：ENSG00000184216\|HPRD：02235\|Vega：Otthumg0000000024228
基因类型	蛋白质编码
地图位置	XQ28
Sherlock P值	0.276
胎儿β	-0.324
支持	潜在的突触基因

基因in Data Sources

基因集名称	基因组方法	描述	信息
简历：PGCNP	全基因组协会研究	GWAS
PMID：cooccur	高通量文献搜索	PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
表达	基因表达的荟萃分析	p价值：1.59
文学	高通量文献搜索	与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症	点击显示详细信息
网络	Shortest path distance of core genes in the Human protein-protein interaction network	PPI网络中最短路径的贡献：0.2114

Section I. Genetics and epigenetics annotation

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

Footnote:
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因	皮尔逊的相关性	斯皮尔曼的相关性
ACSS1	0.84	0.87
RYR1	0.82	0.87
prodh	0.82	0.81
PBXIP1	0.82	0.88
Scara3	0.81	0.87
LRP10	0.81	0.86
SFXN5	0.80	0.86
LAMB2	0.80	0.83
TPCN1	0.80	0.83
GPR37L1	0.80	0.81

前10个负共表达基因
基因	皮尔逊的相关性	斯皮尔曼的相关性
Med19	-0.59	-0.66
polb	-0.58	-0.67
STMN1	-0.58	-0.64
FRG1	-0.57	-0.65
C11orf57	-0.57	-0.68
ASNSD1	-0.56	-0.62
MRPL44	-0.56	-0.66
BTF3L4	-0.56	-0.62
ube2d2	-0.56	-0.59
COQ3	-0.56	-0.62

第三节。基因本体论注释

分子功能	去学期	证据	神经关键字	PubMed ID
去：0000166	核苷酸结合	IEA		-
去：0000287	镁离子结合	IEA		-
去：0004872	受体活性	IEA		-
去：0004704	NF-kappab诱导激酶活性	塔斯		8599092
去：0005149	白介素-1受体结合	IEA		-
去：0005515	蛋白质结合	IEA		-
去：0005524	ATP结合	IEA		-
去：0004674	protein serine/threonine kinase activity	IEA		-
去：0004674	protein serine/threonine kinase activity	nas		11397809
GO：0016740	转移酶活性	IEA		-
GO：0016563	转录激活剂活性	nas		11397809
GO：0042803	蛋白质同构化活性	nas		11397809
GO：0019901	蛋白激酶结合	ISS		-
生物过程	去学期	证据	神经关键字	PubMed ID
去：0007178	跨膜受体蛋白丝氨酸/苏氨酸激酶信号传导途径	nas		11397809
去：0006468	蛋白氨基酸磷酸化	IEA		-
去：0007250	NF-kappab诱导激酶活性的激活	艾达		11397809
去：0007165	信号转导	IEA		-
去：0007165	信号转导	nas		10854325
GO：0032496	对脂多糖的反应	IEA		-
GO：0051259	蛋白质寡聚	小鬼		16831874
GO：0019221	细胞因子介导的信号通路	IEA		-
GO：0031663	脂多糖介导的信号通路	IEA		-
GO：0045941	转录的正调节	nas		11397809
GO：0046777	蛋白氨基酸自磷酸化	nas		11397809
细胞分量	去学期	证据	神经关键字	PubMed ID
去：0005829	细胞质	经验		10465784\|12138165\|14625308 \|16024789
GO：0045323	白介素-1受体复合物	nas		10854325

Section IV. Protein-protein interaction annotation

互动者	别名b	官方全名b	实验	Source	PubMed ID
AKT1	akt \|MGC99656 \|PKB \|pkb-alpha \|Prkba \|RAC \|Rac-Alpha	V-Akt鼠胸腺瘤病毒癌基因同源1	-	HPRD，Biogrid	11976320
楚克	ikbka \|ikk-alpha \|ikk1 \|ikka \|nfkbika \|TCF16	保守的螺旋环螺旋无处不在激酶	亲和力捕获 - 韦斯特恩	Biogrid	11096118
fadd	Gig3 \|MGC8528 \|Mort1	Fas (TNFRSF6)-associated via death domain	-	HPRD，Biogrid	11828002
hras	c-bas/has \|C-H-Ras \|C-HA-RAS1 \|ctlo \|H-Rasidx \|hamsv \|HRAS1 \|k-ras \|n-ras \|Rash1	V-HA-RAS HARVEY RAT SARMA病毒性癌基因同源物	-	HPRD	11744690
ikbkb	FLJ40509 \| IKK-beta \| IKK2 \| IKKB \| MGC131801 \| NFKBIKB	B细胞，激酶β的Kappa光多肽基因增强子的抑制剂	亲和力捕获 - 韦斯特恩	Biogrid	11096118
IL1RAP	C3orf13 \|FLJ37788 \|IL-1RACP \|IL1R3	白介素1受体配件蛋白	-	HPRD，Biogrid	9371760
irak1	irak \|佩尔	白介素-1受体相关激酶1	Irak与自身相互作用，并自动磷酸化。	绑定	10383454
irak1bp1	AIP70 \|MGC138458 \|MGC138460 \|简单	白介素-1受体相关激酶1结合蛋白1	-	HPRD，Biogrid	11096118
irak2	irak-2 \|MGC150550	白介素-1受体相关激酶2	IRAK与IRAK-2相互作用并形成异质复合物。	绑定	10383454
irak3	ASRT5 \|irak-m \|irakm	白介素-1受体相关激酶3	Irak与Irak-M相互作用并形成异质复合物。	绑定	10383454
irak4	IPD1 \|NY-REN-64 \|Ren64	白介素-1受体相关激酶4	-	HPRD，Biogrid	11960013
itgam	CD11b \|CR3A \|Mac-1 \|Mac1a \|MGC117044 \|mo1a \|SLEB6	整合素，αM（补体组件3受体3亚基）	-	HPRD，Biogrid	11701612
MAP3K7IP2	FLJ21885 \|KIAA0733 \|TAB2	有丝分裂原激活的蛋白激酶激酶激酶7相互作用蛋白2	-	HPRD	11518704
myd88	myd88d	髓样分化主要反应基因（88）	IRAK不与MyD88相互作用，而激酶无活性突变体IRAK [LYS239SER]确实相互作用。	绑定	10383454
myd88	myd88d	髓样分化主要反应基因（88）	-	HPRD	10854325
myd88	myd88d	髓样分化主要反应基因（88）	亲和力捕获 - 韦斯特恩	Biogrid	10383454\|11976320
ntrk3	trkc \|GP145（TRKC）	神经营养性酪氨酸激酶，受体，3型	-	HPRD	12034707
PELI2	-	佩里诺同源2（果蝇）	-	HPRD	12370331
PELI2	-	佩里诺同源2（果蝇）	IRAK1与PELI2相互作用并磷酸化。	绑定	12860405
PELI3	MGC35521	佩里诺同源物3（果蝇）	-	HPRD	12874243
Prkcz	PKC-Zeta \|PKC2	蛋白激酶C，Zeta	-	HPRD，Biogrid	11937546
sigirr	MGC110992 \|tir8	单个免疫球蛋白和收费夹管1受体（TIR）结构域	-	HPRD，Biogrid	12925853
SQSTM1	A170 \| OSIL \| PDB3 \| zip2 \| p60 \| p62 \| p62B	隔离1	-	HPRD	12034707
SQSTM1	A170 \| OSIL \| PDB3 \| zip2 \| p60 \| p62 \| p62B	隔离1	亲和力捕获 - 韦斯特恩	Biogrid	10747026
TICAM2	MGC129876 \|MGC129877 \|TICAM-2 \|tirap3 \|tirp \|电车	Toll样受体适配器分子2	-	HPRD	12721283
tifa	MGC20791 \|T2BP \|T6BP \|Tifaa	与叉头相关结构域的TRAF相互作用蛋白	-	HPRD，Biogrid	12566447
TLR2	CD282 \|til4	toll-like receptor 2	-	HPRD，Biogrid	10395652
Tollip	FLJ33531 \|IL-1RACPIP	Toll相互作用蛋白质	-	HPRD，Biogrid	10854325
traf6	MGC：3310 \|RNF85	TNF受体相关因子6	TRAF6与IRAK1相互作用。这种相互作用均以来自未指定物种的traf6和irak1之间的相互作用进行建模。	绑定	15894263
traf6	MGC：3310 \|RNF85	TNF受体相关因子6	-	HPRD，Biogrid	8837778

Section V. Pathway annotation

路径名	路径大小	＃szgr 2.0基因	信息
kegg凋亡	88	62	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Kegg Toll像受体信号通路	102	88	All SZGR 2.0 genes in this pathway
KEGG神经营养蛋白信号传导途径	126	103	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Kegg Leishmania感染	72	56	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Biocarta GSK3途径	27	26	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Biocarta NFKB途径	23	19	All SZGR 2.0 genes in this pathway
BIOCARTA IL1R PATHWAY	33	29	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Biocarta收费途径	37	31	All SZGR 2.0 genes in this pathway
PID IL1途径	34	28	All SZGR 2.0 genes in this pathway
PID P75 NTR途径	69	51	All SZGR 2.0 genes in this pathway
PID TOLL ENDOGENOUS PATHWAY	25	19	All SZGR 2.0 genes in this pathway
NGF的Reactome信号传导	217	167	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome Trif介导的TLR3信号传导	74	54	All SZGR 2.0 genes in this pathway
REACTOME P75NTR RECRUITS SIGNALLING COMPLEXES	12	8	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome P75NTR信号通过NFKB	14	10	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome NFKB被激活并信号存活	11	8	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome P75 NTR受体介导的信号传导	81	61	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome Tak1通过磷酸化和激活IKKS复合物激活NFKB	23	17	All SZGR 2.0 genes in this pathway
TLR级联反应组MAP激酶激活	50	37	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome JNK C Jun激酶磷酸化和激活人Tak1介导的激活	16	9	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome激活的TAK1介导P38 MAPK激活	18	12	All SZGR 2.0 genes in this pathway
ILS的Reactome信号传导	107	86	All SZGR 2.0 genes in this pathway
REACTOME IL1 SIGNALING	39	30	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome Irak1招募IKK综合体	10	8	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome Traf6在TLR7 8或9激活上介导的NFKB和MAP激酶的诱导	77	57	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome Traf6介导的IRF7激活TLR7 8或9信号传导	10	9	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome NFKB和MAP激酶激活由TLR4信号传导介导	72	53	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome myd88 mal级联反应于质膜发起	83	63	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome先天免疫系统	279	178	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome激活的TLR4信号传导	93	69	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome免疫系统	933	616	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome收费受体级联	118	84	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome Nod1 2信号通路	30	22	All SZGR 2.0 genes in this pathway
REACTOME CYTOKINE SIGNALING IN IMMUNE SYSTEM	270	204	All SZGR 2.0 genes in this pathway
反应组核苷酸结合结构域富含受体NLR信号通路富含亮氨酸重复途径	46	33	All SZGR 2.0 genes in this pathway
中村肿瘤区周围与中央	285	181	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Onken Uveal黑色素瘤	783	507	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Basaki YBX1靶向	290	177	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mullighan mll签名1	380	236	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mullighan MLL签名2 UP	418	263	All SZGR 2.0 genes in this pathway
甲状腺癌的甲状腺癌间变性	722	443	All SZGR 2.0 genes in this pathway
kokkinakis甲硫氨酸剥夺48小时DN	64	39	All SZGR 2.0 genes in this pathway
kokkinakis甲硫氨酸剥夺96小时DN	75	50	All SZGR 2.0 genes in this pathway
McBryan Pubertal乳房4 5WK	271	175	All SZGR 2.0 genes in this pathway
McBryan Pubertal乳房6 7WK DN	79	54	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Darwiche皮肤肿瘤启动子	142	96	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Darwiche Papilloma风险低DN	165	107	All SZGR 2.0 genes in this pathway
DARWICHE PAPILLOMA RISK HIGH DN	180	110	All SZGR 2.0 genes in this pathway
DARWICHE SQUAMOUS CELL CARCINOMA DN	181	107	All SZGR 2.0 genes in this pathway
BCR ABL1融合的klein目标	45	34	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Schlosser MYC靶标和血清反应DN	47	34	All SZGR 2.0 genes in this pathway
patil肝癌	747	453	All SZGR 2.0 genes in this pathway
PUJANA BRCA1 PCC网络	1652	1023	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Pujana ATM PCC网络	1442	892	All SZGR 2.0 genes in this pathway
PUJANA CHEK2 PCC网络	779	480	All SZGR 2.0 genes in this pathway
洛佩兹MBD目标	957	597	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Lopez MBD目标印有X和X链接	17	8	All SZGR 2.0 genes in this pathway
带有E盒的WEI MYCN目标	795	478	All SZGR 2.0 genes in this pathway
狮子转移	539	324	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mir192和Mir215的Georges目标	893	528	All SZGR 2.0 genes in this pathway
戈德拉斯体内平衡增殖	171	102	All SZGR 2.0 genes in this pathway
MLL CBP融合DN的王目标	45	31	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Zhan V2晚分化基因	45	34	All SZGR 2.0 genes in this pathway
牙肺纹状横纹肌肉瘤DN	408	274	All SZGR 2.0 genes in this pathway
PAL PRMT5靶向	203	135	All SZGR 2.0 genes in this pathway
阿尔茨海默氏症疾病	1691	1088	All SZGR 2.0 genes in this pathway
罗德韦尔老化的肾脏	487	303	All SZGR 2.0 genes in this pathway
伊万诺娃造血细胞和祖细胞	681	420	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Kaab失败心室DN	41	28	All SZGR 2.0 genes in this pathway
LEE CALORIE RESTRICTION MUSCLE DN	51	28	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Heller HDAC靶向DN	292	189	All SZGR 2.0 genes in this pathway
HELLER HDAC TARGETS SILENCED BY METHYLATION DN	281	179	All SZGR 2.0 genes in this pathway
阿塞维多肝癌	973	570	All SZGR 2.0 genes in this pathway
阿塞维多肝肿瘤与正常的相邻组织向上	863	514	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Chung水泡细胞毒性	134	84	All SZGR 2.0 genes in this pathway
级结肠癌	871	505	All SZGR 2.0 genes in this pathway
等级结肠和直肠癌	285	167	All SZGR 2.0 genes in this pathway
王肿瘤的侵入性DN	210	128	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Hsiao家政基因	389	245	All SZGR 2.0 genes in this pathway
fontaine乳头状甲状腺癌DN	80	53	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Fournier腺泡开发2	277	172	All SZGR 2.0 genes in this pathway
YAO对孕酮簇的时间反应14	143	86	All SZGR 2.0 genes in this pathway
dasu IL6信号向上	59	44	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up	756	494	All SZGR 2.0 genes in this pathway
金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关	682	440	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Bruins通过TP53组A的UVC响应	898	516	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Krieg缺氧不是通过KDM3A	770	480	All SZGR 2.0 genes in this pathway

第六节。microRNA注释

mirna家族	目标位置			mirna id	mirna seq
mirna家族	UTR开始	UTR结束	匹配方法	mirna id	mirna seq
miR-134	1274	1280	1a	HSA-MIR-134^脑	ugugacuggugaccagaggg
mir-142-3p	1278	1285	1A，M8	HSA-MIR-142-3P	uguaguuuccuacuuuaugga
mir-146	56	63	1A，M8	HSA-MIR-146A	ugagaacugaauuccaugggug
				HSA-MIR-146B^脑	ugagaacugaauuccauaggcu
				HSA-MIR-146A	ugagaacugaauuccaugggug
				HSA-MIR-146B^脑	ugagaacugaauuccauaggcu

SZ：在精神分裂症患者的脑皮质中差异表达的miRNA与使用微阵列进行对照样品进行比较。点击here查看与SZ相关的miRNA列表。
大脑：基于miRNA微阵列表达研究在大脑中表达的miRNA。点击here查看与大脑相关的miRNA列表。

基因页：irak1