基因页：IRF2
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| 基因ID | 3660 |
| 象征 | IRF2 |
| 同义词 | IRF-2 |
| 描述 | 干扰素调节因子2 |
| 参考 | MIM：147576|HGNC：HGNC：6117|ENSEMBL：ENSG00000168310|HPRD：00962|Vega：Otthumg00000160606 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 4Q35.1 |
| Pascal P值 | 0.027 |
| 胎儿β | -1.218 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
基因in Data Sources
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG07954844 | 4 | 185396180 | IRF2 | 6.83e-8 | -0.006 | 1.67E-5 | DMG：JAFFE_2016 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS4388012 | CHR3 | 45996500 | IRF2 | 3660 | 0.16 | 反式 | ||
| RS13078739 | CHR3 | 46007487 | IRF2 | 3660 | 0.16 | 反式 | ||
| RS3851346 | CHR3 | 46053580 | IRF2 | 3660 | 0.16 | 反式 | ||
| rs7372527 | 0 | IRF2 | 3660 | 0.18 | 反式 | |||
| RS17215981 | CHR3 | 46124417 | IRF2 | 3660 | 0.12 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
Footnote:
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| IL6st | 0.87 | 0.87 |
| LIFR | 0.86 | 0.89 |
| Qki | 0.86 | 0.89 |
| arhgap5 | 0.84 | 0.83 |
| gpm6b | 0.84 | 0.82 |
| PTAR1 | 0.84 | 0.86 |
| KIAA0494 | 0.83 | 0.84 |
| NTRK2 | 0.82 | 0.82 |
| tor1aip1 | 0.81 | 0.88 |
| RASSF8 | 0.81 | 0.82 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| SNHG12 | -0.41 | -0.53 |
| RP9P | -0.41 | -0.55 |
| ST20 | -0.40 | -0.50 |
| 纳米3 | -0.38 | -0.44 |
| HES4 | -0.37 | -0.43 |
| AL022328.1 | -0.36 | -0.44 |
| MRPL52 | -0.36 | -0.40 |
| Stra13 | -0.36 | -0.41 |
| C9orf142 | -0.35 | -0.36 |
| ard1a | -0.35 | -0.38 |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
| 互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| BRD7 | BP75 |Celtix1 |Nag4 | 含有7的溴结构域 | 重构的复合物 Two-hybrid |
Biogrid | 11025449 |
| CSNK2A1 | CK2A1 |CKII | 酪蛋白激酶2，α1多肽 | - | HPRD，Biogrid | 9213219 |
| EP300 | kat3b |P300 | E1a结合蛋白p300 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 生化活动 重构的复合物 |
Biogrid | 11304541 |
| IRF2BP1 | DKFZP434M154 | 干扰素调节因子2结合蛋白1 | - | HPRD | 12799427 |
| IRF2BP2 | MGC72189 | 干扰素调节因子2结合蛋白2 | - | HPRD | 12799427 |
| IRF8 | H-ISSBP |ICSBP |ICSBP1 |IRF-8 | interferon regulatory factor 8 | - | HPRD，Biogrid | 7768900 |
| kat2a | GCN5 |GCN5L2 |MGC102791 |PCAF-B |HGCN5 | K（赖氨酸）乙酰转移酶2A | 重构的复合物 | Biogrid | 10022868 |
| kat2b | CAF |P |P/CAF |PCAF | K（赖氨酸）乙酰转移酶2B | - | HPRD，Biogrid | 10022868|11304541 |
| NFKB1 | DKFZP686C01211 |EBP-1 |kbf1 |MGC54151 |nf-kappa-b |NFKB-P105 |NFKB-P50 |P105 | B细胞中Kappa光多肽基因增强子的核因子1 | - | HPRD，Biogrid | 8550813 |
| Prkaca | MGC102831 |MGC48865 |pkaca | 蛋白激酶，cAMP依赖性，催化，α | 生化活动 | Biogrid | 9213219 |
| Rela | MGC131774 |NFKB3 |P65 | V-REL网状内皮症病毒性癌基因同源物A（Avian） | - | HPRD，Biogrid | 8550813 |