基因页:IRF5
概括?
基因 | 3663 |
象征 | IRF5 |
同义词 | SLEB10 |
描述 | 干扰素调节因子5 |
参考 | MIM:607218|HGNC:HGNC:6120|ENSEMBL:ENSG00000128604|HPRD:06240|Vega:Otthumg00000158410 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 7q32 |
Pascal P值 | 0.005 |
胎儿β | -0.697 |
主持人 | 元 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/IRF5_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
sfrs2ip | 0.85 | 0.80 |
9月10日 | 0.85 | 0.76 |
Smad5 | 0.83 | 0.76 |
MSN | 0.83 | 0.74 |
RDX | 0.82 | 0.71 |
9月2日 | 0.82 | 0.78 |
IQGAP1 | 0.81 | 0.80 |
dpy19l4 | 0.81 | 0.76 |
ZNF664 | 0.81 | 0.79 |
TMX1 | 0.80 | 0.68 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
cldnd2 | -0.41 | -0.43 |
TTC9B | -0.38 | -0.41 |
ZFAND2A | -0.38 | -0.39 |
AL022328.1 | -0.37 | -0.34 |
AC044839.2 | -0.37 | -0.32 |
AC138534.1 | -0.36 | -0.38 |
C6orf1 | -0.36 | -0.34 |
C16orf14 | -0.36 | -0.39 |
A1bg | -0.36 | -0.42 |
PSMB10 | -0.35 | -0.34 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Kegg Toll像受体信号通路 | 102 | 88 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID P53下游途径 | 137 | 94 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome干扰素伽马信号传导 | 63 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome干扰素αβ信号传导 | 64 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome干扰素信号传导 | 159 | 116 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome免疫系统 | 933 | 616 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
免疫系统中的反应组细胞因子信号传导 | 270 | 204 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ENK UV响应角质形成细胞 | 530 | 342 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Markey RB1慢性LOF DN | 118 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Perez TP53目标 | 1174 | 695 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
dacosta ercc3等位基因XPCS vs TTD DN | 36 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
dirmeier LMP1响应迟到 | 57 | 41 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pujana ATM PCC网络 | 1442 | 892 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nuytten EZH2靶向DN | 1024 | 594 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
弗里德曼衰老 | 77 | 60 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
弗里德曼永生dn | 34 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Basso CD40信号向上 | 101 | 76 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
张抗病毒对利巴韦林DN的反应 | 51 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gavin Foxp3目标集群P3 | 160 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rizki肿瘤侵入性3D | 210 | 124 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
西肾上腺皮质肿瘤DN | 546 | 362 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Vantveer乳腺癌BRCA1 UP | 36 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
陈代谢综合征网络 | 1210 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 1069 | 729 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
具有H3K4ME2和H3K27ME3的Meissner NPC HCP | 349 | 234 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen MCV6 HCP带有H3K27ME3 | 435 | 318 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen NPC HCP带有H3K27ME3 | 341 | 243 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pilon KLF1靶向DN | 1972年 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |