概括
基因 3663
象征 IRF5
同义词 SLEB10
描述 干扰素调节因子5
参考 MIM:607218|HGNC:HGNC:6120|ENSEMBL:ENSG00000128604|HPRD:06240|Vega:Otthumg00000158410
基因类型 蛋白质编码
地图位置 7q32
Pascal P值 0.005
胎儿β -0.697
主持人

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
sfrs2ip 0.85 0.80
9月10日 0.85 0.76
Smad5 0.83 0.76
MSN 0.83 0.74
RDX 0.82 0.71
9月2日 0.82 0.78
IQGAP1 0.81 0.80
dpy19l4 0.81 0.76
ZNF664 0.81 0.79
TMX1 0.80 0.68
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
cldnd2 -0.41 -0.43
TTC9B -0.38 -0.41
ZFAND2A -0.38 -0.39
AL022328.1 -0.37 -0.34
AC044839.2 -0.37 -0.32
AC138534.1 -0.36 -0.38
C6orf1 -0.36 -0.34
C16orf14 -0.36 -0.39
A1bg -0.36 -0.42
PSMB10 -0.35 -0.34

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Kegg Toll像受体信号通路 102 88 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID P53下游途径 137 94 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome干扰素伽马信号传导 63 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome干扰素αβ信号传导 64 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome干扰素信号传导 159 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome免疫系统 933 616 该途径中的所有SZGR 2.0基因
免疫系统中的反应组细胞因子信号传导 270 204 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV响应角质形成细胞 530 342 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Markey RB1慢性LOF DN 118 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Perez TP53目标 1174 695 该途径中的所有SZGR 2.0基因
dacosta ercc3等位基因XPCS vs TTD DN 36 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
dirmeier LMP1响应迟到 57 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC网络 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pujana ATM PCC网络 1442 892 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten EZH2靶向DN 1024 594 该途径中的所有SZGR 2.0基因
弗里德曼衰老 77 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
弗里德曼永生dn 34 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Basso CD40信号向上 101 76 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张抗病毒对利巴韦林DN的反应 51 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gavin Foxp3目标集群P3 160 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rizki肿瘤侵入性3D 210 124 该途径中的所有SZGR 2.0基因
西肾上腺皮质肿瘤DN 546 362 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Vantveer乳腺癌BRCA1 UP 36 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
陈代谢综合征网络 1210 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 1069 729 该途径中的所有SZGR 2.0基因
具有H3K4ME2和H3K27ME3的Meissner NPC HCP 349 234 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MCV6 HCP带有H3K27ME3 435 318 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen NPC HCP带有H3K27ME3 341 243 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因