基因页：itga3
概括？
| 基因 | 3675 |
| 象征 | itga3 |
| 同义词 | CD49C | FRP-2 | GAP-B3 | GAPB3 | ILNEB | MSK18 | VCA-2 | VL3A | VLA3A |
| 描述 | 整合素亚基Alpha 3 |
| 参考 | MIM：605025|HGNC：HGNC：6139|ENSEMBL：ENSG00000005884|HPRD：05431|Vega：Otthumg00000161890 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 17Q21.33 |
| Pascal P值 | 0.581 |
| Sherlock P值 | 0.127 |
| 胎儿β | -0.374 |
| 主持人 | 小脑半球 小脑 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DNM：Gulsuner_2013 | 整个外显子组测序分析 | 155 DNM通过外显子组对精神分裂症个体及其父母的三重奏测序确定。 | |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关关键字的命中：2 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
DNM表
DNM表| 基因 | 染色体 | 位置 | 参考 | alt | 成绩单 | AA更改 | 突变类型 | 筛 | CG46 | 特征 | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| itga3 | CHR17 | 48154453 | C | G | NM_002204 NM_005501 |
p.680p> a p.680p> a |
错过 错过 |
精神分裂症 | DNM：Gulsuner_2013 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS1570589 | Chr9 | 116874354 | itga3 | 3675 | 0.15 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| Athl1 | 0.72 | 0.78 |
| ADAM33 | 0.72 | 0.77 |
| Acadvl | 0.72 | 0.73 |
| myo15b | 0.69 | 0.81 |
| catsper2 | 0.69 | 0.70 |
| dnah1 | 0.69 | 0.77 |
| AL117190.3 | 0.68 | 0.81 |
| DCDC2B | 0.67 | 0.69 |
| CES8 | 0.67 | 0.64 |
| Malat1 | 0.65 | 0.69 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| mobkl3 | -0.47 | -0.56 |
| HSPA13 | -0.45 | -0.49 |
| DNAJA1 | -0.44 | -0.51 |
| mettl9 | -0.44 | -0.50 |
| ARF4 | -0.44 | -0.48 |
| SERP1 | -0.44 | -0.50 |
| ube2n | -0.44 | -0.56 |
| RBMXL1 | -0.44 | -0.45 |
| 马克克斯 | -0.44 | -0.43 |
| IPMK | -0.44 | -0.47 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0004872 | 受体活性 | IEA | - | |
| 去：0005509 | 钙离子结合 | IEA | - | |
| 去：0005515 | 蛋白质结合 | IEA | - | |
| 去：0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 14676841 | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0001764 | 神经元迁移 | IEA | 神经元（GO期限：8） | - |
| 去：0007160 | 细胞 - 矩阵粘附 | 塔斯 | 1655803 | |
| 去：0007155 | 细胞粘附 | IEA | - | |
| 去：0007229 | 整联蛋白介导的信号通路 | IEA | - | |
| 去：0007613 | 记忆 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| GO：0019717 | 突触体 | IEA | 突触，大脑（GO期限：7） | - |
| 去：0016020 | 膜 | IEA | - | |
| GO：0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - | |
| 去：0005886 | 质膜 | IEA | - | |
| 去：0008305 | 整联蛋白复合物 | IEA | - | |
| 去：0008305 | 整联蛋白复合物 | 塔斯 | 1655803 | |
| GO：0016323 | 基底外侧质膜 | IEA | - |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
| 互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| Bin1 | amph2 |amphl |DKFZP547F068 |MGC10367 |SH3P9 | 桥接整合器1 | - | HPRD，Biogrid | 10094488 |
| 卡尔 | CRT |FLJ26680 |ro |SSA |CC1QR | 钙网蛋白 | - | HPRD | 8006073 | 11327697 |
| 卡尔 | CRT |FLJ26680 |ro |SSA |CC1QR | 钙网蛋白 | - | HPRD | 11327697 |
| CD151 | GP27 |MER2 |PETA-3 |raph |sfa1 |TSPAN24 | CD151分子（Raph Blood群） | 重构的复合物 | Biogrid | 10734060 |
| CD82 | 4f9 |C33 |Gr15 |IA4 |kai1 |R2 |SAR2 |ST6 |TSPAN27 | CD82分子 | - | HPRD | 8757325 |
| CD9 | 5H9 |BA2 |BTCC-1 |DARAP-27 |Gig2 |MIC3 |MRP-1 |p24 |TSPAN29 | CD9分子 | - | HPRD，Biogrid | 10065872|10694273 |
| FHL2 | AAG11 |Dral |Slim3 | 四个半域2 | - | HPRD，Biogrid | 10906324 |
| FN1 | CIG |DKFZP686F10164 |DKFZP686H0342 |DKFZP686I1370 |DKFZP686O13149 |ed-b |Finc |fn |fnz |gfnd | GFND2 | LETS | MSF | 纤连蛋白1 | - | HPRD | 9733622 |
| ITGB1 | CD29 |fnrb |GPIIA |MDF2 |MSK12 |vla-beta |vlab | 整合素，β1（纤连蛋白受体，β多肽，抗原CD29包括MDF2，MSK12） | VLA3-Alpha3与VLA3-beta相互作用。 | 绑定 | 1690718|1693624 |3546305 |
| ITGB1 | CD29 |fnrb |GPIIA |MDF2 |MSK12 |vla-beta |vlab | 整合素，β1（纤连蛋白受体，β多肽，抗原CD29包括MDF2，MSK12） | vla3-alpha3与vla3-beta相互作用 | 绑定 | 3546305 |
| ITGB1 | CD29 |fnrb |GPIIA |MDF2 |MSK12 |vla-beta |vlab | 整合素，β1（纤连蛋白受体，β多肽，抗原CD29包括MDF2，MSK12） | - | HPRD，Biogrid | 15254262 |
| 喇嘛3 | BM600 |E170 |lamna |locs |Lama3a | 层粘连蛋白，α3 | - | HPRD | 9950675|11278628 |
| LGALS8 | GAL-8 |PCTA-1 |pcta1 |PO66-CBP | 凝集素，半乳糖苷结合，可溶性，8 | - | HPRD，Biogrid | 10852818 |
| 拉比夫 | MSS4 |rasgfr3 |rasgrf3 | Rab相互作用因子 | - | HPRD，Biogrid | 10094488 |
| timp2 | CSC-21K | TIMP金属肽酶抑制剂2 | TIMP2与itga3（alpha3）相互作用。 | 绑定 | 12887919 |
| TSPAN4 | nag-2 |nag2 |四翼|TM4SF7 |TSPAN-4 | 四翼烷蛋白4 | - | HPRD，Biogrid | 9360996|10734060 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| kegg焦点粘附 | 201 | 138 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KEGG ECM受体相互作用 | 84 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KEGG造血细胞谱系 | 88 | 60 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 肌动蛋白细胞骨架的KEGG调节 | 216 | 144 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 癌症中的KEGG途径 | 328 | 259 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 小细胞肺癌 | 84 | 67 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KEGG肥厚性心肌病HCM | 85 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KEGG心律失常右心肌病ARVC | 76 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KEGG扩张心肌病 | 92 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ST整合素信号通路 | 82 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID Integin1途径 | 66 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID整合素CS途径 | 26 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID ARF6贩运途径 | 49 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| pid reelin途径 | 29 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID CXCR4途径 | 102 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| pid upa upar途径 | 42 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID IL23途径 | 37 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID Delta NP63途径 | 47 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID TAP63途径 | 54 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组细胞表面相互作用在血管壁 | 91 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome Basigin相互作用 | 30 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome整合素细胞表面相互作用 | 79 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组止血 | 466 | 331 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Corre多发性骨髓瘤 | 74 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 乳腺癌腔与基础DN | 455 | 304 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Rodrigues NTN1靶向DN | 158 | 102 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ENK UV响应表皮增强 | 293 | 179 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 甲状腺癌 | 443 | 294 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 王·巴雷特（Wang Barretts）食道 | 51 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PAX3 FOXO1融合DN的Begum目标 | 45 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mahadevan GIST形态开关 | 15 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gruetzmann胰腺癌 | 358 | 245 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nuytten Nipp1靶向DN | 848 | 527 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Colin Pilocytic星形胶质细胞瘤与胶质母细胞瘤UP | 35 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nikolsky乳腺癌17q21 Q25 Amplicon | 335 | 181 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| tarte浆细胞与Plasmablast向上 | 398 | 262 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sansom APC目标DN | 366 | 238 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 康（Kang）因tert而永生 | 89 | 61 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Cromer转移DN | 81 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sesto对UV C8的反应 | 72 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Hendricks Smarca4靶向 | 56 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Chiba对TSA的反应 | 52 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Browne HCMV感染14小时DN | 298 | 200 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Browne HCMV感染20小时DN | 101 | 70 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 伊万诺娃造血干细胞 | 254 | 164 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Browne HCMV感染48小时DN | 504 | 323 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Browne HCMV感染8小时DN | 47 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Verrecchia对TGFB1 C1的反应 | 19 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Verrecchia对TGFB1的早期反应 | 58 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bandres对Carmustin没有MGMT 48小时DN的响应 | 32 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 贝尔德糖尿病性肾病DN | 434 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bandres对Carmustin Mgmt 48hr DN的响应 | 161 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 在肿瘤血管生成期间沉默的Hellebrekers | 80 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| GU PDEF目标 | 71 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Aguirre胰腺癌复制号 | 298 | 174 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Han Satb1靶向 | 395 | 249 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MILI假足趋化性DN | 457 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 米利假足型haptotaxis dn | 668 | 419 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Poola侵入性乳腺癌DN | 134 | 83 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 具有H3K4ME2和H3K27ME3的Meissner NPC HCP | 349 | 234 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Fournier腺泡开发2 | 277 | 172 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen NPC HCP，带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 210 | 148 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 中村脂肪形成早期DN | 38 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 中村脂肪形成晚期DN | 38 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sasson对促性腺营养蛋白DN的反应 | 87 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sasson对Forskolin DN的反应 | 88 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Browne HCMV感染2小时DN | 49 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Johnstone Parvb目标3 | 430 | 288 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| pasini suz12靶向DN | 315 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Vandesluis Commd1目标3 | 89 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BMI1和PCGF2的Wiederschain目标 | 57 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| FEVR CTNNB1靶向 | 682 | 433 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Smad2或Smad3的Koinuma目标 | 824 | 528 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Katsanou Elavl1靶向 | 169 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ERBB2同工型的Pedersen转移7 | 403 | 240 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Krieg缺氧不是通过KDM3A | 770 | 480 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Fortschegger PHF8靶向DN | 784 | 464 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 寄养KDM1A靶向DN | 211 | 119 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| rao由SALL4同工型B绑定 | 517 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-124/506 | 1160 | 1166 | M8 | HSA-MIR-506 | uaaggcacccuucugugaguaga |
| HSA-MIR-124脑 | UAAGGCACGCGGUGAAUGCC | ||||
| mir-181 | 883 | 890 | 1A，M8 | HSA-MIR-181A脑 | aacauucaacgcugucggugagu |
| HSA-MIR-181BSZ | aacauucauugcugucggggg | ||||
| HSA-MIR-181C脑 | aacauucaaccugucggugagu | ||||
| HSA-MIR-181D脑 | aacauucauuguugucggggguggguu | ||||
| mir-24 | 410 | 416 | 1a | HSA-MIR-24SZ | uggcucucagagcaggaagag |
| mir-381 | 1169 | 1175 | 1a | HSA-MIR-381 | uauacaagggcaagcucucugu |