基因页：itga9

概括？
基因 3680
象征 itga9
同义词 alpha-rlc | itga4l | rlc
描述 整合素亚基Alpha 9
参考 MIM：603963|HGNC：HGNC：6145|HPRD：04910|
基因类型 蛋白质编码
地图位置 3P21.3
Pascal P值 0.001
主持人 小脑

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR：0.006

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
IGSF8 0.85 0.84
神经 0.83 0.82
NACC1 0.83 0.83
Zer1 0.83 0.82
TFE3 0.83 0.83
SH3BP1 0.82 0.82
BAP1 0.82 0.81
CDH22 0.82 0.84
SLC25A22 0.82 0.82
cry2 0.82 0.83
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
FAM159B -0.50 -0.64
AF347015.21 -0.49 -0.27
NSBP1 -0.48 -0.44
AC011475.1 -0.48 -0.50
ifi44 -0.48 -0.58
GNG11 -0.48 -0.37
AL050337.1 -0.47 -0.42
KCNMB3 -0.46 -0.41
AC005921.3 -0.45 -0.48
RP9P -0.44 -0.48

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0004872 受体活性 IEA -
去：0005509 钙离子结合 IEA -
去：0005515 蛋白质结合 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0007155 细胞粘附 塔斯 8245132
去：0007229 整联蛋白介导的信号通路 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0016020 膜 IEA -
GO：0016021 膜不可或缺 IEA -
去：0008305 整联蛋白复合物 塔斯 8245132

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
kegg焦点粘附 201 138 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG ECM受体相互作用 84 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg细胞粘附分子凸轮 134 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肌动蛋白细胞骨架的KEGG调节 216 144 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG肥厚性心肌病HCM 85 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG心律失常右心肌病ARVC 76 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG扩张心肌病 92 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ST整合素信号通路 82 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID Integin1途径 66 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID整合素CS途径 26 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID ARF6贩运途径 49 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID整合素A9B1途径 25 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID CXCR4途径 102 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome发育生物学 396 292 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome整合素细胞表面相互作用 79 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Axon指导 251 188 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome L1CAM相互作用 86 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
L1反应组信号转导 34 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Piccaluga血管免疫细胞淋巴瘤 205 140 该途径中的所有SZGR 2.0基因
刘前列腺癌DN 481 290 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NUP98 HOXA9 Fusion 16d DN的Takeda目标 143 83 该途径中的所有SZGR 2.0基因
周的炎症反应fima 544 308 该途径中的所有SZGR 2.0基因
周炎性反应lps up 431 237 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Jaatinen造血干细胞向上 316 190 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌 443 294 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Perez TP53目标 1174 695 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martoriati MDM4靶向神经上皮 176 111 该途径中的所有SZGR 2.0基因
里克曼转移 344 180 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sakai肿瘤浸润单核细胞 27 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
叶转移性肝癌 27 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Petrova内皮淋巴vs血液 131 87 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Affar YY1目标 214 133 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NPM1定位DN的Alcalay AML 184 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI TCF21目标2 DN 830 547 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血干细胞 254 164 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kaab心脏中心与心室DN 261 183 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由Foxp3绑定的Marson未刺激 1229 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马丁内斯RB1靶向 673 430 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez TP53靶向 602 364 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez RB1和TP53靶向 601 369 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 1069 729 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hoshida肝癌生存 73 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bruins通过TP53组A的UVC响应 898 516 该途径中的所有SZGR 2.0基因
rao由SALL4同工型B绑定 517 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BOSCO TH1细胞毒性模块 114 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Roessler肝癌转移 107 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
林乳腺干细胞向上 489 314 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-125/351 281 287 M8 HSA-MIR-125B脑 ucccugagacccuaacuuguga
HSA-MIR-125A脑 ucccugagacccuuaaccugug
mir-132/212 292 298 1a HSA-MIR-212SZ uaacagucuccagucacgccc
HSA-MIR-132脑 uaacagucuacccaugggg
mir-148/152 402 408 1a HSA-MIR-148A ucagugcacuacaacuuugu
HSA-MIR-152脑 UCAGUGCAUGACACUUGGG
HSA-MIR-148B ucagugcaucacacaacuuugu
mir-331 283 289 1a HSA-MIR-331脑 gccccugggccuauccuagaa
mir-380-5p 274 280 M8 HSA-MIR-380-5p ugguugaccauagaacaugcgc
HSA-MIR-563 agguugacauacguuccc