基因页：ITGAV

概括?
基因ID 3685
Symbol ITGAV
同义词 CD51 | MSK8 | VNRA | VTNR
描述 integrin subunit alpha V
参考 MIM：193210|HGNC:HGNC:6150|Ensembl:ENSG00000138448|HPRD：01903|Vega:OTTHUMG00000132635
基因type protein-coding
地图位置 2q31-q32
Pascal P值 0.474
Fetal beta -0.802
DMG 1（＃研究）
eGene Meta

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 Info
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 Genome-wide DNA methylation analysis This dataset includes 4641 differentially methylated probes corresponding to 2929 unique genes between schizophrenia patients (n=24) and controls (n=24). 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 Chromosome Position 最近的基因 P (dis) beta（dis） FDR (dis) Study
cg21878934 2 187464581 ITGAV 3.365E-4 -0.409 0.041 DMG:Wockner_2014


Section II. Transcriptome annotation

基因ral gene expression (GTEx)

无法使用

基因expression during devlopment (BrainCloud)

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

基因expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

Top co-expressed genes in brain regions

Top 10 positively co-expressed genes
基因 皮尔逊的相关性 Spearman's Correlation
GPR124 0.68 0.68
ATP8B2 0.68 0.67
Arhgef15 0.67 0.65
FAM160B2 0.66 0.67
SMG5 0.66 0.66
SLC9A3 0.66 0.67
ARAP1 0.65 0.73
LRCH4 0.65 0.68
OSBPL7 0.65 0.66
RNF213 0.64 0.66
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 Spearman's Correlation
UQCRB -0.52 -0.53
ATP5J -0.51 -0.54
USMG5 -0.49 -0.61
LYPLAL1 -0.47 -0.47
MRPS28 -0.46 -0.51
NDUFB5 -0.45 -0.48
C14orf2 -0.45 -0.56
TMEM126A -0.45 -0.46
C8orf59 -0.44 -0.43
C18orf32 -0.44 -0.53

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

Interactors Aliases B Official full name B Experimental 资源 PubMed ID
ANGPTL3 ANGPT5 血管生成素状3 - HPRD 11877390
AUP1 - ancient ubiquitous protein 1 - HPRD，Biogrid 12042322
AZGP1 ZA2G | ZAG alpha-2-glycoprotein 1, zinc-binding - HPRD 9813179
CD47 IAP |mer6 |OA3 CD47分子 - HPRD 10545994
CYR61 CCN1 |Gig1 |IGFBP10 富含半胱氨酸的血管生成诱导剂，61 - HPRD，Biogrid 11287419
F2R CF2R | HTR | PAR1 | TR 凝结因子II（凝血酶）受体 - HPRD 11278329
ICAM4 CD242 |LW 细胞间粘附分子4（Landsteiner-Wiener血型） - HPRD 11435317
ITGB1 CD29 | FNRB | GPIIA | MDF2 | MSK12 | VLA-BETA | VLAB 整合素，β1（纤连蛋白受体，β多肽，抗原CD29包括MDF2，MSK12） Integrin-alphaV interacts with Integrin-beta1 BIND 1690718|2138612
ITGB3 CD61 |gp3a |GPIIIA integrin, beta 3 (platelet glycoprotein IIIa, antigen CD61) Integrin-alphaV interacts with Integrin-beta3. BIND 1693624|2138612
ITGB3 CD61 |gp3a |GPIIIA integrin, beta 3 (platelet glycoprotein IIIa, antigen CD61) - HPRD，Biogrid 11884718
ITGB5 FLJ26658 integrin, beta 5 Integrin-alphaV interacts with integrin-beta5. BIND 1694173
ITGB5 FLJ26658 integrin, beta 5 ITGAV (alphaV) interacts with ITGB5 (beta5). BIND 12459484
ITGB5 FLJ26658 integrin, beta 5 - HPRD，Biogrid 7689573
ITGB6 - integrin, beta 6 整联蛋白-Alphav与整联蛋白-BETA6相互作用。 BIND 8798654
ITGB6 - integrin, beta 6 - HPRD 1532572
ITGB8 - integrin, beta 8 Integrin-alphaV interacts with Integrin-beta8. BIND 1918072
ITGB8 - integrin, beta 8 - HPRD 1918072
L1CAM CAML1 |CD171 |HSAS |HSAS1 |Masa |麦克风5 |n-caml1 |S10 |SPG1 L1细胞粘附molecule - HPRD，Biogrid 10871287
MMP2 CLG4 | CLG4A | MMP-II | MONA | TBE-1 基质金属肽酶2（明胶酶A，72KDA明胶酶，72KDA IV型胶原酶） - HPRD，Biogrid 11134507
十一月 CCN3 |IGFBP9 nephroblastoma overexpressed gene Reconstituted Complex BioGRID 12902636
P2RY2 HP2U |MGC20088 |MGC40010 |P2RU1 |P2U |P2U1 |p2ur |P2Y2 |P2Y2R purinergic receptor P2Y, G-protein coupled, 2 - HPRD，Biogrid 11331301
PAK4 - p21 protein (Cdc42/Rac)-activated kinase 4 - HPRD，Biogrid 12356872
PDGFRA CD140A | MGC74795 | PDGFR2 | Rhe-PDGFRA 血小板衍生的生长因子受体，α多肽 - HPRD 11953315
PTK2 Fadk |fak |fak1 |pp125fak PTK2蛋白酪氨酸激酶2 - HPRD 11927607
SPP1 BNSP |BSPI |ETA-1 |MGC110940 |OPN secreted phosphoprotein 1 - HPRD 10835423
TGFB1 CED | DPD1 | TGFB | TGFbeta 转化生长因子，β1 - HPRD 11970960
THBS1 thbs |TSP |TSP1 血小板传播1 Alpha-V-beta3 interacts with TS-1. This interaction was modeled on a demonstrated interaction between pig alpha-V-beta3 and human TS-1. BIND 15700281


V.途径注释

Pathway name Pathway size ＃szgr 2.0基因 Info
KEGG FOCAL ADHESION 201 138 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG ECM RECEPTOR INTERACTION 84 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG CELL ADHESION MOLECULES CAMS 134 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG REGULATION OF ACTIN CYTOSKELETON 216 144 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG PATHWAYS IN CANCER 328 259 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG SMALL CELL LUNG CANCER 84 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG肥厚性心肌病HCM 85 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG ARRHYTHMOGENIC RIGHT VENTRICULAR CARDIOMYOPATHY ARVC 76 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG DILATED CARDIOMYOPATHY 92 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA EDG1 PATHWAY 27 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID INTEGRIN1 PATHWAY 66 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID INTEGRIN CS PATHWAY 26 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID INTEGRIN3 PATHWAY 43 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID S1P S1P3 PATHWAY 29 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID AVB3 OPN途径 31 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID ARF6贩运途径 49 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID NECTIN PATHWAY 30 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID S1P S1P1途径 21 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID CXCR4途径 102 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID AVB3整合素途径 75 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
pid upa upar途径 42 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID PDGFRB PATHWAY 129 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID PDGFRA PATHWAY 22 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID整合素5途径 17 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID VEGFR1 2 PATHWAY 69 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID FAK PATHWAY 59 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome发育生物学 396 292 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME ANTIGEN PROCESSING CROSS PRESENTATION 76 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME CELL SURFACE INTERACTIONS AT THE VASCULAR WALL 91 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome PECAM1相互作用 10 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME INTEGRIN CELL SURFACE INTERACTIONS 79 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME AXON GUIDANCE 251 188 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome L1CAM相互作用 86 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
L1反应组信号转导 34 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME HEMOSTASIS 466 331 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome免疫系统 933 616 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME ADAPTIVE IMMUNE SYSTEM 539 350 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME CLASS I MHC MEDIATED ANTIGEN PROCESSING PRESENTATION 251 156 该途径中的所有SZGR 2.0基因
渡边直肠癌放射疗法反应性DN 92 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sengupta鼻咽癌 294 178 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHARAFE BREAST CANCER LUMINAL VS MESENCHYMAL DN 460 312 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Borczuk恶性间皮瘤 305 185 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MULLIGHAN MLL SIGNATURE 1 DN 242 165 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MULLIGHAN MLL SIGNATURE 2 DN 281 186 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DODD NASOPHARYNGEAL CARCINOMA DN 1375 806 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV RESPONSE EPIDERMIS DN 508 354 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HAMAI APOPTOSIS VIA TRAIL UP 584 356 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MCBRYAN PUBERTAL TGFB1 TARGETS UP 169 127 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Seiden满足信号 19 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WOOD EBV EBNA1 TARGETS UP 110 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Li Wilms肿瘤与胎儿肾脏2 DN 51 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KHETCHOUMIAN TRIM24 TARGETS UP 47 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RANKIN ANGIOGENIC TARGETS OF VHL HIF2A DN 8 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GEORGES TARGETS OF MIR192 AND MIR215 893 528 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MORI LARGE PRE BII LYMPHOCYTE DN 58 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
尼尔森对雄激素的反应 86 61 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SANA TNF SIGNALING UP 83 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SWEET KRAS TARGETS UP 84 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans 882 572 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NGUYEN NOTCH1 TARGETS UP 29 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Petrova内皮淋巴与血液DN 162 102 该途径中的所有SZGR 2.0基因
牙肺纹状横纹肌肉瘤DN 408 274 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张增殖与静止 51 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LU AGING BRAIN UP 262 186 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BURTON ADIPOGENESIS 8 86 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chiba对TSA DN的响应 23 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BAELDE DIABETIC NEPHROPATHY DN 434 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YIH RESPONSE TO ARSENITE C3 36 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KRIGE RESPONSE TO TOSEDOSTAT 6HR UP 953 554 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat的反应24小时 783 442 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gavin Foxp3目标集群T4 94 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由Foxp3绑定的Marson未刺激 1229 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
促进耐受巨噬细胞DN 409 268 该途径中的所有SZGR 2.0基因
AMUNDSON POOR SURVIVAL AFTER GAMMA RADIATION 8G 95 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
AMUNDSON POOR SURVIVAL AFTER GAMMA RADIATION 2G 171 96 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARTINEZ RB1 TARGETS UP 673 430 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez RB1靶向DN 543 317 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARTINEZ TP53 TARGETS UP 602 364 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARTINEZ RB1 AND TP53 TARGETS UP 601 369 该途径中的所有SZGR 2.0基因
de yy1靶向DN 92 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ACEVEDO NORMAL TISSUE ADJACENT TO LIVER TUMOR UP 174 96 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝癌 973 570 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ACEVEDO LIVER TUMOR VS NORMAL ADJACENT TISSUE UP 863 514 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LU TUMOR ANGIOGENESIS UP 25 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Alonso转移EMT 36 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ALONSO METASTASIS UP 198 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
VART KSHV INFECTION ANGIOGENIC MARKERS UP 165 118 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LINDSTEDT DENDRITIC CELL MATURATION D 68 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
卡波西肝癌遇到了 18 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yagi AML与11q23重新排列 351 238 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARSON FOXP3目标 66 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NAKAMURA ADIPOGENESIS EARLY DN 38 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
中村脂肪形成晚期DN 38 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dutertre雌二醇反应24小时DN 505 328 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FIGUEROA AML METHYLATION CLUSTER 4 UP 112 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
figueroa aml甲基化簇6 140 81 该途径中的所有SZGR 2.0基因
figueroa aml甲基化簇7 118 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PASINI SUZ12 TARGETS DN 315 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KOINUMA TARGETS OF SMAD2 OR SMAD3 824 528 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PHONG TNF RESPONSE VIA P38 PARTIAL 160 106 该途径中的所有SZGR 2.0基因